Thông thường, việc áp dụng phương pháp 6 này chính là vận dụng linh hoạt các phương pháp sẵn có (phương pháp 1 đến phương pháp 5).
Việc vận dụng linh hoạt được hiểu là mở rộng một số điều kiện áp dụng phương pháp phù hợp để xác định trị giá tính thuế.
Cách thức vận dụng linh hoạt như sau:
Vận dụng phương pháp 1
Nếu giao dịch không có hợp đồng mua bán nhưng được thỏa thuận thông qua các thư tín thương mại hợp pháp, thể hiện được các điều kiện giao dịch cơ bản (đối tượng mua bán, số lượng, giá cả, quy cách, phương thức giao nhận hàng,…) thì sử dụng phương pháp trị giá giao dịch.
Nếu người mua không có đủ quyền định đoạt, sử dụng hàng hóa do điều kiện từ phía người bán, nhưng những điều kiện đó không làm ảnh hưởng đến trị giá của hàng hóa thì vẫn xác định trị giá theo trị giá giao dịch.
Vận dụng phương pháp 2 và 3
Nếu không có hàng hóa nhập khẩu giống hệt hoặc hàng hóa nhập khẩu tương tự được xuất khẩu đến Việt Nam trong vòng 60 ngày trước hoặc 60 ngày sau ngày xuất khẩu của lô hàng nhập khẩu đang được xác định trị giá tính thuế thì lựa chọn những hàng hóa nhập khẩu giống hệt hoặc hàng hóa nhập khẩu tương tự được xuất khẩu trong khoảng thời gian dài hơn, nhưng không quá 90 ngày trước hoặc 90 ngày sau ngày xuất khẩu của lô hàng đang được xác định trị giá tính thuế.
Nếu không có hàng hóa nhập khẩu giống hệt hoặc hàng hóa nhập khẩu tương tự có cùng xuất xứ thì lựa chọn hàng hóa nhập khẩu không cùng xuất xứ nhưng vẫn thỏa mãn các điều kiện khác về hàng hóa nhập khẩu giống hệt, hàng hóa nhập khẩu tương tự.
Vận dụng phương pháp 4
Trong vòng 90 ngày, kể từ ngày nhập khẩu mà không xác định được đơn giá dùng để khấu trừ thì lựa chọn đơn giá được bán ra với số lượng lớn nhất trong vòng 120 ngày kể từ ngày nhập khẩu của lô hàng được lựa chọn để khấu trừ.
Nếu không có đơn giá bán lại của chính hàng hóa nhập khẩu hoặc hàng hóa nhập khẩu giống hệt, hàng hóa nhập khẩu tương tự cho người không có quan hệ đặc biệt với người nhập khẩu thì lựa chọn đơn giá bán lại hàng hóa cho người mua
có quan hệ đặc biệt, với điều kiện mối quan hệ đặc biệt không ảnh hưởng đến giá cả trong giao dịch mua bán.
Vận dụng phương pháp 2 kết hợp phương pháp 4 hoặc 5
Trị giá tính thuế của hàng hóa nhập khẩu được xác định bằng trị giá tính thuế của hàng hóa nhập khẩu giống hệt mà trị giá đó đã được xác định theo phương pháp trị giá khấu trừ, hoặc phương pháp trị giá tính toán.
Vận dụng phương pháp 3 kết hợp phương pháp 4 hoặc 5
Trị giá tính thuế của hàng hóa nhập khẩu được xác định bằng trị giá tính thuế của hàng hóa nhập khẩu tương tự mà trị giá đó đã được xác định theo phương pháp trị giá khấu trừ, hoặc phương pháp trị giá tính toán.