Lúa là cây trồng có phản ứng tốt với phân hóa học nên bón phân hóa học cho lúa cho hiệu quả cao. Trong thâm canh lúa, bón phân hữu cơ chủ yếu nhằm ổn định hàm lượng mùn trong đất, tạo nền thâm canh nên có thể sử dụng các loại phân hữu cơ khác nhau, kể cả rơm rạ lúa sau khi thu hoạch.
Các loại phân đạm thích hợp cho lúa là phân đạm amon, ure. Ure đang trở thành dạng phân đạm phổ biến đối với lúa nước vì có tỷ lệ đạm cao, lại rất thích hợp để bón trên các loại đất thối hóa. Phân đạm Nitrat có thể dùng để bón thúc ở thời kỳ địng, đặc biệt hiệu quả khi bón trên đất chua mặn.
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – ĐHTN http://www.lrc-tnu.edu.vn
Đất chua trồng lúa, bón phân lân nung chảy thường cho kết quả ngang phân supe lân hay có thể cao hơn trong điều kiện ngập nước cung dễ cung cấp cho lúa mà ít bị rửa trơi và cịn cung cấp cả silic là yếu tố dinh dưỡng có nhu cầu cao ở cây lúa. Tuy nhiên nếu cần bón thúc lân và trồng lúa trên đất nghèo lưu huỳnh (đất bạc màu bón ít phân hữu cơ) thì phải dùng supe lân.
Loại phân kali thích hợp bón cho lúa là kaliclorua. Ngồi ra, cịn thường dùng các loại phân NPK, đặc biệt tốt là loại phân chuyên dùng cho lúa, phù hợp với điều kiện của từng vùng đất trồng.
Khả năng chịu chua của cây lúa khá, nhưng ở đất quá chua, cây lúa sinh trưởng kém, có thể do nhơm hịa tan gây ra vì hiện tượng ngộ độc nhơm ít thấy trên các loại đất có pH trên 5,5. Mặt khác, sau khi đưa nước vào ruộng đất có thể bị chú hơn, nên bón vơi là biện pháp quan trọng ở đất lúa nước quá chua và việc bón vơi phải được kết hợp với một chế độ bón phân hợp lý thì mới thu được kết quả mong muốn nhất.