1. TỔNG QUAN
1.11.2.Ưu điểm và khuyết điểm của phương pháp MLST so với các
phương pháp genotyping khác
Phương pháp MLST là một phương pháp phân loại dựa vào kiểu gen có
sức mạnh phân biệt giữa các chủng cao. Ngoài ra phương pháp MLST còn có nhiều ưu điểm khác bao gồm:
o Phương pháp MLST giúp giảm nhu cầu vận chuyển vi khuẩn sống
vì việc xác định trình tự DNA từ những sản phẩm PCR có thể đạt được từ dịch huyền phù vi khuẩn đã bị giết hay DNA đã được tinh
sạch.
o Có thể lấy được trình tự mồi, quy trình thực hiện và trao đổi dữ liệu
giữa các phòng thí ngiệm thông qua internet vì có một địa chỉ mạng
toàn cầu để cất giữ quy trình thực hiện, các trình tự mồi cho MLST
và toàn bộ dữ liệu về trình tự allele, kiểu trình tự ST, clonal
complex của các mẫu Campylobacter được phân lập trên toàn thế
giới (http://pubmlst.org/Campylobacter/).
o Phương pháp MLST cung cấp kết quả dưới dạng số nên rõ ràng, chính xác và cho phép so sánh kết quả giữa các phòng thí nghiệm
thông qua internet một cách dễ dàng. Trong khi các phương pháp
phân tích kết quả dựa vào so sánh kích thước DNA trên gel thì không rõ ràng.
o Vì phương pháp này hoàn toàn dựa vào dữ liệu về trình tự nên có tính lặp lại cao.
o Phương pháp này thích hợp đối với những nghiên cứu dịch tễ toàn cầu và kéo dài vì nó xác định sự thay đổi mà tích lũy chậm trong
một quần thể vi khuẩn.
Tuy nhiên, bên cạnh những ưu điểm nêu trên thì phương pháp MLST cũng có những khuyết điểm là đòi hỏi thiết bị đắc tiền và nhân công có kỹ thuật
cao.Phương pháp MLST hay được sử dụng kết hợp với một phương pháp khác như Fla - typing để tăng sức mạnh phân loại vi khuẩn khi khảo sát dịch tễ các
trận dịch lớn xảy ra trong một thời gian ngắn và trong một phạm vi nhỏ.