Bên cạnh những tác động tpch cực, TNCs cũng có những ảnh hưsng tiêu cực đYn nền kinh tY khu vực.
a. Mvc tiêu của TNCs là lợi nhuận:
Mvc tiêu của TNCs là lợi nhuận, thị phNn, doanh số, ưu thY cạnh tranh và phát triển ổn định. Nó thường xuyên mâu thuẫn với mvc tiêu của chiYn lược chung về phát triển kinh tY xã hội của các quốc gia là tăng trưsng đồng đều, cao và bền vững. Theo mvc tiêu của mình, TNCs thường lựa chọn và quyYt định dự án đNu tư vào nơi mà họ cho là có thị trường, bảo toàn được vốn và thu lợi nhuận. TNCs thường chú trọng tham gia vào các lĩnh vực s những ngành có tỷ suất lợi nhuận cao. Đó là các ngành khai thác dNu khp, công
nghiệp chY biYn như điện tử, dệt may, giày dép với mức lợi nhuận thường đạt khoảng 40 – 60%. Những lĩnh vực sản xuất máy móc thiYt bị hoặc chY biYn nông, lâm, thủy sản thường yêu cNu đNu tư dài hạn, chuyển vốn chậm, lãi suất thấp đã không thu hút được nhiều dự án đNu tư trực tiYp nước ngoài.
b. Chuyển giao công nghệ còn hạn chY:
Thông qua các chiYn lược hoạt động và đNu tư, TNCs góp phNn chuyển giao công nghệ tiên tiYn nhưng không phải là công nghệ tiên tiYn, hiện đại nhất. Họ cho chuyển giao công nghệ loại 2 và loại 3, thậm chp cả công nghệ gây ô nhiễm môi trường, nYu như vấn đề thẩm định, tiYp nhận của các nước nhận đNu tư không tốt và rất có thể các nước đó sẽ trs thành bãi rác công nghệ.
c. Một số TNC lạm dvng các ưu thY về vốn, công nghệ để thao túng và gây hậu quả xấu cho liên doanh:
Hiện tượng khai khống thiYt bị và công nghệ để tpnh tăng giá đNu vào, đánh tvt giá xuất khẩu để định giá thấp đNu ra do bản thân các TNC là kẻ chủ động nắm cả đNu ra đNu vào đã trs nên phổ biYn, khiYn cho các liên doanh thua lỗ, giải thể.
Một số TNC muốn hướng tới độc quyền – một điều ngày càng xa lạ trong nền kinh tY tự do hóa của các quốc gia trong khu vực.