Trường Trung cấp Y tế Cao Bằng được thành lập ngày 23/8/1961 với tên gọi Trường Cán bộ Y tế Cao Bằng theo Quyết định số 268/TC-QĐ ngày 23/8/1961 của Ủy ban hành chính tỉnh Cao Bằng.
Năm 1973, Trường Cán bộ Y tế Cao Bằng được Bộ Y tế quyết định đổi tên thành Trường Trung học Y tế Cao Bằng
Năm 2008, theo Quyết định số 50/QĐ-UBND ngày 11 tháng 01 năm 2008 của Ủy ban nhân dân tỉnh Cao Bằng Trường Trung học Y tế Cao Bằng đổi tên thành Trường Trung cấp Y tế Cao Bằng trực thuộc Sở Y tế Cao Bằng.
Nhiệm vụ của trường đó là đào tạo và bồi dưỡng cán bộ có trình bộ cao đẳng và các trình độ thấp hơn trong lĩnh vực y tế, chăm sóc sức khỏe cộng đồng và nghiên cứu khoa học phục vụ yêu cầu phát triển kinh tế - xã hội.
Trải qua gần 60 năm xây dựng và phát triển, trường Trung cấp Y tế Cao Bằng đã không ngừng phấn đấu vượt qua khó khăn, thử thách, đóng góp một phần nhỏ bé cho sự nghiệp “trồng người” của đất nước. Kể từ khi thành lập đến nay, trường đã đào tạo hơn 4.000 trung cấp (Y sĩ: hơn 2.600 sinh viên; Y tá TH&ĐD ĐK: hơn 800 sinh viên; HSTH: hơn 550 sinh viên; Dược sĩ: hơn 2.500 sinh viên; Sơ cấp: 1686 YTSC; 579 dược tá; 76 Y sỹ chuyển điều dưỡng và 2.297 lượt cán bộ y tế được đào tạo lại). Trường ngày càng phát triển cả về cơ cấu ngành nghề, quy mô và chất lượng đào tạo, trở thành địa chỉ tin cậy về đào tạo của cán bộ y tế cho tỉnh Cao Bằng và các tỉnh vùng Đông Bắc Việt Nam.