Những thành tựu trong chọn tạo giống cây trồng, cây lai theo hướng khác nhau phụ thuộc vào sự phong phú, đa dạng về mặt di truyền của vật liệu khởi đầu.
* Nguồn gen dưa chuột địa phương
Các giống dưa chuột địa phương được tạo thành dưới tác động của quá trình chọn lọc tự nhiên và nhân tạo đã tồn tại một thời gian dài trong điều kiện sinh thái riêng biệt của từng vùng, rất đa dạng về các đặc tính hình thái, sinh học và nông học.
Dưa chuột là cây thụ phấn chéo nên mỗi cá thể trong quần thể giống địa phương đều có kiểu gen khác nhau. Nghiên cứu đặc tính sinh vật học của các giống dưa chuột Việt Nam, Trần Khắc Thi và Vũ Tuyên Hoàng, (1979) đã phân các giống hiện có thành 2 kiểu sinh thái (ecotype): miền núi và đồng bằng trong đó kiểu sinh thái miền núi có nhiều đặc tính hoang dại và thích ứng với môi trường cao (chịu lạnh, chống bệnh phấn trắng, phản ứng chặt với độ dài ngày...).
* Nguồn gen dưa chuột tạo thành: bao gồm quần thể các dạng cây lai, các dòng tự phối, các dạng đột biến, đa bội và quần thể các dạng tạo ra bằng công nghệ sinh học.
Quần thể lai: là các dạng được tạo ra bằng phương pháp lai.
Quần thể các dòng tự phối: Nghiên cứu tạo dòng dưa chuột đơn tính cái phục vụ chọn giống dưa chuột ưu thế lai, Viện Nghiên cứu Rau quả đã tạo 17 dòng tự phối dưa chuột đơn tính cái (Gynoecious) ổn định về khả năng sinh trưởng và thể hiện giới tính (Phạm Mỹ Linh,1999), (Nguyễn Hồng Minh và cs., 2010).
Quần thể các dạng đột biến, đa bội: đây là những nguồn vật liệu khởi đầu được tạo ra bằng các tác động lên hạt giống hoặc gây các tác nhân lý hóa học
khác nhau như bức xạ, nhiệt độ, hóa chất...
Quần thể các dạng tạo ra bằng công nghệ sinh học: bao gồm các dạng được tạo ra do dung nạp tế bào trần, chuyển gen, nuôi cấy tế bào hoặc chọn dòng tế bào, nuôi cấy bao phấn, noãn để tạo dòng thuần. Các dòng đơn bội kép này sẽ là nguồn gen quý phục vụ công tác chọn giống dưa chuột ưu thế lai với khả năng cho năng suất cao bởi tỷ lệ hoa cái của giống lai được cải thiện khi ứng dụng dòng mẹ dạng Gynoecious (Trần Khắc Thi, 1981).