Phần 2 Tổng quan tình hình nghiên cứu trong và ngoài nước
2.2. Nghiên cứu về southern rice black-streaked dwarf virus (SRBSDV)
2.2.2. Phân loại và hình thái của SRBSDV
2.2.2.1. Phân loại theo ICTV (2015)
Tên: Southern rice black-streaked dwarf virus (SRBSDV)
Chi: Fijivirus
Họ: Reoviridae
Nhóm: III (dsRNA – RNA sợi kép)
Reovirus là những virus khơng vỏ bọc (enveloped), hình cầu đa diện 20 mặt (T- 13) và có một đến 2 lớp vỏ protein (capsid). Cấu trúc genome của virus trong họ từ 10 – 12 mảnh và được chia thành 3 loại tương ứng với kích thước của chúng là : L (lớn ), M (trung bình) và S (nhỏ). Các mảnh có kích thước từ 1.0 kpb đến 3.9 kpb mã hóa cho 1-3 protein khác nhau. Các protein được ký hiệu bằng các ký tự Hy Lạp tương ứng với mảnh mà protein đó dịch mã (mảnh L mã hóa cho protein λ, mảnh M mã hóa cho protein μ và S mã hóa cho protein σ) (Lundgren et at., 2000).
Các reovirus gây bệnh trên thực vật thuộc 3 chi Oryzavirus, Phytoreovirus và
Fijivirus. Các chi này được phân chia dựa trên hình thái phân tử, số lượng các mảnh
genome, huyết thanh học và vector côn trùng đặc trưng (Zhang et at., 2008).
Fijivirus có 10 mảnh genome dsRNA, hầu hết trong số đó mã hóa một protein, một
số là lưỡng tính. Chi này gồm năm nhóm lồi đã được cơng nhận từ lâu và nhóm 2 chứa bốn lồi virus có quan hệ chặt chẽ là: Rice black streaked dwarf virus (RBSDV), Maize rough dwarf virus (MRDV), Mal de Rio Cuarto virus (MRCV)
and Pangola stunt virus. Theo báo cáo ICTV 9th, MRDV và RBSDV có thể được coi
là một lồi. Cho đến bây giờ, trình tự bộ gen hồn chỉnh của RBSDV và MRCV và các chuỗi phân đoạn S8 - S10 của MRDV đã được giải mã (ICTV, 2015).
2.2.2.2. Hình thái và cấu trúc của SRBSDV
SRBSDV có hình thái và tổ chức bộ gen điển hình cho chi Fijivirus. SRBSDV có 10 mảnh genome dạng thẳng có cấu trúc RNA sợi kép (ds RNA), kích thước từ 4.5 to 1.8 kb và được đặt tên từ S1 đến S10 theo trọng lượng phân tử từ lớn tới nhỏ (Zhou et al., 2008).
Các virion của SRBSDV có đường kính 70-75 nm, chỉ xuất hiện trong mạch phloem của cây bị nhiễm bệnh, trong khi virus tập trung thành cấu trúc mạng lưới trong các tế bào (Zhou et al., 2013).