Để vƣơn tới tầm nhìn lành bệnh viện phổi chất lƣợng cao ngang tầm quốc tế, hoàn thành hai sứ mệnh, giữ gìn và phát huy ba giá trị cốt lõi, ngay từ những ngày đầu Bệnh viện Phổi Trung ƣơng đã đề ra những mục tiêu sau đây:
Thứ nhất, chuẩn và chuẩn hóa các kỹ thuật cơ bản để đảm bảo đáp ứng nền tảng kỹ thuật vững chắc và chuẩn mực bao gồm các kỹ thuật lâm sàng nội khoa, nhi khoa, ngoại khoa, hồi sức, cấp cứu, huyết học , sinh hóa, miễn dịch, vi sinh, giải phẫu bệnh, chẩn đoán hình ảnh...
Thứ hai, phát triển kỹ thuật mũi nhọn chuyên ngành lao và bệnh phổi là thách thức lớn nhất và cũng là cơ hội cho phát triển, bao gồm các kỹ thuật chẩn đoán và điều trị công nghệ cao nhƣ xạ trị ung thƣ, đốt u bằng kim đốt vi
sóng, sinh học phân tử, chẩn đoán gien học, chẩn đoán hình ảnh Scaner, siêu âm, MRI, nội soi chẩn đoán và can thiệp, phẫu thuật nội soi, phục hồi chức năng hô hấp, thăm dò chức năng hô hấp, chẩn đoán và điều trị rối loạn thở khi ngủ, rửa phổi, ghép phổi, điều trị bằng tế bào gốc, ...
Thứ ba, cung cấp các dịch vụ y tế với 6 tiêu chí: an toàn, minh bạch, thân thiện, dễ tiếp cận, toàn diện và hiện đại. Mọi kỹ thuật y khoa chỉ có thể phát huy tác dụng khi chuyển thành dịch vụ y tế để cung cấp cho mọi ngƣời dân. Thực hành y khoa liên quan đến tính mạng con ngƣời, dù là lớn hay nhỏ đều cần phải an toàn làm tiêu chí hàng đầu. Minh bạch với trách nhiệm giải trình không đơn thuần chỉ là rõ ràng về tài chính mà còn là quy trình làm việc, thân thiện không chỉ dừng lại ở lời nói mà trong từng cử chỉ và không gian môi trƣờng bệnh viện, dễ tiếp cận thể hiện ở các gói nhỏ trong gói dịch vụ lớn để có nhiều lựa chọn phù hợp cho nhiều đối tƣợng và hoàn cảnh khác nhau. Toàn diện thể hiện dịch vụ của bệnh viện không chỉ chăm sóc bệnh lý hô hấp mà cả những bệnh lý đi kèm, không phải chỉ điều trị bằng thuốc, phẫu thuật, mà còn phục hồi chức năng, dinh dƣỡng, không phải chỉ chăm sóc y tế mà còn các dịch vụ xã hội thiết yếu.
Thứ tư, phát triển bệnh viện gắn liền với phát triển mạng lƣới chống lao và bệnh phổi toàn quốc. Bệnh viện Phổi Trung ƣơng ra đời là vì tình hình Bệnh lao nặng nề, muốn chấm dứt bệnh lao thì chỉ một bệnh viện không thể làm đƣợc mà phải là một mạng lƣới mạnh mẽ với sự tham gia rộng khắp của toàn xã hội. Thông qua nghiên cứu và đào tạo, chuyển giao công nghệ sẽ giúp cho các bệnh viện tuyến tỉnh phát triển đủ năng lực xây dựng và củng cố mạng lƣới đến tuyến huyện, tuyến xã và y tế tƣ nhân trên địa bàn. Đồng thời, cũng là động lực để Bệnh viện Phổi Trung ƣơng liên tục chinh phục những đỉnh cao của khoa học chuyên ngành. Trên nền tảng mạng lƣới đó việc lồng ghép quản lý các bệnh phổi và phát hiện điều trị bệnh lao sẽ đạt mức tối ƣu làm tiền đề cho thực hiện chiến lƣợc chấm dứt bệnh lao.
Thứ năm, tạo dựng và củng cố môi trƣờng công tác chuẩn mực để hội tụ sự thông thái và trung thực. Vì vậy cần xây dựng, gìn giữ môi trƣờng này trên những nguyên tắc chuẩn mực, chỉ có nhƣ vậy mới thấy hạnh phúc, mới thu hút và đào tạo đƣợc những ngƣời tài, những ngƣời tốt, những ngƣời tâm huyết tầng tầng, lớp lớp trƣởng thành cùng phát triển Bệnh viện. Đó chính là gìn giữ và phát huy giá trị cốt lõi thứ 3 của Bệnh viện.
Thứ sáu, mở rộng hợp tác đa ngành và hội nhập quốc tế. Hợp tác đa ngành sẽ là nguồn sức mạnh rất lớn tranh thủ đƣợc tính chuyên nghiệp của các đơn vị hợp tác trên phƣơng diện chất lƣợng cũng nhƣ giá thành. Hơn nữa hợp tác sẽ cho phép sử dụng hiệu quả hơn cả công nghệ và nhân lực cấp cao. Hợp tác quốc tế, hội nhập quốc tế là một chiến lƣợc rất quan trọng, khai thác hết lợi thế của mình, khắc phục những khó khăn và mang lại những lợi ích lớn hơn cho nhân loại.