Các chủng sinh ESBL được tách chiết plasmid theo quy trình tách chiết có cải tiến của Kado-Liu [25]. Các plamid sau đó được điện di, chụp hình và phân tích bằng phần mềm Bionumerics (Hình 3.6).
Kết quả phân tích plasmid của 32 chủng thử nghiệm cho thấy, tất cả các chủng sinh ESBL đều mang ít nhất một plasmid có kích thước lớn từ 50 đến 171 kb. Bên cạnh đó, còn mang nhiều loại plasmid khác có kích thước từ 1 đến 50 kb (Bảng 4.3).
Số lượng và kích thước các plasmid khác nhau ở mỗi chủng. Có 3 chủng (EC7, EC9, ET1) chỉ mang một plasmid duy nhất với kích thước từ 124 đến 157 kb.
Đa số các chủng mang nhiều loại plamid, đặc biệt chủng KC1 mang đến 9 plasmid khác nhau, kích thước từ 2 kb đến 171 kb (Bảng 4.3). Số lượng và kích thước plasmid không mang tính đặc trưng cho từng loài E. coli và K. pneumoniae.
Sau khi phân tích độ tương đồng dựa trên số lượng và kích thước của các plasmid trên gel, chúng tôi nhận thấy có hai nhóm chủng mang các plasmid có độ tương đồng cao (Hình 3.6). Nhóm 1 bao gồm các chủng EC5, EC20, EC22, KT7, và nhóm 2 bao gồm EC7, EC9, ET1. Tuy nhiên, các chủng chứa các plasmid có độ tương đồng cao có nguồn gốc phân lập rất khác nhau. Trong nhóm 1 là các chủng E.
coli phân lập từ mẫu dịch ổ bụng (EC5, EC22) và mẫu phân (EC20) tại bệnh viện
Chợ Rẫy, chủng K. pneumoniae được phân lập từ mẫu đàm (KT7) tại bệnh viện Thống Nhất. Các chủng thuộc nhóm 2 được phân lập từ mẫu dịch ổ bụng (EC7, EC9) tại bệnh viện Chợ Rẫy và mẫu bệnh phẩm đàm (ET1) tại bệnh viện Thống Nhất (Bảng 4.3).
Hình 3.6 : Độ tương đồng các plasmid của 32 chủng vi khuẩn được phân tích bằng
phần mềm Bionumerics dựa trên độ tương quan về kích thước các plasmid.