Luận văn sử dụng phương pháp luận để nghiên cứu là duy vật biện chứng và duy vật lịch sử.
Phương pháp luận duy vật biện chứng và duy vật lịch sử đòi hỏi việc nghiên cứu chiến lược kinh doanh của Công ty cổ phần vận tải và dịch vụ Petrolimex Nghệ Tĩnh trước hết phải kế thừa được những kết quả nghiên cứu của những người đi trước. Vì vậy, tác giả luận văn đã rất cố gắng trong việc tìm hiểu những tài liệu khoa học viết về chiến lược kinh doanh của các doanh nghiệp cổ phần nhà nước và các cơng trình có liên quan. Trên cơ sở kế thừa các kết quả nghiên cứu, đặt trong điều kiện cụ thể của đề tài, luận văn thiết lập khung khổ lý luận phù hợp để phân tích các vấn đề ở các chương sau.
Sử dụng phương pháp luận duy vật biện chứng và duy vật lịch sử, tác giả luận văn đã xuất phát từ việc nghiên cứu phạm trù cơ bản của đề tài là hoàn thiện chiến lược kinh doanh của doanh nghiệp. Trên cơ sở đó, luận văn tập trung nghiên cứu, làm rõ thực trạng thực thi chiến lược kinh doanh của Công ty cổ phần vận tải và dịch vụ Petrolimex Nghệ Tĩnh, làm rõ việc Công ty đã xây dựng chiến lược kinh doanh như thế nào, nội dung của chiến lược đó là gì, nó được triển khai thực hiện ra sao? từ kết quả này có thể đánh giá ngược lại chiến lược kinh doanh của Cơng ty, đánh giá nó hợp lý, khơng hợp lý, mạnh, yếu ở chỗ nào từ đó đưa ra những kết luận để hoàn thiện chiến lược kinh doanh của Công ty trong thời gian tới.
Phương pháp luận đòi hỏi phải xây dựng khung khổ lý thuyết để nghiên cứu nhưng khung khổ đó cần được kiểm nghiệm bằng thực tiễn. Do đó, luận văn đã nghiên cứu kinh nghiệm của một số doanh nghiệp kinh doanh vận tải
xăng dầu khác trong việc hoàn thiện chiến lược kinh doanh để kiểm nghiệm khung khổ lý thuyết đã được xây dựng; rút ra những bài học cho Công ty cổ phần vận tải và dịch vụ Petrolimex Nghệ Tĩnh.
Phương pháp luận duy vật biện chứng và duy vật lịch sử địi hỏi việc nghiên cứu hồn thiện chiến lược kinh doanh của Công ty cổ phần vận tải và dịch vụ Petrolimex Nghệ Tĩnh không được xuất phát từ tình cảm, nguyện vọng của tác giả, mà phải xuất từ những điều kiện khách quan và chủ quan, do các quy luật khách quan chi phối. Tác giả cố gắng nghiên cứu một cách tồn diện nhưng trong đó hết sức quan tâm đến nhân tố bên trong, những quan hệ bản chất… vì nhân tố này giữ vai trò quyết định.