đàn VN là đàn cú nguồn gốc tự nhiờn. 3.2. Sai khỏc di truyền
Trong nghiờn cứu này, sự sai khỏc di truyền giữa cỏc đàn cỏ chộp được ước lượng theo giỏ trị FST. Kết quả phõn tớch sự sai khỏc di truyền của 7 đàn cỏ khi so sỏnh từng cặp với nhau được trỡnh bày ở bảng 4.
Kết quả ở bảng 4 cho thấy sự sai khỏc di truyền của 7 đàn cỏ khi so sỏnh từng cặp với nhau xột trờn cả 2 gen COI và D-loop phần lớn đều là sai khỏc cú ý nghĩa (P<0,05). Khơng cú sự sai khỏc di truyền giữa 3 đàn HV, TAT, SZA trờn cả gen COI và D-loop. Điều này cú thể được giải thớch bởi 3 đàn này đều cú nguồn gốc từ Hungarỵ Trong đú đàn HV là đàn cỏ nhập nội và được tỏi đàn, lưu giữ ở nước ta từ năm 1996 cho đến naỵ Hai đàn TAT và SZA được nhập về nước ta từ năm 2019. Đối với cỏc trường hợp cú sự sai khỏc di truyền lớn, đỏng chỳ ý nhất là sự sai khỏc di truyền xột trờn gen COI giữa đàn SE với tất cả cỏc
đàn cũn lại, đặc biệt là giữa SE và HV, giữa SE và SZA (đều cú FST = 1), SE và TAT (FST = 0,96356). Theo cỏc nhà khoa học, khi FST = 1, thỡ cỏc quần thể là cố định, điều đú cú nghĩa là giữa cỏc quần thể khụng chia sẻ bất kỳ alen nào với nhau, tức là khụng sinh sản với nhau, chỳng hồn tồn bị cơ lập với nhaụ Việc FST trong nghiờn cứu này cú giỏ trị bằng 1 cú thể được giải thớch là do: (1) Cỏc đàn này bị cụ lập với nhau hoàn toàn trong thời gian dàị Thực tế cho thấy cỏc đàn này cú sự khỏc biệt về nguồn gốc, cú cỏch ly địa lý, cú cỏch quản lý, lưu giữ đàn nghiờm ngặt nờn việc cỏch ly sinh sản hồn tồn cú thể xảy rạ (2) Gen sử dụng trong nghiờn cứu là gen thuộc mtDNA chỉ di truyền theo dũng mẹ. (3) Với một số đàn số lượng cỏ thể giới hạn, việc sinh sản để tỏi đàn trong thời gian dài cú thể làm gia tăng tỷ lệ giao phối cận huyết. (4) Số lượng mẫu phõn tớch cú thể chưa đủ lớn (20 mẫu/đàn) dẫn đến xỏc suất bắt gặp alen giảm.
Bảng 4. Sai khỏc di truyền giữa cỏc đàn cỏ chộp dựa trờn phõn tớch đoạn gen COI và D-loop
Tờn đàn VN V1 HV IN TAT SZA SE VN 0,10759 0,55177 0,18306 0,64502 0,61416 0,14309 V1 0,17266 0,24344 0,16203 0,32819 0,29974 0,14660 HV 0,52722 0,15132 0,68513 0,12341 0,04279 0,60900 IN 0,43078 0,32554 0,76842 0,77525 0,74356 0,16137 TAT 0,49163 0,13876 0,05263 0,72368 0,07018 0,69364 SZA 0,52722 0,15132 0,00000 0,76842 0,05263 0,66725 SE 0,73754 0,60830 1,00000 0,86640 0,96356 1,00000
Ghi chỳ: FST dựa trờn gen COI (phớa dưới đường chộo); FST dựa trờn gen D-loop (phớa trờn đường chộo); Sai khỏc cú ý nghĩa khi P < 0,05; Giỏ trị FST cú ý nghĩa được in đậm; Giỏ trị FST khơng cú ý nghĩa được in nghiờng.
3.3. Cấu trỳc di truyền
Kết quả phõn tớch AMOVA được thể hiện ở bảng 5.
Bảng 5. Phõn tớch phương sai phõn tử (AMOVA) của cỏc đàn cỏ chộp qua phõn tớch trỡnh tự gen COI và D-loop
Gen Nguồn biến động Độ tự do (df) Tổng bỡnh phương (SS) Thành phần biến động Phần trăm biến động FST Giữa cỏc đàn 6 122,394 1,01213 Va 62,79 Trong một đàn 130 77,971 0,59977 Vb 37,21 COI Tổng 136 200,365 1,61190 0,62791** Giữa cỏc đàn 6 278,239 2,22658 Va 44,15 Trong một đàn 130 366,191 2,81686 Vb 55,85 D-loop Tổng 136 644,431 5,04343 0,44148**
Nụng nghiệp và phỏt triển nụng thụn - KỲ 2 - THáNG 5/2021
98
Kết quả phõn tớch AMOVA cho thấy phần trăm biến động giữa cỏc đàn (62,79%) lớn hơn sự biến động trong một đàn (37,21%) trờn gen COI, trong khi trờn gen D-loop thỡ xu hướng ngược lại (44,15% và 55,85%). Kết quả đú chỉ ra rằng cú sự sai khỏc về di truyền giữa cỏc đàn hoặc cỏc cỏ thể được nghiờn cứu, đồng thời cho thấy cỏc đàn cỏ cú cấu trỳc quần thể rừ ràng do sự đúng gúp đỏng kể về khỏc biệt di
truyền giữa cỏc đàn khi xột trờn gen COỊ Giỏ trị FST là 0,62719 (COI), 0,44148 (D-loop) cho thấy sự biến đổi di truyền tổng thể giữa 7 đàn ở mức độ lớn. Theo Zhao và ctv (2020) khi phõn tớch AMOVA dựa trờn gen COII cho cỏc quần thể cỏ chộp cho thấy phần lớn biến dị di truyền là xảy ra trong quần thể (72,71%).
3.4. Mối quan hệ di truyền
Hỡnh 1. Mối quan hệ di truyền (UPGMA) của 7 đàn cỏ chộp xõy dựng dựa trờn gen COI
Hỡnh 2. Mối quan hệ di truyền (UPGMA) của 7 đàn cỏ chộp xõy dựng dựa trờn gen D-loop
Hỡnh 3. Mối quan hệ di truyền (UPGMA) của 7 đàn cỏ chộp xõy dựng dựa trờn gen D-loop khụng bao gồm trỡnh tự NC 001606
Hỡnh 1 cho thấy đàn SE sau đú là đàn IN cú mối quan hệ di truyền xa hơn với cỏc đàn cũn lại cũng như với NC 001606. Nghiờn cứu sự phõn nhỏnh trờn nhỏnh phụ, một lần nữa cho thấy mối quan hệ di
truyền gần gũi của 3 đàn cú nguồn gốc từ Hungary là HV, TAT và SZẠ Đàn chọn giống V1 cũng thuộc nhỏnh này do đú là con lai của cỏ cú nguồn gốc từ Hungarỵ Mối quan hệ gần gũi này được thể hiện