Đề tài áp dụng phương pháp chọn mẫu phi xác suất theo hạn định do điều kiện giới hạn về thời gian và tài chính, và cũng mới chỉ là một nghiên cứu ứng dụng thăm dị. Trên cơ sở bơ máy tổ chức hiện nay của cơ quan thuế tại An Giang bao gồm cục thuế và 10 chi cục thuế, tác giả đã chọn địa bàn nghiên cứu bao gồm cục thuế An Giang và 3 chi cục thuế tại Long Xuyên, Châu Đốc, và Tân Châu để tiến hành khảo sát. Số quan sát tại mỗi địa bàn là 40 doanh nghiệp. Tổng số mẫu dự kiến là 160 mẫu. Tại mỗi địa bàn, có 2 cán bộ của cơ quan thuế được huấn luyện về nội dung và cách thức phỏng vấn. Thời gian tiến hành khảo sát tại 4 khu vực là tháng 8 năm 2016.
Trên cơ sở cán bộ thuế đã biết các doanh nghiệp có đóng thuế thu nhập doanh nghiệp năm 2016, cán bộ phỏng vấn đến các doanh nghiệp để phỏng vấn đại diện của doanh nghiệp là người có liên quan đến nghiệp vụ thuế như khai báo thuế, kế tốn cơng ty. Việc trả lời phỏng vấn là tự nguyện, nếu doanh nghiệp khơng có thiện chí hợp tác, khơng sẳn lịng để hỗ trợ cung cấp các thông tin trong bảng phỏng vấn thì cán bộ thuế sẽ đến một doanh nghiệp khác. Trong trường hợp chấp thuận phỏng vấn, người trả lời sẽ được hướng dẫn cách thức trả lời câu hỏi, và ngày hôm sau cán bộ thuế mới quay trở lại để nhận bảng khảo sát đã được doanh nghiệp đó trả lời. Điều này giúp cho người trả lời có thời gian suy nghĩ và tự quyết định những ý kiến đánh giá, trả lời của mình, giãm bớt áp lực hay thiên vị từ cán bộ phỏng vấn.
Với cách chọn mẫu thuận tiện này, các loại hình doanh nghiệp đã khơng thể có đại diện đầy đủ trong mẫu khảo sát, và cũng do tính chất tự nguyện của doanh nghiệp có sẳn lịng tham gia vào cuộc phỏng vấn hay không.
Sau khi các bảng phỏng vấn đã được thu về, cán bộ phỏng vấn kiểm tra lại mức độ hoàn chỉnh của từng bảng khảo sát. Những trường hợp có q nhiều thơng tin chưa được trả lời, cán bộ qua trở lại doanh nghiệp để tìm hiểu và giải thích thêm vì sao như vậy. Một số doanh nghiệp chưa rõ một vài câu hỏi đã bổ sung.
Bước tiếp theo là số liệu được nhập vào phần mền SPSS 16.0 theo bảng mã hóa cho từng mục hỏi, kiểm tra mức độ hoàn chỉnh các mục hỏi của từng doanh nghiệp, và loại bỏ các quan sát (doanh nghiệp) có số liệu trống (missing data) quá nhiều trên 10 mục khảo sát. Tổng số quan sát sau khi gạn lọc trong quá trình này là 10 quan sát khơng được vào phân tích. Số quan sát sau cùng của mẫu khảo sát là n = 150 được sử dụng là nguồn số liệu sơ cấp chính yếu của đề tài.