CHƯƠNG 2 : NỘI DUNG CƠ BẢN CỦA PHÁP LUẬT VIỆT NAM VỀ MIỄN
2.1.2. Hồ sơ miễn thuế, trình tự thủ tục thực hiện
Vì từng trường hợp miễn thuế nhập khẩu được quy định gắn với điều kiện khác nhau, pháp luật quy định hồ sơ miễn thuế và trình tự thủ tục thực hiện cho từng trường hợp miễn thuế khác nhau. Tuy nhiên, nhìn chung có ba nhóm quy định cụ thể sau đây:
a) Đối với trường hợp hàng nhập khẩu để gia công xuất khẩu37
Cơ quan Hải quan giải quyết miễn thuế trên cơ sở kiểm tra báo cáo thanh khoản hợp đồng gia công của doanh nghiệp nhận gia cơng. Trình tự thủ tục thực hiện được tóm tắt như sau:
Trước khi nhập khẩu, đơn vị nhận gia công đăng ký hợp đồng gia công xuất khẩu, định mức nguyên vật liệu tiêu hao khi gia cơng sản phẩm, máy móc thiết bị nhập khẩu để thực hiện gia công. Cơ quan Hải quan tiến hành kiểm tra, hồ sơ phù hợp thì tiếp nhận và theo dõi việc thực hợp đồng gia công.
Sau khi nhập khẩu hàng hóa, thực hiện hợp đồng gia công, xuất khẩu sản phẩm gia công, doanh nghiệp lập hồ sơ thanh khoản hợp đồng gia công nộp cơ quan hải quan đề nghị xác nhận số lượng nguyên vật liệu doanh nghiệp đã sử dụng để gia công sản phẩm xuất khẩu và phương án giải quyết nguyên vật liệu cịn dư thừa, máy móc thiết bị đã nhập khẩu để gia cơng (nếu có). Cơ quan Hải quan kiểm tra hồ sơ nếu phù hợp thì xác nhận hồ sơ thanh khoản, nếu phát hiện vi phạm thì xử lý theo quy định38.
b) Đối với hàng hóa tạm nhập tái xuất, tạm xuất tái nhập39
Cơ quan Hải quan giải quyết miễn thuế trên cơ sở kiểm tra báo cáo thanh khoản hàng tạm nhập tái xuất, tạm xuất tái nhập.Trình tự thủ tục thực hiện được tóm tắt như sau:
Trước khi nhập khẩu doanh nghiệp đăng ký với cơ quan Hải quan danh mục hàng hóa tạm nhập tái xuất, tạm xuất tái nhập và đăng ký thời hạn tái xuất hoặc tái nhập. Cơ quan Hải quan kiểm tra hồ sơ phù hợp thì giải quyết cho đăng ký tờ khai hải quan để xuất khẩu, nhập khẩu hàng hóa và mở sổ theo dõi việc thực hiện tái xuất hoặc tái nhập hàng hóa theo thời hạn đăng ký.
Khi làm thủ tục tái nhập hoặc tái xuất hàng hóa, doanh nghiệp nộp kèm hồ sơ hải quan bản theo dõi hàng hóa tái nhập hoặc tái xuất để cơ quan Hải quan xác nhận. Sau khi tái nhập hoặc tái xuất hàng hóa doanh nghiệp nộp cho cơ quan Hải quan báo cáo thanh khoản hàng hóa tạm nhập tái xuất hoặc tạm xuất tái nhập để được cơ quan Hải quan kiểm tra, xác nhận miễn thuế, nếu phát hiện vi phạm thì xử lý theo quy định40.
37
Miễn thuế theo quy định tại khoản 4 Điều 16 Luật thuế xuất khẩu, thuế nhập khẩu 2005. 38
Trình tự chi tiết thực hiện theo quy định tại mục II Thông tư 116/2008/TT-BTC ngày 04/12/2008 của Bộ Tài chính hướng dẫn thủ tục Hải quan đối với hàng hóa gia cơng với thương nhân nước ngoài.
39
Miễn thuế theo quy định tại khoản 1, Điều 16 Luật thuế xuất khẩu, thuế nhập khẩu 2005 và khoản 18 Điều 16 Nghị định 149/2005/NĐ-CP.
2.1.2.2. Trường hợp đăng ký danh mục miễn thuế
a) Đối với một số trường hợp miễn thuế nhập khẩu theo quy định phải đăng ký danh mục hàng hóa nhập khẩu miễn thuế41:
Cơ quan Hải quan giải quyết miễn thuế trên cơ sở kiểm tra hàng hóa nhập khẩu thực tế so với danh mục hàng hóa doanh nghiệp đã đăng ký miễn thuế nhập khẩu với cơ quan Hải quan trước khi làm thủ tục nhập khẩu, so với quyết toán việc sử dụng hàng hóa đã được miễn thuế theo danh mục hàng hóa nhập khẩu đã đăng ký.
Quy trình thủ tục áp dụng đối với các trường hợp miễn thuế như trên được thực hiện theo các bước chính như sau:
- Trước khi nhập khẩu, doanh nghiệp đăng ký với cơ quan Hải quan danh mục hàng hóa nhập khẩu miễn thuế.
- Cơ quan Hải quan kiểm tra hồ sơ, nếu thấy hợp lệ thì tiếp nhận danh mục. Sau khi xác định thực tế hàng hóa nhập khẩu đúng danh mục đã đăng ký và được duyệt thì thực hiện miễn thuế nhập khẩu đối với hàng hóa nhập khẩu trên cho doanh nghiệp, nếu phát hiện vi phạm thì xử lý theo quy định42.
b) Đối với một số trường hợp miễn thuế nhập khẩu theo quy định phải quyết tốn việc sử dụng hàng hóa đã được miễn thuế theo danh mục hàng hóa nhập khẩu đã đăng ký43
Cơ quan Hải quan nơi đăng ký danh mục hàng hóa nhập khẩu miễn thuế có trách nhiệm chủ trì, phối hợp với Cục Thuế địa phương kiểm tra việc nhập khẩu, sử dụng hàng hóa và quyết tốn việc sử dụng số ngun vật liệu được miễn thuế nhập khẩu đưa vào sản xuất của doanh nghiệp và thu thuế, xử phạt đối với các trường hợp không thực hiện đúng quy định về báo cáo quyết tốn và/hoặc sử dụng khơng đúng mục đích hàng hóa đã được miễn thuế44.
Các trường hợp miễn thuế nhập khẩu chỉ được quy định thống nhất tại Luật Thuế xuất khẩu, thuế nhập khẩu 2005. Vì thế, trình tự, thủ tục và thẩm quyền giải quyết miễn thuế nhập khẩu cũng sửa đổi theo hướng thuận lợi, thống nhất hơn so với trước đây. Cụ thể: trước khi ban hành Luật Thuế xuất khẩu, thuế nhập khẩu 2005, một số trường hợp miễn thuế nhập khẩu còn được quy định tại Luật Đầu tư nước ngồi, Luật Khoa học và cơng nghệ, Luật Dầu khí … Cơ quan cấp phép đầu tư, cấp phép kinh doanh sẽ cấp giấy phép nhập khẩu hàng hóa miễn thuế nhập khẩu thỏa
41
Đó là 11 trường hợp được quy định tại khoản 1 Điều 101 Thông tư 79/2009/TT-BTC ngày 20/4/2009. 42
Trình tự chi tiết thực hiện theo quy định tại Điều 101,102 Thông tư 79/2009/TT-BTC ngày 20/4/2009. 43
Đó là các trường hợp quy định tại điểm a khoản 3 Điều 103 Thông tư 79/2009/TT-BTC ngày 20/4/2009. 44
điều kiện pháp luật quy định miễn thuế cho các doanh nghiệp có vốn đầu tư nước ngoài, doanh nghiệp hoạt động nghiên cứu khoa học và phát triển công nghệ, hoạt động dầu khí. Trên cơ sở các giấy phép đó, cơ quan Hải quan giải quyết thủ tục nhập khẩu hàng miễn thuế. Hiện nay, doanh nghiệp không phải xin giấy phép nhập khẩu hàng hóa miễn thuế nhập khẩu định kỳ hàng năm hoặc đột xuất tại các cơ quan được Bộ Thương mại (nay là Bộ Công thương) ủy quyền mà doanh nghiệp trực tiếp tự kê khai đăng ký danh mục hàng hóa nhập khẩu miễn thuế tại cơ quan Hải quan nơi doanh nghiệp thực hiện dự án đầu tư.
2.1.2.3. Các trường hợp còn lại
Riêng trường hợp đối tượng nộp thuế do nguyên nhân khách quan và trường miễn thuế nhập khẩu khác quy định tại khoản 20 Điều 16 Nghị định 149/2005/NĐ- CP thì hồ sơ miễn thuế phải có thêm văn bản xác nhận của Ủy ban nhân dân tỉnh, thành phố hoặc của Bộ, cơ quan ngang Bộ về lý do khách quan đề nghị được miễn thuế nhập khẩu45.
Đối với các trường hợp miễn thuế còn lại: cơ quan Hải quan giải quyết miễn thuế cho hàng hóa miễn thuế theo tờ khai hải quan nhập khẩu cụ thể sau khi xác định thực tế hàng hóa nhập khẩu phù hợp với khai báo trên tờ khai hải quan.