NHCSXH nói chung và PGD NHCSXH huyện Gò Quao nói riêng hoạt động theo quy định của Chính phủ, không hoạt động theo cơ chế thị trường. Vì thế, việc đánh giá, phân tích tình hình kinh doanh, nghiên cứu khách hàng rất hạn chế, thiếu chính xác dẫn đến rủi ro tín dụng không thể tránh khỏi. Một số dự án do thiếu thông tin, thiếu thực tế, chưa có những đánh giá độc lập, nhiều hồ sơ thẩm định còn mang tính sao chép.
Ngoài ra, hệ thống pháp luật và cơ chế chính sách Nhà nước thường xuyên thay đổi, không có tính dự báo ở một số ngành nghề nên dẫn đến dễ gây rủi ro cho các khách hàng vay vốn, khó khăn cho công tác kiểm soát của ngân hàng.
Với đặc thù của mình là cho vay vốn đến các đối tượng nghèo, cận nghèo, vay đi học, đi làm… thực hiện tín dụng theo chính sách nên rất nhiều hoạt động tín dụng của NHCSXH thông qua tổ chức trung gian là TK&VV, các tổ chức chính trị - xã hội khác. Tuy nhiên việc ủy thác qua các tổ chức chính trị - xã hội này vẫn còn nhiều hạn chế, một số nơi tổ chức chưa thực sự nhận thức hết trách nhiệm của mình trong vai trò và trách nhiệm ủy thác từ khâu bình xét cho vay tại tổ đến việc hướng dẫn, kiểm tra xem xét sử dụng vốn vay và đôn đốc nợ quá hạn.
Đặc biệt với đặc thù là vốn vay tín dụng ưu đãi cho các đối tượng khó khăn, chính sách... thì khâu thẩm định, xét duyệt đúng đối tượng rất quan trọng nhưng ở một số nơi vẫn còn tình trạng “tiêu chuẩn vòng quanh” như xét
hộ nghèo hằng năm nếu năm này được thì năm sau nhường cho hộ khác... dẫn đến tình trạng cho vay không đúng hoặc bỏ sót đối tượng theo quy định.
Đối với khâu thẩm định, đánh giá đầu tiên là nhân lực vẫn còn thiếu và một số hạn chế về trình độ dẫn đến việc thẩm định, đánh giá khách hàng còn nhiều thiếu sót. Rất nhiều khoản vay của PGD NHCSXH huyện Gò Quao được dùng vào sản xuất, trồng trọt, chăn nuôi đòi hỏi cán bộ thẩm định phải có sự liên kết với các đơn vị khuyến nông, nông nghiệp, các đầu mối tiêu thụ... để thẩm định khoản vay chính xác, khách quan nhưng thực tế cho thấy đội ngũ cán bộ thẩm định còn nhiều thiếu sót cả chủ quan lẫn khách quan dẫn đến những khoản vay xấu. Thậm chí một số trường hợp còn tin tưởng hoặc móc nối với các tổ chức TK&VV để cho vay những khoản vay không đúng đối tượng, không đúng mục đích.