KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN
4.1 Phân lập và đặc điểm khuẩn lạc của các dòng vi khuẩn 4.1.1 Phân lập vi khuẩn 4.1.1 Phân lập vi khuẩn
Bảng 7: Nguồn gốc của các dòng vi khuẩn phân lập trên môi trƣờng Pseudomonas Isolation agar.
STT Vi khuẩn Nguồn gốc mẫu
1 AG 1a Mỹ Luông-An Giang
2 AG 1b Mỹ Luông-An Giang
3 AG 1c Mỹ Luông-An Giang
4 AG 2c Chợ Mới -An Giang
5 AG 2b’ Chơ Mới-An Giang
6 AG 2a Chợ Mới-An Giang 7 AG 2b Chợ Mới-An Giang 8 AG 3a Mỹ Luông-An Giang 9 AG 4c Mỹ Luông-An Giang 10 CT 1c TP. Cần Thơ 11 CT 2a TP. Cần Thơ 12 CT 2b TP. Cần Thơ 13 CT 2c TP. Cần Thơ 14 ĐT 1a Lấp Vò-Đồng Tháp 15 ĐT 1b Lấp Vò-Đồng Tháp 16 ĐT 1d Lấp Vò-Đồng Tháp 17 ĐT 1f Lấp Vò-Đồng Tháp 18 ĐT 2g Cao Lãnh-Đồng Tháp 19 ĐT 2e Cao Lãnh-Đồng Tháp 20 ĐT 2d Cao Lãnh-Đồng Tháp 21 VL 1b Tam Bình-Vĩnh Long 22 VL 1c Tam Bình-Vĩnh Long 23 VL 1e Tam Bình-Vĩnh Long 24 VL 3a Tân Lƣợc-Vĩnh Long 25 VL 3b Tân Lƣợc-Vĩnh Long 26 VL 4c Tân Lƣợc-Vĩnh Long 27 VL 4b Tân Lƣợc-Vĩnh Long 28 VL 4d Tân Lƣợc-Vĩnh Long
Vi khuẩn ở vùng rễ rất phong phú và đa dạng về hình thái, màu sắc và hình dạng khuẩn lạc. Qua q trình phân lập và tách rịng vi khuẩn từ các mẫu đất vùng rễ thu tại các tỉnh An Giang, Đồng Tháp, Cần Thơ, Vĩnh Long trên môi trƣờng Pseudomonas isolation agar đặc đã thu đƣợc 28 dòng vi khuẩn khác nhau đƣợc trình bày ở bảng 7
4.1.2 Đặc điểm của khuẩn lạc và tế bào vi khuẩn (a) Đặc điểm của khuẩn lạc (a) Đặc điểm của khuẩn lạc
- Màu sắc khuẩn lạc: Đa số các dịng có màu trắng trong hoặc trắng đục. Trong tổng số các dòng phân lập, 15/28 dòng tạo khuẩn lạc màu trắng đục chiếm tỉ lệ 53,58% và 13/28 dịng có khuẩn lạc màu trắng trong chiếm tỉ lệ 46,42%.
- Hình dạng khuẩn lạc: Phần lớn các khuẩn lạc thu đƣợc đều có dạng hình trịn, một số có dạng khơng đều. Trong số 28 dịng phân lập đƣợc thì có 15/28 dịng có dạng khuẩn lạc trịn chiếm tỉ lệ 53,57% và 13/28 dịng có dạng khuẩn lạc khơng đều chiếm tỉ lệ 46,43% .
- Độ nổi khuẩn lạc: trong số 28 dịng đã phân lập thì dịng vi khuẩn có độ nổi lài chiếm đa số với 24/28 dòng, chiếm tỉ lệ 85,71%, cịn lại 4 dịng là khuẩn lạc có độ nổi mô chiếm tỉ lệ 14,29%.
- Dạng bìa khuẩn lạc: Hầu hết các dòng vi khuẩn phân lập đƣợc đều có khuẩn lạc dạng bìa răng cƣa, một số ít có dạng bìa ngun và dạng bìa xẻ thùy. Số lƣợng cụ thể là 21/28 dịng vi khuẩn có khuẩn lạc bìa dạng răng cƣa chiếm tỉ lệ 75%, 6/28 dòng vi khuẩn có bìa dạng ngun chiếm tỉ lệ 21,42%, cịn lại một dịng có dạng bìa xẻ thùy.
- Kích thƣớc khuẩn lạc: Phần lớn các dòng vi khuẩn đã phân lập đƣợc có đƣờng kính khuẩn lạc dao động từ 1-2 mm sau khi cấy trên môi trƣờng đặc, ủ ở 300
C trong 24 giờ. Đặc biệt, ở cùng điều kiện ủ nhƣng đƣờng kính khuẩn lạc của dịng vi khuẩn ĐT 2e có kính thƣớc đến 3,8 mm.
Bảng 8: Đặc điểm khuẩn lạc và tế bào khuẩn lạc đã phân lập
Số TT
Vi khuẩn
Đặc điểm vi khuẩn Đặc điểm khuẩn lạc Hình dạng Chuyển
động Màu sắc Hình dạng Dạng bìa Độ nổi
ĐK (mm) 1 AG 1a Que ngắn + + Trắng trong Không đều Răng cƣa Lài 1,5 2 AG 1b Que ngắn + + Trắng đục Tròn đều Răng cƣa Lài 1 3 AG 1c Que ngắn + + Trắng trong Không đều Răng cƣa Lài 1 4 AG 2a Que ngắn + Trắng trong Không đều Răng cƣa Lài 1,5 5 AG 2b Que ngắn + + + Trắng đục Trịn đều Ngun Mơ 1,5 6 AG 2c Que ngắn + + Trắng đục Tròn đều Nguyên Lài 1,5 7 AG 2b’ Que ngắn + + + Trắng trong Không đều Răng cƣa Lài 3 8 AG 4a Que ngắn + + Trắng trong Không đều Răng cƣa Mô 1 9 AG 4c Que ngắn + + + Trắng đục Tròn đều Nguyên Lài 1 10 CT 1c Que ngắn + Trắng đục Tròn đều Răng cƣa Lài 1 11 CT 2a Que ngắn + + Trắng đục Không đều Nguyên Lài 1 12 CT 2b Que ngắn + + + Trắng đục Tròn đều Răng cƣa Lài 1 13 CT 2c Que ngắn + + Trắng trong Không đều Răng cƣa Lài 2 14 ĐT 1a Que ngắn + + Trắng đục Không đều Răng cƣa Lài 1 15 ĐT 1b Que ngắn + + + Trắng trong Không đều Răng cƣa Lài 1,5 16 ĐT 1d Que ngắn + + Trắng đục Không đều Răng cƣa Lài 2 17 ĐT 1f Que ngắn + + + Trắng đục Tròn đều Răng cƣa Lài 1 18 ĐT 2g Que ngắn + + Trắng trong Không đều Răng cƣa Lài 2 19 ĐT 2e Que ngắn + + Trắng trong Tròn đều Răng cƣa Lài 3,8 20 ĐT 2d Que ngắn + + + Trắng trong Không đều Xẻ thùy Lài 2 21 VL 1b Que ngắn + + Trắng trong Không đều Nguyên Lài 1 22 VL 1c Que ngắn + + + Trắng trong Tròn đều Răng cƣa Lài 1 23 VL 1e Que ngắn + + Trắng đục Tròn đều Nguyên Mô 1,5 24 VL 3a Que ngắn + Trắng đục Tròn đều Răng cƣa Lài 1 25 VL 3b Que ngắn + + Trắng đục Tròn đều Răng cƣa Lài 1,5 26 VL 4c Que ngắn + + + Trắng đục Tròn đều Răng cƣa Lài 1,5 27 VL 4b Que ngắn + + + Trắng trong Không đều Răng cƣa Lài 2 28 VL 4d Que ngắn + + + Trắng đục Tròn đều Răng cƣa Mô 1,5
(+) chuyển động chậm: vi khuẩn chuyển động yếu.
(+ +) chuyển động nhanh: vi khuẩn chuyển động trung bình. (+ + +) chuyển động rất nhanh: vi khuẩn chuyển liên tục.
Hình 8: Hình dạng một số khuẩn lạc trên mơi trƣờng Pseudomonas Isolation agar
(A) Khuẩn lạc có màu trắng đục, khơng đều, độ nổi lài, bìa răng cưa (AG 2c) (B) Khuẩn lạc có màu trắng đục, khơng đều, độ nổi lài, bìa răng cưa (ĐT 1b) (C) Khuẩn lạc có màu trắng đục, khơng đều, độ nổi mơ, bìa răng cưa (ĐT 2g) (D) Khuẩn lạc có màu trắng đục, dạng trịn, độ nổi mơ, bìa ngun (CT 2a)
(b) Đặc điểm của tế bào vi khuẩn
Hình thái và sự chuyển động của vi khuẩn đƣợc kiểm tra bằng phƣơng pháp giọt ép, dƣới kính hiển vi quang học với độ phóng đại 400 lần, 28 dịng vi khuẩn phân lập đƣợc có đặc điểm nhƣ sau
28 dịng vi khuẩn đều có dạng hình que ngắn.
Tất cả các dòng vi khuẩn dòng phân lập đƣợc đều có khả năng chuyển động với nhiều tốc độ khác nhau. Cụ thể trong tổng số 28 dịng thì có 14 dịng chuyển động nhanh, 11 dòng chuyển động rất nhanh, cịn lại 3 dịng thì chuyển động chậm.
4.2 Khảo sát khả năng tổng hợp indole-3-acetic acid (IAA)
4.2.1 Đo hàm lƣợng IAA theo phƣơng pháp Salkowski (Patten và Glick, 1996) ở
bƣớc sóng 530nm
A B
A
Bảng 9: Khả năng tổng hợp IAA của các dòng vi khuẩn vùng rễ đƣợc phân lập trên mơi trƣờng Pseudomonas agar (mg/lít)
TT Dịng vi khuẩn Ngày 2 Ngày 4 Ngày 6 Ngày 8
1 AG 1a 0,45 d 0,17 d 0,77 d 1,63 c 2 AG 1b 1,07 b 1,46 ab 1,63 a 2,75 ab 3 AG 1c 0,52 d 1,13 b 1,27 b 2,61 b 4 AG 2c 1,02 b 1,32 b 1,63 a 2,99 a 5 AG 2b’ 0,18 e 0,34 ed 0,60 d 0,54 e 6 AG 2a 1,12 b 1,62 a 1,77 a 3,18 a 7 AG 2b 0,62 d 0,96 bc 1,42 b 2,39 b 8 AG 3a 0,83 bc 1,10 bc 1,10 c 1,67 c 9 AG 4c 1,02 b 0,84 c 1,42 b 1,56 cd 10 CT 1c 0,63 d 0,41 d 0,91 cd 1,27 d 11 CT 2a 1,20 a 1,75 a 1,80 a 3,27 a 12 CT 2b 0,97 c 0,60 d 0,98 c 1,67 c 13 CT 2c 0,48 d 1,22 b 1,22 bc 2,57 b 14 ĐT 1a 0,93 c 1,27 b 1,22 bc 3,01 a 15 ĐT 1b 0,58 d 0,31 ed 0,96 c 2,25 b 16 ĐT 1d 0,87 c 1,56 a 1,44 ab 2,97 a 17 ĐT 1f 0,87 c 0,53 d 0,94 cd 1,27 d 18 ĐT 2g 0,80 c 1,44 ab 0,96 c 2,68 ab 19 ĐT 2e 0,68 d 1,46 ab 1,44 ab 3,08 a 20 ĐT 2d 0,82 c 0,79 cd 0,86 cd 1,20 d 21 VL 1b 0,82 c 1,34 b 1,32 b 1,99 bc 22 VL 1c 0,67 d 0,84 c 1,32 b 2,65 ab 23 VL 1e 0,98 b 0,43 d 0,55 d 0,69 e 24 VL 3a 1,07 b 1,01 bc 1,46 ab 3,08 a 25 VL 3b 1,37 a 1,13 b 1,54 ab 1,81 c 26 VL 4c 0,87 c 0,89 c 1,10 c 2,07 bc 27 VL 4b 0,72 d 0,93 bc 1,32 b 2,79 ab 28 VL 4d 0,75 cd 1,10 bc 1,15 c 2,32 b %CV 9,77 8,71 7,23 6,87
- Tất cả 28/28 dòng vi khuẩn vùng rễ đã đƣợc nhận diện, nuôi trong môi trƣờng lỏng King B trên máy lắc với tốc độ 120 vòng/phút. Lấy mẫu vào các thời điểm 2, 4, 6 và 8 ngày sau khi nuôi đem ly tâm với tốc độ 12000 vòng/phút trong 5 phút. Lấy dịch trong sau khi ly tâm trộn với thuốc thử R2 để đo theo phƣơng pháp của Salkowski. Qua phản ứng màu cho thấy lƣợng IAA đƣợc vi khuẩn tổng hợp phản ứng với thuốc thử R2 cho màu hồng đậm hay nhạt tùy vào lƣợng IAA nhiều hay ít. Qua kiểm định thì tất cả 28 dịng vi khuẩn này đều có khả năng tổng hợp IAA với kết quả thống kê cụ thể ở bảng 9.
- Các dòng vi khuẩn đƣợc nuôi trong môi trƣờng King B: Đa số các dòng vi khuẩn tổng hợp IAA tăng dần theo thời gian và lƣợng IAA đƣợc tổng hợp cao nhất vào ngày thứ 8 sau khi nuôi. Trong số 28 dịng vi khuẩn đƣợc ni trong mơi trƣờng này thì dòng AG 2a và CT 2a có khả năng tổng hợp IAA cao nhất, sản xuất đƣợc 3,18 mg/L IAA và 3,27 mg/L IAA sau 8 ngày nuôi và khác biệt có ý nghĩa thống kê so với các dòng còn lại đƣợc trình bày ở bảng 9. Các dịng AG 1b, AG 2c, ĐT 1a, ĐT 1d, ĐT 2e, VL 3a cũng có khả năng tổng hợp IAA khá cao.
4.2.2 Đo hàm lƣợng các chất kích thích tố tăng trƣởng bằng phƣơng pháp sắc ký lỏng Mẫu vi khuẩn có hàm lƣợng IAA cao là AG 2a và CT 2a đƣợc đo lại bằng Mẫu vi khuẩn có hàm lƣợng IAA cao là AG 2a và CT 2a đƣợc đo lại bằng phƣơng pháp săc ký (Kelen et al., 2004) chỉ tiêu GA kết quả đƣợc thể hiện theo bảng 10.
Bảng 10: Khả năng tổng hợp kích thích tố tăng trƣởng của 2 dòng vi khuẩn AG 2a và CT 2a đƣợc đo bằng phƣơng pháp sắc ký vào thời điểm 8 ngày sau khi ni (mg/lít)
TT TÊN MẪU PHƢƠNG
PHÁP THỬ KẾT QUẢ THỬ NGHIỆM GA (mg/lít) 1 AG 2a M.Kelen et al., 2004 550,24 2 CT 2a 419,40
Dựa vào kết quả trên cho thấy các dịng vi khuẩn tạo ra kích thích tố tăng trƣởng acid giberrelic (GA3) đạt 550,24 mg/lít ở dịng AG 2a và 419 mg/lít ở dịng CT 2a sau khi nuôi trong môi trƣờng King B sau 8 ngày ở 30oC trong điều kiện tối. Kết quả này
tƣơng tự với nghiên cứu của KARAKO (2005), Pseudomonas sp. ủ ở pH là 7 ở nhiệt độ 30oC sau thời gian 72 giờ nuôi tổng hợp đƣợc 285,06 mg/lít GA3.
4.3 Sinh trắc trên đĩa petri
Hai dòng AG 2a và CT 2a đƣợc sử dụng để đánh giá khả năng ảnh hƣởng của gibberellin lên sự phát triển của rễ, kết quả đƣợc trình bày ở bảng 11.
Bảng 11: Hiệu quả của vi khuẩn tổng hợp kích thích tố tăng trƣởng lên chiều dài và số lƣợng rễ của cây lúa
Tên mẫu Dịch vi khuẩn AG 2a CT 2a Chiều dài rễ (cm) Số lƣợng rễ Chiều dài rễ (cm) Số lƣợng rễ 0,5 ml 11 3 8 4 1 ml 6,5 4 10 4 1,5 ml 3,5 7 6 4 Đối chứng 1,5 3
.
Hình 9: Chiều dài rễ và số lƣợng rễ của cây lúa sau 5 ngày thí nghiệm
1: Chủng dịch AG 2a 0,5 ml 2: Chủng dịch AG 2a 1 ml
3: Chủng dịch AG 2a 1,5 ml 4: Đối chứng
5: Chủng dịch vi khuẩn CT 2a 0,5 ml 6: Chủng dịch vi khuẩn CT 2a 1 ml 7: Chủng dịch vi khuẩn CT 2a 1,5 ml
Dựa vào bảng 11 và hình 9 cho thấy rằng, ở các nghiệm thức cây lúa đƣợc chủng các dòng vi khuẩn AG 2a và CT 2a với nồng độ khác nhau cho số lƣợng rễ, chiều dài rễ và lông rễ nhiều hơn và khác biệt với nghiệm thức đối chứng (không chủng dịch vi khuẩn). Ở liều lƣợng 1,5 ml dung dịch chứa AG 2a cho số lƣợng rễ
Đối chứng 1 2 3 4 5 6 7
nhiều nhất là 7, còn dòng CT 2a cho số lƣợng rễ là 4. Tất cả các nghiệm thức đều có số lƣợng lơng hút nhiều hơn nghiệm thức đối chứng.
Kết quả sinh trắc trong ống nghiệm phù hợp với nghiên cứu của Bottini (2002), gibberellin thúc đẩy sự phát triển của rễ, gia tăng số lƣợng rễ và lông hút của các loài cây (Bottini và Luna, 1993; Fulchieri et al., 1993; Reinoso et al., 2002; Tanimoto, 1987). Nó kết hợp với các kích thích tố sinh trƣởng khác thúc đẩy các q trình tích hợp khác trong cây (Trewavas, 2000).
Qua kết quả nghiên cứu của Rekha et al., 2006 cho thấy, khi có sự hiện diện P.
putida CCFR2-4 thúc đẩy quá trình phát triển của cây tốt hơn so với không chủng. Bằng chứng là sau 7 ngày ủ với dòng vi khuẩn này, nó làm gia số lƣợng tăng rễ và chiều dài rễ 248% so với không chủng (đối chứng).
4.4. Kết quả điện di dòng vi khuẩn AG 2a và CT 2a
Tiến hành ly trích DNA và thực hiện phản ứng PCR của 2 dòng vi khuẩn đƣợc chọn AG 2a và CT 2a với cặp mồi 8F và 1492R. Kết quả điện di sản phẩm PCR cho thấy cả 2 dịng có băng 1500 bp đƣợc minh họa ở hình 10
0
Hình 10: Phổ điện di của sản phẩm PCR đƣợc nhân lên từ DNA của các dòng vi khuẩn AG 2a và CT 2a
Thang chuẩn 100bp plus (0), AG 2a (1) và CT 2a (2) 4.5 Nhận diện dòng vi khuẩn bằng phƣơng pháp giải trình tự DNA
Kết quả giải trình tự của đoạn DNA 16s-rRNA ở các dòng vi khuẩn nhƣ sau Trình tự đoạn DNA của dòng AG 2a
Đoạn DNA cuả dịng AG 2a có tổng số nucleotide đƣợc giải là 1226 bp có tỉ lệ đồng hình 99% với trình tự DNA của HQ143572 Pseudomonas sp. dòng YT3 16s
rRNA
1 2
Bảng 12: Kết quả giải trình tự của dịng AG 2a
GCT AGCGCGCT ACACAT GCAGT CGAGCGGAT GACGGGAGCT T GCT CCT TGATTCAGCGGCGGACGGGT GAGT AAT GCCT AGG AAT CT GCCTGGT AGTGGGGGACAACGT T TCGAAAGGAACGCT AATACCGCATACGTCCTACGGGAGAAAGCAGGGGACCT T C GGGCCT T GCGCT AT CAGAT GAGCCTAGGT CGGATTAGCTAGTTGGT GGGGT AATGGCT CACCAAGGCGACGAT CCGT AACTG GT CT GAGAGGAT GAT CAGTCACACTGGAACTGAGACACGGT CCAGACT CCTACGGGAGGCAGCAGT GGGGAAT AT T GGACA AT GGGCGAAAGCCT GAT CCAGCCAT GCCGCGT GT GT GAAGAAGGT CTTCGGATTGTAAAGCACTTTAAGTTGGGAGGAAGGG CAGT AAGCT AATACCTTGCTGTTTTGACGTTACCGACAGAATAAGCACCGGCT AACTCTGTGCCAGCAGCCGCGGT AAT ACAG AGGGT GCAAGCGT T AAT CGGAATTACTGGGCGT AAAGCGCGCGT AGGT GGT T CGT TAAGTTGGATGT GAAAGCCCCGGGCT C AACCT GGGAACT GCAT CCAAAACTGGCGAGCT AGAGT ACGGT AGAGGGGT GGT GGAAT TTCCTGTGTAGCGGT GAAATGCGT AGAT AT AGGAAGGAACACCAGT GGCGAAGGCGACCACCT GGACT GAT ACT GACACTGAGGT GCGAAAGCGT GGGGAGCAAA CAGGAT T AGAT ACCCTGGT AGTCCACGCCGT AAACGATGT CAACTAGCCGTTGGAAT CCTTGAGATTTTAGT GGCGCAGCT AA CGCAT T AAGTTGACCGCCT GGGGAGT ACGGCCGCAAGGT T AAAACTCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGT GGA GCAT GT GGT TTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCT TACCAGGCCT TGACATGCAGAGAACTTTCCAGAGAT GGATTGGT GCC T T CGGGAACT CTGACACAGGT GCTGCATGGCT GT CGTCAGCTCGTGT CGTGAGATGTTGGGT TAAGTCCCGT AACGAGCGCAA CCCT T GT CCTTAGTTACCAGCACGTTATGGT GGGCACT CTAAGGAGACT GCCGGT GACAAACCGGAGGAAAGAGT GGGGGAT AAACT CCAAGT CATCATGGCCCT ACGGCCT GGGCT ACACACCTGCT ACAAAGGT CGGT ACAGAGGGT T GCCAAACCCC
Dùng chƣơng trình BLAST so sánh trình tự đoạn DNA của dòng AG 2a với trình tự DNA của bộ gen ở các loài vi khuẩn có trong ngân hàng gen (NCBI). Kết quả cụ thể nhƣ sau :
Hình 11: Tỷ lệ tƣơng đồng trình tự DNA của AG 2a với trình tự HQ143572
Trình tự đoạn DNA của dòng CT 2a
Đoạn DNA cuả dịng CT 2a có tổng số nucleotide đƣợc giải là 1146 bp có tỉ lệ đồng hình 99% với trình tự DNA của FJ897848 Pseudomonas putida dòng AKM-P7
16s rRNA
Bảng 13: Kết quả giải trình tự của dịng CT 2a
ACT AGCGCGCT ACACAT GCAGT CGAGCGGAT GACGGGAGCT T GCT CCTTGAT T CAGCGGCGGACGGGT GAGT AAT GCCT AGG AAT CT GCCTGGT AGTGGGGGACAACGT T TCGAAAGGAACGCT AATACCGCATACGTCCT ACGGGAGAAAGCAGGGGACCT T C GGGCCT T GCGCT AT CAGAT GAGCCTAGGT CGGATTAGCTAGTT GGT GGGGT AAT GGCT CACCAAGGCGACGAT CCGT AACT G GT CT GAGAGGAT GAT CAGT CACACT GGAACT GAGACACGGT CCAGACT CCT ACGGGAGGCAGCAGT GGGGAAT AT T GGACA AT GGGCGAAAGCCT GAT CCAGCCAT GCCGCGT GT GT GAAGAAGGT CTTCGGATTGTAAAGCACTTT AAGT T GGGAGGAAGGG CAGT AAGCT AATACCTTGCTGTTTTGACGTTACCGACAGAATAAGCACCGGCT AACTCTGTGCCAGCAGCCGCGGT AAT ACAG AGGGT GCAAGCGT T AAT CGGAATTACTGGGCGT AAAGCGCGCGT AGGT GGT T CGT TAAGT T GGAT GT GAAAGCCCCGGGCT C AACCT GGGAACT GCAT CCAAAACTGGCGAGCT AGAGT ACGGT AGAGGGT GGGT GGAAT TTCCTGTGTAGCGGT GAAATGCGT AGAT AT AGGAAGGAACACCAGT GGCGAAGGCGACCACCT GGACT GAT ACT GACACT GAGGT GCGAAAGCGT GGGGAGCAAA CAGGAT T AGAT ACCCTGGT AGTCCACGCCGT AAACGATGT CAACTAGCCGTTGGA AT CCTTGAGATTTTAGT GGCGCAGCT AA CGCAT T AAGT T GACCGCCT GGGGAGT ACGGCCGCAAGGT T AAAACT CAAAT GAAT T GACGGGGGCCCGCACAAGCGGT GGA GCAT GT GGT TTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCT TACCAGGCCT TGACATGCAGAGAACTTT CCAGAGAT GGAT T GGT GCC T T CGGGAACT CTGACACAGGT GCTGCATGGCT GT CGTCAGCTCGTGT CGTGAGATGTTGGGT TAA GTCCCGT AACGAGCGCAA CCCT T GT CCT T AGT T ACCAGCACGT T AT GGT GGGCACT CT AAGGGAACT GCCGGT GACAAACCGGAGGAAAGGGGGGGGA
Dùng chƣơng trình BLAST so sánh trình tự đoạn DNA của dòng CT 2a với trình tự DNA của bộ gen ở các lồi vi khuẩn có trong ngân hàng gen (NCBI). Kết quả cụ thể nhƣ sau
Hình 12: Tỷ lệ tƣơng đồng trình tự DNA của CT 2a với trình tự FJ897848
4.6 Đánh giá hiệu quả dòng vi khuẩn tổng hợp kích thích tố tăng trƣởng (AG 2a và CT 2a) kết hợp với phân vi sinh (DASVILA) và phân hữu cơ – vi sinh (DASVILA++
) trên cây lúa OM 6976 trồng tại Viện Lúa Đồng Bằng Sông Cửu Long, Tp. Cần Thơ (Đông Xuân 2011).
4.6.1 Hiệu quả của vi khuẩn AG 2a và CT 2a kết hợp với phân vi sinh và phân hữu cơ – vi sinh đến thành phần năng suất giống lúa cao sản OM 6976.