Cơ quan thuế cỏc cấp khi phỏt hiện cỏc cơ sở kinh doanh vi phạm quy định về thuế thu nhập doanh nghiệp phải kiểm tra xỏc định rừ hành vi vi phạm, lập hồ sơ theo quy định. Căn cứ vào mức độ vi phạm hành chớnh trong lĩnh vực thuế, cơ quan thuế cú thẩm quyền ra quyết định xử phạt hoặc kiến nghị lờn cơ quan thuế cấp trờn và cơ quan phỏp luật xử lý theo thẩm quyền. Thẩm quyền xử lý vi phạm về thuế được hướng dẫn như sau:
1.Thủ trưởng cơ quan thuế trực tiếp quản lý thu thuế cú thẩm quyền xử lý vi phạm về thuế:
1.1- Xử lý đối với cỏc vi phạm của cơ sở kinh doanh quy định tại Khoản 1, Khoản 2 Điều 23 của Luật thuế thu nhập doanh nghiệp và hướng dẫn tại Điểm 1, Điểm 2, Mục I Phần G của Thụng tư này .
1.2- Phạt tiền từ một đến năm lần số thuế gian lận theo quy định tại Khoản 3 Điều 23 của Luật thuế thu nhập doanh nghiệp và hướng dẫn tại Điểm 3, Mục I Phần G của Thụng tư này.
2. Cục trưởng cục thuế, Chi cục trưởng chi cục thuế trực tiếp quản lý thu thuế cú thẩm quyền xử lý vi phạm về thuế:
2.1- Áp dụng cỏc biện phỏp xử lý quy định tại Khoản 4 Điều 23 của Luật thuế thu nhập doanh nghiệp và hướng dẫn tại Điểm 4, Mục I, Phần G Thụng tư này.
2.2- Chuyển hồ sơ sang cơ quan cú thẩm quyền để xử lý theo quy định tại Khoản 3 Điều 23 của Luật thuế thu nhập doanh nghiệp và hướng dẫn tại Điểm 3, Mục I, Phần G của Thụng tư này.
H. KHIẾU NẠI VÀ THỜI HIỆU
1. Quyền và trỏch nhiệm của cơ sở kinh doanh trong việc khiếu nại về thuế: Theo quy định Điều 26 của Luật thuế thu nhập doanh nghiệp, cơ sở kinh doanh cú quyền khiếu nại về việc cỏn bộ thuế, cơ quan thuế thi hành khụng đỳng Luật thuế thu nhập doanh nghiệp. Đơn khiếu nại phải gửi cho cơ quan thuế nơi phỏt hành thụng bỏo thuế, lệnh thu hoặc quyết định xử lý, trong thời hạn 30 ngày kể từ ngày nhận được lệnh thu hoặc quyết định xử lý. Trong khi chờ giải quyết, cơ sở kinh doanh vẫn phải nộp đủ và đỳng thời hạn số tiền thuế, tiền phạt đó thụng bỏo.
Nếu cơ sở kinh doanh khụng đồng ý với quyết định giải quyết khiếu nại của cơ quan thuế hoặc quỏ thời hạn 30 ngày kể từ ngày gửi đơn mà chưa nhận được ý kiến giải quyết thỡ đối tượng nộp thuế cú quyền khiếu nại lờn cơ quan thuế cấp trờn hoặc khởi kiện ra toà ỏn theo đỳng quy định của phỏp luật.
Cơ sở kinh doanh phải thực hiện đỳng cỏc thủ tục, trỡnh tự khiếu nại hay khởi kiện theo cỏc quy định phỏp luật hiện hành.
2. Trỏch nhiệm và quyền hạn của cơ quan thuế trong việc giải quyết khiếu nại về thuế:
Theo quy định tại Điều 27 của Luật thuế thu nhập doanh nghiệp, cơ quan thuế cỏc cấp khi nhận được đơn khiếu nại về thuế của đối tượng nộp thuế phải xem xột giải quyết trong thời hạn 15 ngày kể từ ngày nhận được đơn. Đối với vụ việc phức tạp, phải điều tra xỏc minh mất nhiều thời gian, thỡ cần thụng bỏo cho người khiếu nại biết, nhưng thời gian giải quyết chậm nhất cũng khụng quỏ 30 ngày kể từ ngày nhận đơn; nếu vụ việc khụng thuộc thẩm quyền giải quyết của mỡnh thỡ phải chuyển hồ sơ hoặc bỏo cỏo cơ quan cú thẩm quyền giải quyết và thụng bỏo cho người khiếu nại biết trong thời hạn 10 ngày kể từ ngày nhận được khiếu nại.
Cơ quan thuế kiểm tra phỏt hiện và kết luận cú sự khai man, trốn thuế hoặc nhầm lẫn về thuế, xử lý phạt vi phạm về thuế thỡ cơ quan thuế cú trỏch nhiệm truy thu hoặc hoàn trả số tiền thuế, tiền phạt tớnh khụng đỳng trong thời hạn năm
năm về trước, kể từ ngày kiểm tra phỏt hiện cú sự khai man, trốn thuế hoặc nhầm lẫn về thuế. Trường hợp cơ sở kinh doanh khụng đăng ký kờ khai, nộp thuế thỡ thời hạn truy thu tiền thuế, tiền phạt được tớnh kể từ khi cơ sở kinh doanh bắt đầu hoạt động.