Số lượng thẻ được chấp nhận thanh toán tại các đơn vị chấp nhận thẻ còn hạn chế: Các đơn vị chấp nhận thẻ của BIDV hiện tại chỉ chấp nhận thanh toán thẻ do BIDV phát hành bao gồm các thương hiệu thẻ ghi nợ nội địa: BIDV Etran, BIDV Harmorny, BIDV Moving, các thương hiệu thẻ tín dụng quốc tế BIDV flexy và BIDV previous. Ngoài các thương hiệu thẻ do BIDV phát hành, các điểm chấp nhận thẻ của BIDV chỉ mới chấp nhận thanh toán thẻ mang thương hiệu quốc tế VISA bao gồm: thẻ VISA do các ngân hàng trong nước phát hành và do các tổ chức quốc tế phát hành.
Chỉ với 02 loại thẻ được chấp nhận thanh toán như trên là một hạn chế rất lớn đối với BIDV Hà Thành trong việc triển khai mở rộng cũng như tăng doanh số thanh toán tại các đơn vị chấp nhận thẻ vì các ngân hàng cung ứng dịch vụ chấp nhận thẻ chiếm thị phần lớn tại Việt Nam như Ngân hàng Ngoại thương hay Ngân hàng thương mại cổ phần Á Châu đều có thể chấp nhận rất nhiều các loại thẻ thanh toán như: thẻ của do các ngân hàng trong nước phát hành, thẻ mang thương hiệu VISA, MASTER, AMEX...
Chất lượng thanh toán thẻ: Mặc dù hệ thống ATM BIDV Hà Thành được đảm bảo hoạt động 24/7 tuy nhiên trên thực tế hệ thống ATM đôi khi vẫn gặp sự cố, cụ thể: một số máy ATM bị gián đọan do ngắt đường truyền, hết tiền không được tiếp quỹ kịp thời, hết giấy in nhật ký, lỗi kỹ thuật, ATM ngừng hoạt động do hệ thống chạy batch run cuối ngày.
Các máy POS của BIDV phần lớn vẫn là thế hệ máy cũ (PAX) to, cồng kềnh. Phương án truyền thông của các máy POS là dùng dial up chập chờn dẫn đến chất lượng thanh toán thấp, vẫn còn có các giao dịch không chấp nhận thanh toán do lỗi trong quá trình truyền nhận.
Tần suất giao dịch tại các đơn vị chấp nhận thẻ thấp: Trong các điểm chấp nhận thẻ của BIDV Hà Thành, có những điểm chấp nhận thẻ hầu như không có phát sinh giao dịch hoặc nếu có thì tấn suất rất nhỏ. Điều này ảnh hưởng không nhỏ đến chất lượng và hiệu quả của hoạt động thanh toán thẻ tại BIDV Hà Thành.
Công tác phát triển mạng lưới thanh toán thẻ còn chậm và chưa hợp lý: Việc lắp đặt máy ATM chỗ thừa chỗ thiếu gây khó khăn cho khách hàng trong quá trình giao dịch và hiệu quả sử dụng của mỗi máy thấp. Chưa làm tốt công tác lắp đặt POS và mở rộng cơ sở chấp nhận thẻ, số lượng POS BIDV trên tổng số máy POS tại thị trường Việt nam còn quá nhỏ bé, tuy đã được cải thiện đáng kể nhung nhiều cửa hàng, siêu thị lớn... vẫn chưa có POS của BIDV.
Tỷ trọng thanh toán không dùng tiền mặt thấp trong khi tỷ lệ rút tiền mặt lại cao: Trong những năm qua, BIDV Hà Thành đã có nhiều nỗ lực trong việc cung cấp các sản phẩm-dịch vụ để có thể mở rộng thanh toán không dùng tiền mặt qua ngân hàng nhưng còn nhiều khó khăn, vướng mắc. Có thể dễ dàng nhận thấy thanh toán bằng tiền mặt hiện nay vẫn rất phổ biến trong nền kinh tế nước ta. Với hơn 80 triệu dân nhưng đến nay chúng ta mới phát hành khoảng 2 triệu thẻ ATM và gần 100 nghìn thẻ quốc tế; trên toàn quốc mới có 1.900 máy ATM được lắp đặt... Khối lượng tiền mặt trong lưu thông hiện chiếm khoảng 22,2%-22,8% tổng phương tiện thanh toán, một con số đáng quan tâm bởi thanh toán bằng tiền mặt lớn sẽ có nhiều bất lợi cho quản lý nhà nước về tiền tệ.