Tuỳ theo quy mô, tính chất, tính chất kinh tế kỹ thuật, kinh tế xã hội của từng chương trình, dự án đầu tư phát triển khác nhau mà nội dung chi phí và cơ chế quản lý chi đầu tư của từng chương trình, dự án khác nhau.
a). Nội dung chi
- Chi phí xây dựng, gồm: chi phí xây dựng các công trình, hạng mục công trình, chi phí tháo dỡ các vật kiến trúc cũ, chi phí san lắp mặt bằng xây dựng, chi phí công trình tạm, công trình phục vụ thi công, nhà tạm tại hiện trường để ở và điều hành thi công;
- Chi phí thiết bị, bao gồm: chi phí mua sắm thiết bị công nghệ, chi phí đào tạo và chuyển giao công nghệ ( nếu có), chi phí lắp đặt, thí nghiệm, hiệu chỉnh, chi phí vận chuyển, bảo hiểm, thuế và các loại chi phí liên quan khác;
- Chi phí bồi thường giải phóng mặt bằng, tái định cư, bao gồm: chi phí đền bù nhà cửa, vật kiến trúc, cây trồng trên đất và các chi phí khác, chi phí thực hiện tái định cư, chi phí tổ chức đền bù giải phóng mặt bằng, chi phí xây dựng đất trong thời gian xây dựng ( nếu có), chi phí đầu tư xây dựng hạ tầng kỹ thuật ( nếu có);
- Chi phí quản lý dự án, bao gồm: các chí phí để tổ chức thực hiện công việc quản lý dự án từ khi lập dự án đến khi hoàn thành nghiệm thu bàn giao đưa công trình vào khai thác sử dụng;
- Chi phí tư vấn đầu tư xây dựng, bao gồm: chi phí tư vấn khảo sát, thiết kế, giám sát xây dựng, tư vấn thẩm tra và các chi phí đầu tư xây dựng khác.
b) Cơ chế quản lý chi.
- Đối với những nội dung công việc thực hiện theo hình thức đấu thầu hoặc chỉ định thầu thì việc quản lý chi theo nội dung hợp đồng.
- Đối với những nội dung công việc thực hiện theo hình thức giao nhiêm vụ thì việc quản lý chi theo dự toán chi được duyệt ( dự toán chi được xác định trên cơ sở chế độ, định mực, tiêu chuẩn do nhà nước ban hành).
c) Thẩm quyền quyết định chi.
Thông thường việc quyết định chi bao gồm nhiều giai đoạn nối tiếp nhau với thẩm quyền quyết định khác nhau, cụ thể:
- Quyết định đầu tư và tổng mức đầu tư ( kể cả trường hợp điều chỉnh) thuộc thẩm quyền của Người quyệt định đầu tư theo phân cấp quản lý đầu tư của Chính phủ, Chủ tịch UBND tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương;
- Quyết định phê duyệt dự toán công trình thuộc thẩm quyền của chủ đầu tư ( kể cả quyết định điều chỉnh dự toán trong phạm vi tổng mức đầu tư);
- Quyết định phê duyệt kết quả đấu thầu thuộc thầm quyền của Người quyết định đầu tư hoặc Người được uỷ quyền;
- Ký kết hợp đồng giao nhận thầu thuộc thẩm quyền của chủ đầu tư. d) Thẩm quyền chuẩn chi.
Theo chế độ hiện hành, chủ đầu tư hoặc người được uỷ quyền có thẩm quyền ra lệnh trả tiền, tất nhiên thẩm quyền đó được giới hạn trong phạm vi Luật NSNN hiện hành.