Séc là một hình thức thanh toán được chính phủ và ngân hàng nhà nước quan tâm thúc đẩy việc sử dụng trong TTKDTM. Nhìn chung thì những thay đổi về nội dung, hình thức và các quy định về séc đã có nhiều cải tiến góp phần tạo thuận lợi cho người sử dụng. Tuy vậy, so với tiêu chuẩn quốc tế và yêu cầu của nền kinh tế thị trường ở nước ta hiện nay thì hình thức thanh toán séc vẫn còn rất chậm tiến bộ. Do vậy với quy chế về séc, cần thay đổi để có thể thật sự phát huy tác dụng.
+ Về séc chuyển khoản: Với nhược điểm dễ phát hành quá số dư mặc dù đó là điều cấm trong chế độ thanh toán, nhưng nhiều trường hợp người phát hành séc không cố ý, hoặc số tiền để thanh toán chưa về kịp ngày hôm đó hay có khoản chi đột xuất... chỉ một vài ngày sau là số tiền của họ về đủ, dẫn tới người bán chậm thu được tiền hàng mà người mua lại bị phạt gây thiêt hại lớn và từ đó làm cho thể thức này ít được sử dụng trong thanh toán. Hơn nữa, số tiền vượt quá số dư có thể rất nhỏ so với tổng số tiền thanh toán nên việc chậm trễ do phải chờ đủ tiền trên tài khoản của người thanh toán sẽ gây thiệt hại cho người thụ hưởng. Để khắc phục nhược điểm này, chi nhánh nên cho phép khách hàng có thể dư nợ hay phát hành séc quá số dư theo lãi suất nợ ngắn hạn, thời điểm tính lãi kể từ khi chi nhánh thực hiện thanh toán số tiền quá số dư cho bên thụ hưởng.
Đây thực chất là một loại cho vay chỉ áp dụng đối với khách hàng có khả năng tài chính tốt, nguồn thu ổn định và có uy tín trong quan hệ thanh toán. Khách hàng muốn sử dụng nghiệp vụ này, làm đơn gửi tới chi nhánh đề nghị chi nhánh cho vay thanh toán trường hợp đột xuất thiếu số dư. Chi nhánh sẽ kiểm tra, thẩm định kỹ lưỡng về khả năng và điều kiện của khách hàng, từ đó chi nhánh sẽ quyết định có cho vay hay không.
Nghiệp vụ này đã được áp dụng thành công ở nhiều nước trên thế giới, nhưng ở nước ta nghiệp vụ này hầu như chưa được áp dụng. Khi áp dụng cho vay
thanh toán séc chuyển khoản được sử dụng tốt sẽ tạo điều kiện thúc đẩy hoạt động TTKDTM phát triển và mở rộng. Hơn nữa, áp dụng nghiệp vụ này sẽ làm tăng uy tín cho bên mua hàng thanh toán tiền hàng hoá thuận lợi kịp thời. Khi khách hàng phát hành séc quá số dư, họ phải trả lãi suất cao nhưng còn dễ chịu hơn nhiều so với việc phát hành quá số dư và phạt chậm trả.
+ Về séc bảo chi: do khoản kí quỹ không được sử dụng cũng như không được sinh lời gây thiệt hại cho khách hàng. Để khắc phục sự mất cân đối này, chi nhánh nên trã lãi khoản tiền lưu ký vào tài khoản tiền gửi thanh toán séc bảo chi, để giảm thiệt thòi cho khách hàng khi có một khoản tiền bị lưu ký không sinh lời và thủ tục sử dụng séc bảo chi nói chung cần đơn giản hoá.