Trong thời gian vừa qua tình hình thu thuế trên địa bàn huyện Đoan Hùng tăng cao qua các năm. Việc thu thuế của các doanh nghiệp trên địa bàn cũng tăng qua các năm trong đó có các doanh nghiệp đầu tư trực tiếp nước ngoài (FDI), đây cũng là một trong các nguồn thu chính của ngân sách nhà nước.
Tuy nhiên do thực hiện một số chế độ, chính sách ưu đãi cho các doanh nghiệp nên cũng ảnh hưởng đến nguồn thu ngân sách, mà cụ thể là các khoản thu thuế của năm này được miễn hoặc gia hạn đến các năm sau doanh nghiệp mới thực hiện nghĩa vụ thuế đối với nhà nước. Mặt khác do ảnh hưởng chung của tình hình suy thoái toàn cầu, việc tăng, giảm số lượng doanh nghiệp hoạt động trên địa bàn cũng ảnh hưởng đáng kể đến nguồn thu ngân sách nhà nước.
Trong những năm qua vẫn còn những khoản thu, sắc thuế có tiến độ thu đạt thấp so với dự toán, đặc biệt là các khoản thu liên quan đến hoạt động sản xuất kinh doanh như thu từ DNNN, thu từ doanh nghiệp có vốn đầu tư nước ngoài, thu từ khu vực kinh tế ngoài quốc doanh. Thu nội địa đạt thấp hơn so với yêu cầu tiến độ dự toán, lũy kế 5 tháng đầu năm đạt 98,26 tỷ đồng, bằng 39,2% dự toán; trong đó, một số khoản thu lớn có liên quan đến hoạt động sản xuất – kinh doanh đạt thấp, đặc biệt là thu từ khu vực DNNN (chủ yếu nguồn thu của NSTW) chỉ đạt 29,1% dự toán và thu từ khu vực doanh nghiệp có vốn ĐTNN đạt 36,1% dự toán, khu vực kinh tế ngoài quốc doanh đạt 39,8% dự toán.
Do đó cần phải tập trung hoàn thiện thể chế chính sách, pháp luật về thu NSNN. Trong đó, tiếp tục rà soát hệ thống các chính sách thu NSNN để hoàn thiện theo hướng tăng cường tính công khai, minh bạch, giảm thủ tục hành chính thuế, tạo thuận lợi cho doanh nghiệp trong khai nộp thuế. Trong quản lý điều hành, tổ chức triển khai thực hiện tốt các Nghị quyết của Trung ương, của Quốc hội, của Chính phủ, các luật như Luật NSNN, Luật phí và lệ phí năm 2015; tổ chức thực hiện tốt các nhiệm vụ thu NSNN năm 2017; hạn chế tối đa việc đề xuất, ban hành các chính sách mới làm giảm thu NSNN (trừ các cam kết quốc tế). Đẩy mạnh cải cách thủ tục hành chính trong lĩnh vực thuế, hải quan theo các Nghị quyết số 19-2017/NQ-CP, Nghị quyết số 36a/NQ-
CP, Nghị quyết số 41/NQ-CP nhằm cải thiện môi trường kinh doanh, tạo điều kiện cho phát triển doanh nghiệp, nâng cao năng suất, chất lượng, hiệu quả sức cạnh tranh. Đẩy mạnh kê khai thuế qua mạng điện tử, thực hiện quy trình thu nộp theo phương thức điện tử tự động tạo điều kiện thuận lợi cho người nộp thuế cũng như nâng cao hiệu quả trong quản lý thuế.