* Kiểm tra thuế: Công tác kiểm tra thuế của DN nhằm giám sát hồ sơ khai thuế nhằm chống thất thu thuế, ngăn chặn và xử lý kịp thời những vi phạm về thuế. Cùng với đó là nâng cao tính tự giác tuân thủ pháp luật thuế của DN trong việc thực hiện kê khai thuế, tính thuế và nộp thuế. Công tác kiểm tra thuế của DN được thực hiện tại trụ sở của cơ quan thuế hoặc tại trụ sở của DN.
Tại trụ sở cơ quan thuế bộ phận kiểm tra thuế có trách nhiệm thu thập, khai thác thông tin để kiểm tra hồ sơ, nguồn thông tin được lấy trực tiếp từ hồ sơ khai thuế của DN hoặc gián tiếp qua các cơ quan khác như: ngân hàng, Kho bạc, Kiểm toán, Quản lý thị trường, Công an, Tài nguyên môi trường, Tòa án… Từ những thông tin có được, bộ phận kiểm tra thực hiện kiểm tra sơ bộ tất cả các loại hồ sơ khai thuế để phân tích, đánh giá lựa chọn các cơ sở kinh doanh có rủi ro về thuế để lập danh sách kiểm tra. Bộ phận kiểm tra thực hiện kiểm tra tại trụ sở DN đối với những DN không giải trình được số liệu đã kê khai. Nội dung kiểm tra thuế tại DN chủ yếu là rà soát tính hợp lý, hợp lệ của hóa đơn, chứng từ, tính trung thực trong việc ghi nhận doanh thu, chi phí… có liên quan đến những nghi vấn mà bộ phận kiểm tra đã phân tích hồ sơ kê khai tại trụ sở cơ quan thuế.
Thanh tra thuế: Tương tự như kiểm tra thuế, thanh tra thuế cũng thực hiện các bước công việc, phương pháp làm để xác định rủi ro về thuế của DN làm căn cứ để lập kế hoạch thanh tra năm. Tuy nhiên nguồn dữ liệu mà bộ phận thanh tra thuế sử dụng để phân tích việc xác định, thực hiện nghĩa vụ thuế của doanh nghiệp lại rộng hơn so với kiểm tra thuế. Ngoài các nguồn dữ liệu kiểm tra thuế sử dụng, thanh tra thuế còn sử dụng dữ liệu từ các cơ quan thuộc ngành tài chính như: Hải quan, Thanh tra tài chính, Ủy ban chứng khoán, Cục quản lý giá hoặc các cơ quan
khác có liên quan như: Kiểm toán Nhà nước, Thanh tra Chính phủ, Các bộ, ngành, hiệp hội ngành nghề kinh doanh hoặc thông tin từ đơn tố cáo trốn thuế, gian lận thuế.