Nấm rễ nội cộng sinh AM, mối quan hệ cộng sinh giữa cây trồng và nấm từ đất có vai trò đặc biệt quan trọng trong sức sản xuất của cây, sinh thái học của cây và đất đóng vai trò then chốt trong thuật ngữ “Nông nghiệp bền vững”. Mối quan hệ cộng sinh này đang nhận được nhiều sự quan tâm bởi sự tăng khả năng ứng dụng của chúng trong thực tế đồng ruộng như đa dạng sinh học, nông nghiệp bền vững, các chương trình tái tạo rừng và quản lý hệ sinh thái (Gianinazzi S, 1994).
-Ứng dụng trong nông nghiệp:
Nấm rễ, đặc biệt là AM phổ biến trong đất và tạo ra mối quan hệ cộng sinh với hầu hết các thực vật trên cạn bao gồm cả cây trồng nông nghiệp, ngũ cốc, rau quả và vườm ươm. Có tới hơn 80% các loại cây trồng trong tự nhiên hình thành cộng đồng nấm rễ. Do vậy, sự ứng dụng nấm rễ AM là một xu hướng phổ biến trong nông nghiệp (Brundrett MC, 2002).
Nấm rễ thường được xử lý cho hạt giống hoặc cây con trước khi gieo trồng với nhiều loại cây nông nghiệp (lúa, lúa mỳ, ngô, khoai, đậu tương, cỏ linh lăng...) giúp tăng cường khả năng sinh trưởng, phát triển của cây, tăng khả năng kháng sâu bệnh dẫn tới năng suất và chất lượng cây trồng tăng lên (M.A.U Mridha, 2003).
Ở các nước như Indonesia, Malaysia, Ấn Độ... đã phổ biến đưa nấm rễ này vào quy trình trồng trên cây tiêu, cây cao su, cà phê, cọ dầu, các loại cây ăn quả và cây lâm nghiệp từ vườn ươm cho đến cây trưởng thành.
- Ứng dụng trong tái tạo rừng và quản lý hệ sinh thái:
Nghiên cứu về nấm rễ AM đã trở thành một lĩnh vực quan trọng trong ngành khoa học môi trường hiện đại, từ những khía cạnh cơ bản để ứng dụng
trong lâm nghiệp và trong phục hồi các hệ sinh thái có hoạt động khai thác bề mặt tạo ra các khu vực rất lớn đất bị xáo trộn ở nhiều nơi trên thế giới và có một nhu cầu cấp thiết cần cải tạo lại đất và tái tạo hệ thống cây trồng trên những vùng đất bị suy thoái này. Phục hồi sinh thái là quá trình hỗ trợ cải tạo một hệ sinh thái đã bị xáo trộn, bị suy thoái và phá hủy. Vai trò của việc sử dụng nấm rễ trong tái tạo thảm thực vật nhằm mục đích thiết lập một hệ sinh thái bền vững đã được nghiên cứu rộng rãi và hiệu quả của chúng đã được chứng minh.
Tại Banglades, đất rừng thường là đất nghèo photpho và các chất dinh dưỡng khác hoặc tồn tại P ở dạng kém linh động tương tự như đất nhiệt đới khác. Trong điều kiện như vậy, công nghệ nấm rễ được ứng dụng trong xử lý cho các cây ở giai đoạn phát triển tại vườm ươm đã có tác dụng nâng cao sự phát triển tổng thể trong vườm ươm và tăng trưởng sớm sau khi chuyển cây ra đất rừng (M.A.U Mridha, 2003).
Việc quản lý nấm rễ AM trong việc tái tạo thảm thực vật và tái tạo rừng cũng đã được ghi nhận thành công (Takhuya Marumoto and Zakuo Yamato, 2011), (Zaki Anwar Siddidui, 2008). Tại Nhật Bản, GS. Marumoto và cộng sự đã nghiên cứu thành công tấm phủ sinh học chống xói mòn đất và tái tạo thảm thực vât nhờ vai trò của nấm rễ. Vật liệu này đã tái tạo được thảm thực vật và rừng, phục hồi cảnh quan tại nhiều vùng đất bị phá hủy tại Nhật Bản, điển hình như phủ xanh các sườn dốc tại Fhugendake thuộc quận Nagasaki, quận Hiroshima, tạo cảnh quan cho đường cao tốc quận Yamaguchi, cảnh quan cho khu vực sông ở quận Fukusima hay cho đập thủy điện tại quận Hirosima (Takhuya Marumoto and Zakuo Yamato, 2011).
- Ứng dụng của tái tạo thảm cỏ:
Mục tiêu bảo trì các bãi cỏ nhất là những sân golf là đảm bảo có được và giữ được sự phát triển đồng nhất của cỏ với màu sắc tươi và tránh được những nguồn bệnh có thể ảnh hưởng tới sức khỏe của con người. Để quản lý bãi cỏ một cách chất lượng, cần có phương pháp phù hợp trong đó giải pháp sinh học được quan tâm hơn cả. Sự cộng sinh nấm rễ đã giải quyết được vấn đề này nhờ vai trò của nấm rễ trong việc hấp thụ và chuyển hóa chất dinh dưỡng cho cỏ, cải thiện khả năng hút nước cho cỏ nhờ sự phát triển hệ rễ giúp tăng cường sự chống chịu ngay trong điều kiện khô hạn. Dự thảo Mike Amarathus 27/09/2011 đã đưa ra công nghệ ứng dụng nấm rễ xử lý cho cỏ Bermuda để xây dựng và bảo trì sân
golf tại Califonia và Oregon (Mỹ) đã giúp cải thiện, tăng cường phát triển sức đề kháng của cỏ trên sân golf, là biện pháp quản lý sân golf để cải thiện tình trạng của cả sân golf và đất. Nhờ đó bảo vệ được cấu trúc đất, giảm thời gian và chi phí cho công việc bảo trì, giảm lượng phân bón và nước tưới sử dụng, đồng thời nâng cấp được sân golf và chống hạn hán. Công nghệ xử lý nấm rễ cũng được áp dụng rộng rãi trong việc cải tạo nhiều bãi cỏ và thành công ở nhiều nơi như Real Club de Golfde Sotogrande, Club de Golf El Zaudin (Seville) và La Cala Golf ở Tây Ban Nha hay bãi cỏ Vale do Lobo Golf ở Bồ Đào Nha (Mycosym.com).