Công tác lập quy hoạch, kế hoạch sử dụng đất còn mang tính định hướng, chưa kết hợp chặt chẽ được với kế hoạch đầu tư phát triển kinh tế - xã hội, kế hoạch đầu tư hạ tầng và phát triển đô thị nên chưa sát với thực tế triển khai.
Việc quy hoạch chi tiết và lập dự án đầu tư của dự án được ghi trong kế hoạch sử dụng đất thực hiện chậm, việc thỏa thuận của địa phương và các ngành để làm căn cứ lập dự án chưa kịp thời.
Quy hoạch sử dụng đất và quy hoạch phát triển các ngành còn có sự chồng chéo, chưa đồng bộ và thống nhất nên làm hạn chế không nhỏ trong
Công tác giải phóng mặt bằng còn nhiều phức tạp và khó khăn, thiếu tập trung, chất lượng một số dịch vụ đô thị còn thấp. Công tác đầu tư xây dựng cơ bản tuy có nhiều chuyển biến, song tiến độ triển khai một số dự án trọng điểm còn chậm.
Các ngành, các cấp, các cơ quan đơn vị khi đăng ký nhu cầu sử dụng đất không tính toán kỹ, thiếu tính khả thi của dự án. Một số dự án khi đăng ký nhu cầu sử dụng đất còn mang tính chủ quan, chưa lường hết khó khăn trong công tác chuẩn bị về vốn đầu tư, lập và phê duyệt quy hoạch xây dựng chi tiết, yêu cầu về bố trí trước các khu tái định cư ... nên không đủ điều kiện để được giao đất, thủ tục quản lý đầu tư xây dựng cơ bản phức tạp và chặt chẽ là nguyên nhân làm cho thực hiện các dự án về đấu giá quyền sử dụng đất và các dự án sử dụng vốn ngân sách Nhà nước đạt thấp.