* Về bộ máy kế toán:
Mặc dù có sự phân định rõ ràng công việc và trách nhiệm cho từng nhân viên nhưng bộ máy kế toán của công ty chưa có thủ quỹ. Mọi hoạt động liên quan đến thu hoặc xuất tiền mặt đều do kế toán trưởng đảm nhận. Các nhân viên kế toán bộ phận khi thu hoặc chi tiền đều tự viết phiếu thu, phiếu chi gửi cho kế toán trưởng xem xét và chấp nhận. Điều này làm khối lượng công việc của kế toán trưởng tăng lên, phiếu thu và phiếu chi do nhiều người giữ nên có thể mất mát trong quá trình lưu chuyển. Ngoài ra, trừ kế toán trưởng có nhiều kinh nghiệm thì những nhân viên kế toán còn lại đều là những người trẻ tuổi, ít kinh nghiệm nên việc xử lý số liệu còn chậm và mắc nhiều sai sót.
* Về tổ chức hạch toán ban đầu:
Sử dụng hình thức Chứng từ ghi sổ để ghi sổ kế toán song doanh nghiệp lại không sử dụng sổ đăng ký chứng từ ghi sổ, điều này gây khó khăn cho kế toán trong quá trình đối chiếu kiểm tra số liệu kế toán khi vào bảng cân đối số phát sinh.
Hệ thống chứng từ và vận dụng chứng từ tại công ty luôn được thực hiện theo đúng quy đinh, song việc luân chuyển chứng từ giữa các phòng ban và bộ phận còn chậm làm ảnh hưởng đến việc xử lý và phản ánh các nghiệp vụ kinh tế phát sinh.
* Về sổ kế toán:
Tại công ty, sổ kế toán chi tiết doanh thu bán hàng và cung cấp dịch vụ bao gồm sổ chi tiết doanh thu đồ ăn, sổ chi tiết doanh thu đồ uống và sổ chi tiết doanh thu tiệc. Việc mở sổ như vậy làm phức tạp thêm trong việc theo dõi doanh thu bán hàng và cung câp dịch vụ vủa doanh nghiệp. Cụ thể là việc theo dõi riêng doanh thu từ đồ uống và doanh thu từ đồ ăn trong quá trình cung cấp cho khách vãng lai là không cần thiết. Doanh thu từ tiệc cũng bao gồm doanh thu từ đồ ăn và doanh thu từ đồ uống. Nếu chỉ theo dõi riêng doanh thu đồ ăn và doanh thu đồ uống cungg câp cho khách vãng lai mà không theo dõi riêng doanh thu đồ ăn và doanh thu đồ uống từ dịch vụ tiệc là không thỏa đáng. Hơn nữa, việc theo dõi riêng doanh thu như vậy làm cho kế toán gặp khó khăn trong quá trình phân tách doanh thu từ đồ ăn và doanh thu từ đồ uống. Thay bằng việc theo dõi riêng doanh thu như vậy thì công ty chỉ cần theo dõi doanh thu a-la-cac (doanh thu từ việc cung cấp dịch vụ cho khách vãng lai) và doanh thu tiệc.
* Về trích lập các khoản dự phòng:
Công ty không trích lập các khoản dự phòng phải thu khó đòi. Với các hoạt động tổ chức sự kiện, tiệc cưới thì số tiền mà doanh nghiệp cung ứng dịch vụ cho khách hàng thường là lớn vì thế khách hàng không thể trả ngay số tiền đó được hoặc với những khách hàng quen thuộc thường xuyên đến ăn và không thanh toán tiền ngay làm cho công ty có một khoản công nợ phải thu khá lớn. Việc không tiến hành trích lập dự phòng phải thu khó đòi khiến công ty không thể lường trước được các tổn thất. Do đó, khi có rủi ro xảy ra thì công ty khó có thể xử lý kịp thời gây ảnh hưởng tới hoạt động kinh doanh.
* Về kế toán quản trị:
Công tác kế toán quản trị tại công ty TNHH Nhất Ly còn chưa được chú trọng. Trong khi các thông tin kế toán tài chính là các thông tin quá khứ thi thông tin kế toán quản trị lại mang tính chất tương lai. Việc xác định kết quả kinh doanh không những giúp các nhà quản trị nắm bắt được tình hình sản xuất kinh doanh của đơn vị mà còn dùng để ra các quyết định và phương hướng kinh doanh trong tương lai. Do đó kế toán quản trị đóng một vai trò quan trọng trong việc cung cấp thông tin kế toán cho nhà quản trị. Việc chưa chú trọng vào hoạt động của kế toán quản trị tại công ty làm cho việc định hướng phát triển của doanh nghiệp gặp nhiều khó khăn.