Cơ chế chính sách đối với KKT Dung Quất có vai trò quyết định trong việc thu hút đầu tư phát triển KKT Dung Quất, trong đó có thu hút vốn đầu tư phát triển CSHT KKT, cơ chế thông thoáng với các ưu đãi vượt trội cho phép
các nhà đầu tư tìm thấy các lợi ích kinh tế nhiều hơn so với đầu tư vào các khu kinh tế khác. Vì vậy, cơ chế ưu đãi đầu tư vào KKT Dung Quất được ưu đãi trên các mức độ và lĩnh vực sau:
1. Các dự án đầu tư vào KKT Dung Quất được hưởng chính sách ưu đãi áp dụng đối với địa bàn có điều kiện kinh tế - xã hội đặc biệt khó khăn và chính sách áp dụng đối với các khu kinh tế theo quy định của pháp luật về đầu tư, thuế thu nhập doanh nghiệp, thuế xuất khẩu, thuế nhập khẩu và pháp luật khác liên quan.
2. Miễn tiền thuê đất trong thời gian xây dựng cơ bản nhưng tối đa không quá 03 năm kể từ ngày có quyết định thuê đất; Miễn tiền thuê đất, thuê mặt nước cho toàn bộ thời gian thuê đối với dự án đầu tư thuộc lĩnh vực đặc biệt ưu đãi đầu tư; Miễn tiền thuê đất sau thời gian miễn tiền thuê đất của thời gian xây dựng cơ bản: 19 năm đối với dự án đầu tư thuộc danh mục lĩnh vực ưu đãi đầu tư, 15 năm đối với dự án đầu tư không thuộc danh mục lĩnh vực ưu đãi đầu tư tư.
3. Tất cả các dự án đầu tư của các tổ chức và cá nhân trong nước và nước ngoài trong KKT Dung Quất được: áp dụng mức thuế suất thuế thu nhập doanh nghiệp 10% trong 15 năm, kể từ khi dự án đầu tư bắt đầu hoạt động kinh doanh; miễn thuế thu nhập doanh nghiệp 4 năm, kể từ khi có thu nhập chịu thuế; giảm 50% số thuế thu nhập doanh nghiệp phải nộp cho 9 năm tiếp theo.
4. Miễn thuế Hàng hoá nhập khẩu để tạo tài sản cố định của dự án đầu tư vào lĩnh vực được ưu đãi về thuế nhập khẩu.
5. Miễn thuế nhập khẩu trong thời hạn 05 năm kể từ khi bắt đầu sản xuất đối với nguyên liệu, bán thành phẩm mà Việt Nam chưa sản xuất được.
6. Giảm 50% thuế thu nhập đối với người có thu nhập thuộc diện chịu thuế thu nhập, kể cả ngườiViệt Nam và người nước ngoài làm việc tại KKT Dung Quất.
7. Hỗ trợ đầu tư xây dựng hạ tầng KKT ven biển: ngân sách trung ương (NSTW) hỗ trợ đầu tư phát triển kết cấu hạ tầng kỹ thuật và hạ tầng xã hội ngoài các khu chức năng và các công trình dịch vụ quan trọng trong KKT ven biển.
8. Ngoài những ưu đãi được hưởng theo quy định chung nêu trên, các dự án đầu tư của các nhà đầu tư là các tổ chức và cá nhân trong nước và nước ngoài trong KKT Dung Quất được hưởng một số ưu đãi và hỗ trợ đầu tư theo Quyết định số 36/2016/QĐ-UBND ngày 29/7/2016 của UBND tỉnh Quảng Ngãi ban hành quy định về ưu đãi, hỗ trợ và thu hút đầu tư của tỉnh Quảng Ngãi như sau:
- Ưu đãi về giá cho thuê đất
- Hỗ trợ đầu tư xây dựng hạ tầng kỹ thuật thiết yếu và khu tái định cư của dự án
- Hỗ trợ công tác bồi thường, giải phóng mặt bằng
- Hỗ trợ xây dựng công trình xử lý nước thải tập trung của khu công nghiệp, cụm công nghiệp, các khu chức năng trong khu kinh tế
- Hỗ trợ đào tạo lao động
- Hỗ trợ cho công tác vận động thu hút đầu tư
- Hỗ trợ chi phí thông báo thành lập doanh nghiệp và quảng cáo sản phẩm - Hỗ trợ thực hiện thủ tục hành chính
9. Một số nội dung khác:
- Về sử dụng đất và cho thuê: Toàn bộ diện tích mặt đất, mặt nước đã được quy hoạch dành cho đầu tư phát triển KKT Dung Quất được giao một lần cho Ban Quản lý. Ban Quản lý phối hợp với chính quyền địa phương để tổ
chức giải phóng mặt bằng theo quy định chung để giao đất, cho thuê đất đã được đền bù giải tỏa cho nhà đầu tư.
- Về thủ tục đầu tư: Thực hiện theo mô hình “một cửa tại chỗ” thuận lợi cho nhà đầu tư: Đối với các thủ tục thành lập doanh nghiệp, cấp phép đầu tư, ưu đãi đầu tư thuộc thẩm quyền của Ban Quản lý thì có thể giải quyết trong ngày, trường hợp không thuộc thẩm quyền thì được hướng dẫn chu đáo và trợ giúp chi tiết như các thủ tục về đăng ký mã số thuế, cấp quyền sử dụng đất. Cách làm này đã rút ngắn thời gian làm thủ tục cho các nhà đầu tư, tránh phiền hà nhũng nhiễu và tiêu cực trong bộ máy công quyền làm cho nhà đầu tư yên tâm khi đến với KKT Dung Quất.
Để làm được điều đó, các bộ, ngành Trung ương đã ủy quyền và phân cấp mạnh cho Ban Quản lý thực hiện các nhiệm vụ quyền hạn như sau: Bộ Kế hoạch và Đầu tư ủy quyền cấp giấy chứng nhận ưu đãi đầu tư trong nước và cấp giấy phép đầu tư nước ngoài. Bộ Công thương ủy quyền quản lý hoạt động thương mại và xuất nhập khẩu của các doanh nghiệp có vốn đầu tư nước ngoài, cấp giấy chứng nhận xuất xứ hàng hóa. Bộ Xây dựng ủy quyền phê duyệt quy hoạch chi tiết các khu chức năng trong KKT Dung Quất. UBND Tỉnh Quảng Ngãi ủy quyền thực hiện một số quyền hạn và nhiệm vụ của mình cho Ban Quản lý về quản lý đầu tư xây dựng cơ bản trên địa bàn KKT Dung Quất. Bộ Tài Chính đã ban hành thông tư hướng dẫn chế độ tài chính áp dụng cho KKT Dung Quất.