Các tác động của biến đổi khí hậu đã và đang ảnh hưởng đến tất cả các lĩnh vực phát triển kinh tế - xã hội nói chung và việc sử dụng đất nói riêng. Biến đổi khí hậu ở huyện Mèo Vạc đã, đang và sẽ diễn ra được thể hiện thông qua xu thế gia tăng nhiệt độ, biến đổi của lượng mưa với xu thế giảm của lượng mưa mùa xuân, cùng với sự giảm đáng kể của số ngày mưa phùn, tăng số ngày khô nóng, tăng mức độ khô hạn của mùa khô… tăng xói mòn đất, thay đổi khả năng điều hòa nước...tác động ngày càng mạnh hơn, phức tạp hơn, ở Mèo Vạc thiên tai với những biểu hiện phổ biến như hạn hán, rét đậm, rét hại, sạt lở, lũ ống, lũ quét, cháy rừng, với tác động của biến đổi khí hậu sẽ gây ảnh hưởng lớn đến tình hình phát triển kinh tế, xã hội của tỉnh. Biến đổi khí hậu đã và đang tác động đến đất đai làm cho tài nguyên đất đang ngày càng bị suy giảm độ phì nhiêu của đất. Đất đai bị suy giảm độ phì có thể do nhiều nguyên nhân và một trong những nguyên nhân có tác động mạnh mẽ là yếu tố khí hậu. Trong điều kiện biến đổi khí hậu như hiện nay, sự thay đổi của các yếu tố nhiệt độ và lượng mưa có tác động đến diện tích đất bị suy giảm độ phì của huyện Mèo Vạc. Ở vùng đồi núi, quá trình xói mòn đất diễn ra khá phổ biến do địa hình có độ dốc lớn, bị chia cắt phức tạp; khí hậu phân hóa thành 2 mùa rõ rệt là mùa mưa và mùa khô trong đó lượng mưa tập trung chủ yếu vào mùa mưa gây nên hiện tượng dư thừa nước tạo thành dòng chảy bề mặt gây xói mòn đất mà chủ yếu là quá trình xói mòn do mưa. Bên cạnh đó, quá trình hình thành kết von, đá ong hóa cũng diễn ra tương đối mạnh mẽ. Ở vùng đồi núi, đất có xuất hiện kết von là chủ yếu, quá trình đá ong hóa diễn ra không điển hình. Ngoài ra, đất đai ở vùng đồi núi còn chịu ảnh hưởng của các hiện tượng rửa trôi, sạt lở, trượt lở đất ven sông, ven suối; hiện tượng lũ quét.