Thụng qua tổ chức bộ mỏy, Nhà Nước quản lý hoạt động di dõn. Hệ thống tổ chức bộ mỏy Nhà Nước với đặc trưng là quyền lực cụng, biểu hiện ở những tỏc động cú ý thức vào quỏ trỡnh phỏt triển của xó hội, vào nhận thức của con người, buộc mọi người phải suy nghĩ và hành động theo định hướng và mục tiờu đó được xỏc định. Việc quản lý của Nhà Nước về hoạt động di dõn như trờn được thể hiện thụng qua cỏc cơ quan cú thẩm quyền theo thứ bậc quản lý hành chớnh, từ Chớnh phủ, cỏc Bộ... đến chớnh quyền và cỏc cơ quan
chuyờn ngành cỏc cấp. Hệ thống tổ chức của bộ mỏy Nhà Nước thực hiện quản lý vĩ mụ việc phõn bố lao động dõn cư, lực lượng sản xuất trờn phạm vi cả nước... hỡnh thành cỏc chớnh sỏch và tổ chức hướng dẫn, kiểm tra, giỏm sỏt việc thực hiện chớnh sỏch. Nhà Nước cú vai trũ tạo hành lang phỏp lý và tổ chức thực hiện quản lý Nhà Nước về hoạt động di dõn thụng qua hệ thống tổ chức bộ mỏy Nhà Nước.
Về hệ thống quản lý ngành cục Kinh tế hợp tỏc và Phỏt triển nụng thụn thuộc bộ Nụng nghiệp và Phỏt triển nụng thụn ở Trung ương, cỏc chi cục Phỏt triển nụng thụn (thuộc sở Nụng nghiệp và Phỏt triển nụng thụn) ở cỏc tỉnh, thành phố trực thuộc trung ương thực hiện chức năng quản lý Nhà Nước về di dõn phỏt triển vựng tỏi định cư tại địa phương. Chớnh quyền tỉnh, thành phố thuộc trung ương chỉ đạo chi cục (thụng qua sở Nụng nghiệp và Phỏt triển nụng thụn) thực hiện di dõn theo địa bàn của địa phương. Cỏc cơ quan thẩm quyền với chức năng nhiệm vụ cú trỏch nhiệm, quyền hạn được giao quản lý theo từng lĩnh vực của hoạt động di dõn xõy dựng cỏc vựng tỏi định cư. Thụng qua hệ thống tổ chức này Chớnh phủ sẽ kiểm tra, giam sỏt được cỏc hoạt động di dõn diễn ra trờn toàn quốc.
- Xõy dựng chiến lược, quy hoạch, kế hoạch 5 năm và hàng năm, cỏc chương trỡnh, dự ỏn, về lĩnh phõn bố lao động, dõn cư, định canh, định cư và phỏt triển vựng kinh tế mới và tổ chức chỉ đạo thực hiện sau khi được cấp cú thẩm quyền phờ duyệt. Tham gia, phối hợp với cỏc cơ quan, tổ chức trong việc xõy dựng và thực hiện những chương trỡnh, dự ỏn liờn quan đến cụng tỏc phõn bố lao động, dõn cư, định canh, định cư và phỏt triển vựng tỏi định cư.
- Tổ chức chỉ đạo, hướng dẫn, kiểm tra, và tuyờn truyền vận động việc thực hiện chủ trương chớnh sỏch, phỏp luật về cụng tỏc phõn bố lao động, dõn cư, định canh, định cử và phỏt triển vựng tỏi đinh cư.
- Quản lý và tham gia quản lý cỏc nguồn vốn ngõn sỏch và cỏc nguồn vốn khỏc dành cho sự nghiệp phõn bố lao động, dõn cư, định canh, định cư và phỏt triển vựng kinh tế mới theo quy định của Chớnh phủ.
- Tổ chức việc đào tạo bồi dưỡng kỹ thuật nghiệp vụ cho cỏn bộ viờn chức trong ngành. Quản lý tổ chức, biờn chế, tài sản được giao đỳng theo quy định của Nhà nước.