Ngay sau khi giành được chính quyền, nước Việt Nam Dân chủ cộng hòa đã tổ chức Chính phủ lâm thời và xác định các lĩnh vực do nhà nước quản lý trong đó có các lĩnh vực về tài nguyên và môi trường, cụ thể như sau:
- Ngày 03 tháng 10 năm 1945, Chủ tịch nước Việt Nam Dân chủ Cộng hòa đã ký Sắc lệnh số 41/SL, thành lập các sở, trong đó có Sở tổng Thanh tra Khoáng chất và Kỹ nghệ được chuyển sang Bộ Quốc dân Kinh tế; Sở Trước bạ, Văn tư, Quản thủ điền thổ và thuế trực thu được chuyển về Bộ Tài chính; Sở Thiên văn và Đài Thiên văn Phủ Liễn về trực thuộc Bộ Công chính và Giao thông. Đây là cơ sở để thành lập cơ quan quản lý nhà nước về địa chất và khoáng sản cũng như quản lý nhà nước về đất đai và khí tượng thủy văn trong chế độ mới.
- Ngày 12 tháng 10 năm 1992, Bộ Khoa học, Công nghệ và Môi trường đã được thành lập. Ngày 22 tháng 5 năm 1993, Chính phủ đã ban hành Nghị định số 22 - CP về nhiệm vụ, quyền hạn và tổ chức bộ máy của Bộ Khoa học, Công nghệ và Môi trường. Theo đó, Cục Môi trường là cơ quan đầu tiên chuyên trách về bảo vệ môi trường có chức năng giúp Bộ trưởng Bộ Khoa học, công nghệ và Môi trường thống nhất quản lý các hoạt động bảo vệ môi trường trong cả nước.
- Ngày 05 tháng 8 năm 2002, Bộ Tài nguyên và Môi trường đã được thành lập theo Nghị quyết số 02/2002/QH11, kỳ họp thứ nhất của Quốc hội nước Cộng hoà xã hội chủ nghĩa Việt Nam khoá XI và Nghị định số
91/2002/NĐ-CP ngày 11 tháng 11 năm 2002 của Chính phủ quy định chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn và cơ cấu tổ chức của Bộ Tài nguyên và Môi trường, trên cơ sở hợp nhất Tổng cục Địa chính, Tổng cục Khí tượng Thủy văn và các tổ chức thực hiện chức năng quản lý nhà nước về tài nguyên nước, tài nguyên khoáng sản, môi trường thuộc các Bộ: Nông nghiệp và Phát triển nông thôn; Công nghiệp; Khoa học, Công nghệ và Môi trường. Theo đó, Bộ Tài nguyên và Môi trường thực hiện chức năng, nhiệm vụ quản lý nhà nước trên các lĩnh vực: đất đai; tài nguyên nước; tài nguyên khoáng sản; môi trường; khí tượng thủy văn; đo đạc bản đồ.
Ngày 04 tháng 3 năm 2013, Chính phủ ban hành Nghị định số 21/2013/NĐ-CP quy định chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn và cơ cấu tổ chức của Bộ Tài nguyên và Môi trường (thay thế Nghị định số 25/2002/NĐ-CP ngày 04 tháng 3 năm 2008).
Theo đó: “Bộ Tài nguyên và Môi trường là cơ quan của Chính phủ, thực hiện chức năng quản lý nhà nước về các lĩnh vực: Đất đai; tài nguyên nước; tài nguyên khoáng sản, địa chất; môi trường; khí tượng thủy văn; biến đổi khí hậu; đo đạc và bản đồ; quản lý tổng hợp và thống nhất về biển và hải đảo; quản lý nhà nước các dịch vụ công trong các ngành, lĩnh vực thuộc
phạm vi quản lý của Bộ” (Điều 1, Nghị định số 21/2013/NĐ-CP ngày
04/03/2013 của Chính phủ quy định chức năng nhiệm vụ quyền hạn và cơ cấu tổ chức của Bộ Tài nguyên và Môi trường
Hiện nay, cơ cấu tổ chức của Bộ Tài nguyên và Môi trường gồm: Bộ trưởng, 04 Thứ trưởng và 31 tổ chức, gồm: 7 Vụ, Thanh tra Bộ, Văn phòng Bộ, 4 Tổng cục, 5 Cục, 6 đơn vị sự nghiệp trực tiếp phục vụ chức năng quản lý nhà nước của Bộ và 7 đơn vị sự nghiệp khác theo quy định tại Quyết định số 74/QĐ-TTg ngày 13 tháng 01 năm 2014 của Thủ tướng Chính phủ về các đơn vị sự nghiệp trực thuộc Bộ Tài nguyên và Môi trường. Bên cạnh đó, Bộ
quản lý 02 doanh nghiệp và 01 quỹ gồm: Công ty trách nhiệm hữu hạn Nhà xuất bản tài nguyên môi trường và bản đồ Việt Nam và Công ty trách nhiệm hữu hạn một thành viên Tổng công ty Tài nguyên và Môi trường Việt Nam và Quỹ Bảo vệ môi trường Việt Nam. Bộ có chức năng quản lý các Văn phòng giúp việc các tổ chức phối hợp liên ngành do Bộ là cơ quan thường trực gồm: Văn phòng Hội đồng đánh giá trữ lượng khoáng sản; Văn phòng Ban Chỉ đạo Quốc gia khắc phục hậu quả chất độc hóa học do Mỹ sử dụng trong chiến tranh ở Việt Nam (Văn phòng Ban chỉ đạo 33); Văn phòng Thường trực Ủy ban sông Mêcông Việt Nam.
Cơ cấu tổ chức của Bộ Tài nguyên và Môi trường gồm:
07 vụ: Vụ Tổ chức Cán bộ; Vụ Hợp tác Quốc tế; Vụ Kế hoạch; Vụ Khoa học và Công nghệ; Vụ pháp chế; Vụ Tài chính; Vụ Thi đua Khen thưởng và Tuyên truyền
04 Tổng cục: Tổng cục Quản lý Đất đai; Tổng cục Môi trường; Tổng cục Biển và Hải đảo Việt Nam; Tổng cục Địa chất Khoáng sản Việt Nam
05 Cục: Cục Đo đạc và Bản đồ Việt Nam; Cục Khí tượng Thuỷ văn và Biến đổi khí hậu; Cục Quản lý tài nguyên nước; Cục Công nghệ Thông tin; Cục Viễn thám Quốc gia;
06 Đơn vị sự nghiệp: Báo Tài nguyên và Môi trường; Tạp chí Tài nguyên và Môi trường; Quỹ bảo vệ môi trường Việt Nam; Viện Chiến lược Chính sách Tài nguyên và Môi trường; Viện Khoa học Địa chất và Khoáng
Bộ trưởng Các Thứ trưởng 07 Vụ 04 Tổng Cục 05 Cục 06 Đơn vị SN 02 Doanh nghiệp
sản; Viện Khoa học Khí tượng Thuỷ văn và biến đổi khí hậu; Viện Khoa học Đo đạc và Bản đồ; Trường Đại học Tài nguyên và Môi trường Hà Nội; Trường Đại Tài nguyên và Môi trường TP.Hồ Chí Minh; Trường Cao đẳng Tài nguyên và Môi trường miền trung.