D. farinae và 3 chủng B tropicalis của Mỹ Ghi chú: Chi tiết cụ thể của các chủng trình bày ở Bảng 3.1; cuối những chủng đã công bố hoặc có trong Ngân hàng gen được gắn thêm sốđăng ký; một
3.3.2.Kết quả giám định gen và định kỳ kiểm tra giống
- Trong các lô DpT1, DpT2, DpT3, DpT4, một lô được sử dụng để giám định phân tử (Lô DpT4), đồng thời các lô khác cũng được giám định với mục đích kiểm nghiệm giống để sản xuất dị nguyên.
- Một lần nữa, lô mạt DpT4 do Viện Tai-Mũi-Họng cung cấp được khẳng định chính xác chỉ chứa loài mạt D. pteronyssinus.
- Do yêu cầu giám định loài để sản xuất dị nguyên, chúng tôi tiến hành giải trình trình tựđoạn gen 12S thu được từ lô mạt DpT1-T2-T3, chuỗi gen 12S được truy cập Ngân hàng gen, kết quả cho thấy mức độ tương đồng về nucleotide đạt 99% với
Hình 3.7. Kết quả truy cập Ngân hàng gen so sánh chuỗi gen 12S của một lô mạt Việt Nam (lô đại diện: DpT3) với chuỗi gen 12S của D. pteronyssinus (sốđăng ký: AF529911).
- Chúng tôi cũng tiến hành so sánh song đôi chuỗi gen 12S thu từ một lô mạt
đại diện (lô DpT3) của Việt Nam với chuỗi gen 12S đã có từ mẫu chuẩn D. pteronyssinus của Mỹ, kết quả cho thấy 99% tương đồng, khẳng định hai loài hoàn toàn giống nhau (Hình 3.7).
3.3.3. Kết luận
- Như vậy, kết quả xác định gen 12S thu nhận từ các lô mạt Việt Nam đã chính thức cho kết quả khẳng định loài mạt hiện nay nuôi tại Viện Tai-Mũi-Họng để chế
kháng nguyên dịứng là loài D. pteronyssinus.
- Giám định chính xác loài D. pteronyssinus của mạt Việt Nam còn có giá trị
sử dụng cặp mồi Dp12F-Dp12R để xây dựng qui trình và kit chẩn đoán phân biệt.
> gb|AF529911.1| Dermatophagoides pteronyssinus isolate A 12S ribosomal RNA gene, partial sequence; mitochondrial gene for mitochondrial product Length=395
Score = 713 bits (386), Expect = 0.0 Identities = 392/395 (99%), Gaps = 0/395 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 AAACTAGGATTAGATACCCTAGTATTTTAGGGTTATTATTAAGTAGTAGATAATTTTTAT 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 AAACTAGGATTAGATACCCTAGTATTTTAGGGTTATTATTAAGTAGTAGATAATTTTTAT 60 Query 61 TAAACTTAATTTTTCTGGCGGTTTATTACCCATTCACAGGAATTTGTTAATTTTAAAAGA 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 TAAACTTAATTTTTCTGGCGGTTTATTACCCATTCACAGGAATTTGTTAATTTTAAAAGA 120 Query 121 TAACCCGCCTTTATTATAACCAATCTAAATTTTATGTACGGCTGTTAGGCTTTAATTTAA 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 TAACCCGCCTTTATTATAACCAATCTAAATTTTATGTACGGCTGTTAGGCTTTAATTTAA 180 Query 181 TTATTTTTGCTTTAAGATTTAATTCCTTAATTCAGGTCTATGTGTAGAATATAAATTGGT 240 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 181 TTATTTTTGCTTTAAGATTTAATCCCTTAATTCAGGTCTATGTGTAGAAGATAAATTGGT 240
Query 241 TTTTAATGAGTTACTATAATAGGGGAAtttttttATATAAATAATTTAATTTGGATGTGA 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 TTTTAATGAGTTACTATAATAGGGGAATTTTTTTATATAAATAATTTAATTTGGATGTGA 300 Query 301 AAGTAAAATAGATATTAAAATTTCTATTTGAAGAAGGACCTAATAAAAGTACATATCGCC 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 AAGTAAAATAGATATTAAAATTTCTATTTGAAGAAGGACCTAATAAAAGTACATATCGCC 360 Query 361 CGTCACTCTTTTGATAGATAAGTCCTAACATAGTA 395 |||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 361 CGTCACTCTTTTGATAGATAAGTCGTAACATAGTA 395