C. coli
3.6.1.So sánh kết quả kiểu gen của gen gyrA với dữ liệu vi sinh
3.6.1.1. Tương quan MIC của kháng sinh nalidixic acid giữa
chủng đột biến và chủng không đột biến trên gen gyrA
Theo tiêu chuẩn CLSI, các chủng nhạy NA được xác định là có MIC ≤
16 µg/ml, các chủng kháng NA có MIC ≥ 32 µg/ml. Kết quả thu nhận được cho
thấy có 5 chủng nhạy và có 35 chủng kháng NA. Tất cả những chủng kháng NA đều có đột biến chuyển Threonin thành Isoleucine ở codon 86.
MIC của 5 chủng nhạy giao động từ 0,75 µg/ml đến 1,5 µg/ml (trung vị
của MIC là 1 µg/ml). MIC của 35 chủng kháng giao động từ 32 µg/ml đến 256
µg/ml (trung vị của MIC là 256 µg/ml).
MIC đối với NA của nhóm chủng không đột biến và có đột biến có sự
khác biệt có ý nghĩa thống kê (p = 0,0001) (Biểu đồ 3.2).
3.6.1.2. Tương quan MIC của kháng sinh ofloxacin,
ciprofloxacin giữa chủng đột biến và chủng không đột
biến trên gen gyrA
Theo tiêu chuẩn CLSI, các chủng nhạy OFX được xác định là có MIC ≤
2µg/ml, các chủng kháng OFX có MIC ≥ 4 µg/ml, các chủng nhạy CIP được xác định là có MIC ≤ 1µg/ml, kháng CIP có MIC ≥ 4 µg/ml.
Chỉ có 2 chủng 20321 và 30446 là kháng với OFX nhưng trung tính với
CIP, các chủng còn lại kháng OFX đều kháng CIP (phụ lục 1.4). Tất cả các chủng kháng OFX, CIP (bao gồm 2 chủng 20321, 30446) đều có đột biến
chuyển Threonin thành Isoleucine ở codon 86.
Đối với ofloxacin, MIC của nhóm chủng không có đột biến giao động từ
0,064 µg/ml đến 0,125 µg/ml (trung vị của MIC là 0,0094 µg/ml); MIC của
là 32 µg/ml). Có sự khác biệt có ý nghĩa thống kê (p = 0,0001) của MIC đối với
OFX giữa nhóm chủng không đột biến và có đột biến (Biểu đồ 3.2).
Đối với ciprofloxacin, MIC của nhóm chủng không có đột biến giao động từ 0,016µg/ml đến 0,064 µg/ml (trung vị của MIC là 0,032 µg/ml) và MIC của nhóm chủng có đột biến giao động từ 3 µg/ml đến 32 µg/ml (trung vị
của MIC là 32 µg/ml). MIC của nhóm chủng không đột biến thấp hơn MIC của
nhóm chủng có đột biến, sự khác biệt này có ý nghĩa thống kê (p = 0,0001) (Biểu đồ 3.2).
Biểu đồ 3.2 Tương quan MIC của kháng sinh nalidixic acid, ofloxacin,
ciprofloxacin, gatifloxacin giữa nhóm chủng không đột biến và chủng đột
biến gyrA
0: không đột biến 1: đột biến
0 5 0 1 0 0 1 5 0 2 0 0 2 5 0 0 1 nalmic oflomic cipmic gatmic MIC (µg/ml)
3.6.1.3. Tương quan MIC của kháng sinh gatifloxacin giữa (adsbygoogle = window.adsbygoogle || []).push({});
chủng đột biến và chủng không đột biến trên gen gyrA
Các chủng nhạy GAT được xác định là có MIC ≤ 2 µg/ml, các chủng
kháng GAT có MIC ≥ 8 µg/ml theo tiêu chuẩn CLSI. Đột biến chuyển
Threonin thành Isoleucine ở codon 86 xuất hiện ở cả những chủng kháng, trung
gian và một vài chủng nhạy với GAT.
MIC của nhóm chủng không có đột biến giao động từ 0,023µg/ml đến
0,047µg/ml (trung vị của MIC là 0,023 µg/ml) và MIC của nhóm chủng có đột
biến giao động 0,75µg/ml đến 32µg/ml (trung vị của MIC là 2,5 µg/ml). MIC của của nhóm chủng không đột biến thấp hơn MIC của nhóm chủng có đột
biến, sự khác biệt này có ý nghĩa thống kê (p = 0,0003) (Biểu đồ 3.2).