Chƣơng trỡnh chọn giống tụm chõn trắng đĩ đƣợc cỏc nƣớc Nam Mỹ nhƣ Cuba, Brazil, Mexico, Colombia, đặc biệt Hawaii (Mỹ) thực hiện từ trƣớc những năm 1990, đến nay đĩ thành cụng và tạo đƣợc cỏc dũng tụm sinh trƣởng nhanh, khỏng bệnh tốt dựa trờn cỏc phƣơng phỏp truyền thống kết hợp với cụng nghệ sinh học phõn tử. Những năm gần đõy, cỏc nƣớc nhƣ Thỏi Lan, Trung Quốc, Đài Loan... đĩ ứng dụng và nhập cụng nghệ này nhằm tạo ra đƣợc cỏc dũng tụm chất lƣợng cao phự hợp với vựng nuụi và điều kiện tự nhiờn ở chõu Á.
Những nghiờn cứu về di truyền phõn tử, phỏt triển chỉ thị di truyền liờn quan đến cỏc tớnh trạng số lƣợng phục vụ chọn giống tụm chõn trắng đƣợc cỏc nhà khoa học trờn thế giới phỏt triển từ những năm 1990 [71], [84]. Nhiều chỉ thị phõn tử đĩ đƣợc ỏp dụng cho chƣơng trỡnh nghiờn cứu di truyền chọn giống, đỏnh giỏ di truyền quần thể, đặc biệt là cỏc chỉ thị cú tớnh đa hỡnh cao liờn quan tới bản đồ liờn kết gen của cỏc tớnh trạng kinh tế và khỏng bệnh.
Sunden và Davis (1991) đĩ nghiờn cứu so sỏnh sự khỏc nhau về di truyền giữa quần đàn tụm chõn trắng nuụi và quần đàn tự nhiờn bằng chỉ thị allozyme, cho thấy khụng cú khỏc biệt lớn về cấu trỳc, tớnh đa hỡnh, tỷ lệ dị hợp tử giữa cỏc quần đàn. Tần số tƣơng đối giữa cỏc allele cao và rất ớt biến dị. Tuy nhiờn, dƣới ỏp lực của chọn lọc nhõn tạo và cỏch ly về mặt địa lý sẽ làm cho cấu trỳc cõn bằng thay đổi và tăng khả năng cận huyết [107].
Hiện nay cú 3 hƣớng lớn đƣợc quan tõm trong chƣơng trỡnh chọn giống tụm chõn trắng là, chọn lọc đƣợc dũng tụm cú tớnh trạng tăng trƣởng vƣợt trội, cú khả năng khỏng bệnh cao (SPR) và khụng bị nhiễm cỏc tỏc nhõn gõy bệnh nguy hiểm (SPF) [27], [137], [138]. Cỏc mầm bệnh nguy hiểm ở tụm chõn trắng đĩ đƣợc xỏc định trong chọn giống SPF là virus gõy hội chứng đốm trắng (WSSV), virus gõy bệnh đầu vàng (YHV), virus gõy bệnh hoại tử cơ quan tạo mỏu (IHHNV), virus gõy hội chứng Taura (TSV) và virus gõy bệnh hoại tử cơ (IMNV) [43], [60], [77], [81], [110]. Mục tiờu của chƣơng trỡnh này là sản xuất ra cỏc dũng tụm khụng bị nhiễm cỏc tỏc nhõn đĩ nờu trờn, đảm bảo đa dạng di truyền, trỏnh cận huyết và cải thiện tốc độ tăng trƣởng.