Chuỗi gen GP5 cĩ kích thước 603 bp của 2 chủng virus PRRS đang nghiên cứu (TX196 và TXMT1) được dùng làm chuỗi truy cập trong chương trình BLAST của Ngân hàng gen quốc tế nhằm tìm kiếm các chuỗi đích đã
được đăng ký trong Ngân hàng gen dựa vào mức độ tương ứng về nucleotide. Kết quả truy cập được trình bày ở Bảng 3.1.
Bảng 3.1 cho thấy các chủng virus PRRS cĩ kết quả tương đồng về
chuỗi gen GP5 với chủng TX196 và TXMT1 khi truy cập Ngân hàng gen (GenBank). ðiều đĩ cho phép chúng tơi khẳng định một lần nữa: chuỗi gen mà chúng tơi phân lập được là chuỗi gen GP5 của virus PRRS. Gen GP5 của chủng TX196 và TXMT1 cĩ mức độ tương đồng rất cao với các chủng cĩ nguồn gốc Trung Quốc, đặc biệt đĩ là các chủng cĩ độc lực cao mới phân lập gần đây [62]; [64]; [38] và một chủng của Việt Nam đã cơng bố [29]. Chuỗi gen GP5 của PRRSV gây bệnh phân lập ở Việt Nam ký hiệu 07QN, đã đăng ký năm 2008, được sử dụng để phân tích các chủng của Trung Quốc và Việt Nam gây bệnh "Tai xanh" năm 2007 [29].
Trường ðại học Nơng nghiệp Hà Nội – Luận văn thạc sỹ khoa học Nơng nghiệp ………59
Bảng 3.1. Kết quả truy cập Ngân hàng gen quốc tế, sử dụng chuỗi nucleotide của gen GP5 của chủng TXMT1 làm chuỗi truy cập
Sốđăng ký Chủng virus cĩ độđồng nhất ðiểm Tổng số % so sánh Giá trị E % đồng
nhất
Ghi chú: Chương trình sử dụng là BLAST của NCBI (http://www.ncbi.nlm.nih.gov). Dãy số và ký tự bên trái là sốđăng ký; ở giữa là tên virus; năm dãy cuối cho biết mức độ chính xác của kết quả theo phân tích tin-sinh học trong chương trình BLAST.
3.6 Kết quả so sánh thành phần nucleotide và amino acid của gen GP5 chủng TX196 và TXMT1 với một số chủng trên thế giới
3.6.1 Kết quả so sánh thành phần nucleotide
ðể nghiên cứu cụ thể hơn mức độ biến đổi thành phần nucleotide của gen GP5 và thành phần amino acid do gen đĩ mã hố ở chủng TX196 và TXMT1, chúng tơi chọn lựa một số chủng virus PRRS đại diện đã được phân lập trước đây, gồm các chủng PRRS phân lập ở Trung Quốc và Bắc Mỹ và một số chủng châu Á khác (Bảng 2.4) cĩ đặc tính thích ứng gây bệnh trên lợn.
Trường ðại học Nơng nghiệp Hà Nội – Luận văn thạc sỹ khoa học Nơng nghiệp ………60 Kết quả được lựa chọn và so sánh bằng chương trình GENEDOC2.5, thể hiện ở Hình 3.7. A. GP5-NUCLEOTIDE * 20 * 40 * 60 * 80 * 100 * 120 TX196-VN : ATGTTGGGGAAGTGCTTGACCGCGTGCTGTTGCTCGCGATTGCTTTTTTTGTGGTGTATCGTGCCGTTCTATCTTGCTGTGCTCGTCAACGCCAGCAACAACAACAGCTCTCATATTCAGTT : 122 TXMT1-VN : ... : 122 07QN-VN : ...C... : 122 07NM-CN : ... : 122 GD-CN : ... : 122 HUB1-CN : ... : 122 HUB2-CN : ... : 122 HEN13-CN : ... : 122 HUN4-CN : ... : 122 JSyx-CN : ... : 122 JXA1-CN : ... : 122 NX06-CN : ... : 122 BQ-CN : ...C... : 122 YN02-CN : ...A...A...C...C... : 122 S1-CN : ...A...A...GA...A...C...G.T...C...G...G...C...C.A...C. : 122 PRRSV01-CN : ...A...A...GA...A...C...G.T...C...G...G...C...C.A...C. : 122 Fuzhou-CN : ...A...A...G...A...C...G.T...C...C...G...G...C...C.A...C. : 122 CH1a-CN : ...A...A..G...C...G.T...A..G...G...T... : 122 07NP4-TL : ...A...G...C...C...T.T...A...C..G...T... : 122 LMY-KR : ...A...G...A...CT.G.T...T..C.A...G...A...G..G...AA..T.A...C. : 122 MLV-USA : ...A...A...G...A...C...G.T...C...G...G...C...C.A...C. : 122 MLVvac-USA : ...A...A...G...A...C...G.T...C...G...G...C...C.A...C. : 122 PrimePac-U : ...A...G.T..C...C...T...G.T...T...G..G...T.A... : 122 VR2332-ATC : ...A...A...G...C...G.T...C...G...G...C...C.A...C. : 122 * 140 * 160 * 180 * 200 * 220 * 240 TX196-VN : GATTTATAACTTAACGCTATGTGAGCTGAATGGCACAGATTGGCTGGCACAAAAATTTGACTGGGCAGTGGAGACTTTTGTCATCTTCCCCGTGTTGACTCACATTGTTTCCTATGGGGCAC : 244 TXMT1-VN : ... : 244 07QN-VN : ...T... : 244 07NM-CN : ... : 244 GD-CN : ...A... : 244 HUB1-CN : ... : 244 HUB2-CN : ... : 244 HEN13-CN : ... : 244 HUN4-CN : ... : 244 JSyx-CN : ... : 244 JXA1-CN : ... : 244 NX06-CN : ... : 244 BQ-CN : ... : 244 YN02-CN : ...T... : 244 S1-CN : ...C...G...A..TA.C...T...G...T...T...C...T..C. : 244 PRRSV01-CN : ...C...G...A..TA.C...T...G...T...T...C...T..C. : 244 Fuzhou-CN : ...C...G...A..TA.C...T...G...T...T...C...T..C. : 244 CH1a-CN : ...G...TA.C...T... : 244 07NP4-TL : ...G...C...T..GA...A..TA.C...T...G...T..T..T..AC.A...CA...T..T. : 244 LMY-KR : ...C...G...A..TA.C.G...G...TG...T..T..T..T..A...C..T...T..C. : 244 MLV-USA : ...C...G...A..TA.C...T...G...T...T...C...T..C. : 244 MLVvac-USA : ...C...G...A..TA.C...T...G...T...T...C...T..C. : 244 PrimePac-U : ...G...T...TA.T...T...G...T..T...C...C...T.... : 244 VR2332-ATC : ...C...G...A..TA.C...T...G...T...T...C...T..C. : 244 * 260 * 280 * 300 * 320 * 340 * 360 TX196-VN : TCACCACCAGCCATTTCCTTGACACAGTTGGTCTGGCCACTGTGTCCACCGCCGGATATTATCACGGGCGGTATGTCTTGAGTAGCATTTACGCAGTCTGTGCTCTGGCTGCGCTGATTTGC : 366 TXMT1-VN : ...T...C... : 366 07QN-VN : ... : 366 07NM-CN : ... : 366 GD-CN : ... : 366 HUB1-CN : ... : 366 HUB2-CN : ... : 366 HEN13-CN : ... : 366 HUN4-CN : ... : 366 JSyx-CN : ... : 366 JXA1-CN : ... : 366 NX06-CN : ... : 366 BQ-CN : ... : 366 YN02-CN : ... : 366 S1-CN : ....T..T...C.C.T.A.T...T...G.T.GT...C.A...C...G...C...T...C.... : 366 PRRSV01-CN : ....T..T...C.C.T.A.T...T...G.T.GT...C.A...C...G...C...T...C.... : 366 Fuzhou-CN : ....T..T...C.C.T.A.T...T...G.T.GT...C.A...C...G...C...T...C.... : 366 CH1a-CN : ...T...G.T...C...G...T... : 366 07NP4-TL : ...A...C..C....TT.T...T.T..G...C...T..G.C... : 366 LMY-KR : .A...T...C...C...T...T...T...T.GT...T...G...C...T... : 366 MLV-USA : ....T...C.C.T.A.T...T...G.T.GT...C.A...C...G...C...T...C.... : 366 MLVvac-USA : ....T...C.C.T.A.T...T...G.T.GT...C.A...C...G...C...T...C.... : 366 PrimePac-U : .A...C...TT...T...G.T...T...C...C...G...C...T.A... : 366 VR2332-ATC : ....T...C.C.T.A.T...T...G.T.GT...C.A...C...G...C...T...C.... : 366
Trường ðại học Nơng nghiệp Hà Nội – Luận văn thạc sỹ khoa học Nơng nghiệp ………61 * 380 * 400 * 420 * 440 * 460 * 480 TX196-VN : TTTGTCATTAGGCTTGCGAAGAACTGCATGTCCTGGCGCTACTCTTGTACCAGATATACCAACTTCCTTTTGGACACTAAAGGCAGACTCTATCGTTGGCGGTCGCCCGTCATTGTGGAGAA : 488 TXMT1-VN : ...C...G... : 488 07QN-VN : C...C...G...A... : 488 07NM-CN : ...C...G... : 488 GD-CN : ...C...G... : 488 HUB1-CN : ... : 488 HUB2-CN : ... : 488 HEN13-CN : ...C...G... : 488 HUN4-CN : ...C...G... : 488 JSyx-CN : ...C...G... : 488 JXA1-CN : ...C...G... : 488 NX06-CN : ...C...G... : 488 BQ-CN : ...C...G...A... : 488 YN02-CN : ...C...G...A... : 488 S1-CN : ..C...T....A...T...G.G...T...C...G...G...T...CA.A... : 488 PRRSV01-CN : ..C...T....A...T...G.G...T...C...G...G...T...CA.A... : 488 YN02-CN : ...C...G...A... : 488 Fuzhou-CN : ..C...T....A...T...G.G...T...C...G...G...T...CA.A... : 488 CH1a-CN : ..C...C...G...T...A... : 488 07NP4-TL : ..C...T.G...A...T...C...G....A...A...T...CA.A... : 488 LMY-KR : ..C...T...A...T...C.A..T..C..G...C...T...A.A... : 488 MLV-USA : ..C...T....A...T...G.G...T...C...G...G...T...CA.A... : 488 MLVvac-USA : ..C...T....A...T...G.G...T...C...G...G...T...CA.A... : 488 PrimePac-U : ..C...T.G...T...A..C...C...T...C...G...T...CA.A... : 488 VR2332-ATC : ..C...T....A...T...G.G...T...C...G...T...CA.A... : 488 * 500 * 520 * 540 * 560 * 580 * 600 TX196-VN : AGGGGGTAAGGTTGAGGTCGAAGGTCACCTGATCGACCTCAAGAGAGTTGTGCTTGATGGTTCCGCGGCAACCCCTTTAACCAGAGTTTCAGCGGAACAATGGGGTCGTCTCTAG : 603 TXMT1-VN : ... : 603 07QN-VN : ...T...G... : 603 07NM-CN : ... : 603 GD-CN : ... : 603 HUB1-CN : ... : 603 HUB2-CN : ... : 603 HEN13-CN : ... : 603 HUN4-CN : ... : 603 JSyx-CN : ... : 603 JXA1-CN : ...T... : 603 NX06-CN : ... : 603 BQ-CN : ... : 603 YN02-CN : ... : 603 S1-CN : .A....C..A...T...A...T...A...CT... : 603 PRRSV01-CN : .A....C..A...T...A...T...A...CT... : 603 Fuzhou-CN : .A....C..A...T...A...T...A...CT... : 603 CH1a-CN : ...G...A...T... : 603 07NP4-TL : ...C.GA...G..A...T..C...T..A...A...C.... : 603 LMY-KR : .A....C..A...G...A..A...C...A...C...G...A..CT... : 603 MLV-USA : .A....C..A...T...A...T...A...CT... : 603 MLVvac-USA : .A....C..A...T...A...T...A...CT... : 603 PrimePac-U : ...A...A.C..T...A...G...C.... : 603 VR2332-ATC : .A....C..A...T...A...T...A...CT... : 603 Hình 3.7. So sánh thành phần nucleotide 603 bp chuỗi gen GP5 của virus
gây Hội chứng sinh sản và hơ hấp (PRRSV) ở lợn phân lập tại Việt Nam với một số chủng của thế giới
Ghi chú: Sai khác trình tự của các chủng PRRSV so với chủng TX196-VN (Việt Nam) biểu thị bằng chính ký hiệu nucleotide; dấu (.) biểu thị giống với nucleotide của chủng TX196-VN; ký hiệu các chủng được liệt kê ở Bảng 2.4
Kết quả so sánh trên Hình 3.7 về thành phần nucleotide của hai gen GP5 chủng TX196 và TXMT1 chúng tơi nghiên cứu với gen tương ứng của các chủng PRRS trên thế giới được lựa chọn so sánh, thấy rằng:
- Hai đoạn gen GP5 chủng TX196 và TXMT1 cĩ cùng độ dài là 603 bp với các chủng phân lập từ Trung Quốc và chủng Bắc Mỹ.
- Kết quả cho thấy cĩ tất cả 145 vị trí sai khác về nucleotide giữa 24 chủng so sánh. ðiều đặc biệt là các chủng của Trung Quốc và Việt Nam mới phát hiện và phân lập gần đây (14 chủng: từ 1-14 ở Hình 3.7, là các chủng thuộc nhĩm cĩ độc lực cao, gây chết lợn với tỷ lệ rất cao [29], chỉ cĩ 14 vị trí
Trường ðại học Nơng nghiệp Hà Nội – Luận văn thạc sỹ khoa học Nơng nghiệp ………62
sai khác về nucleotide so với các chủng được phát hiện và phân lập trước đĩ (10 chủng) cĩ tới 125 vị trí sai khác (Hình 3.7). Như vậy, trong các chủng so sánh ở nghiên cứu này, cĩ thể phân các chủng thành hai nhĩm, nhĩm cổ điển (nhĩm cũ) cĩ độc lực thấp, gồm các chủng: S1-CN, PRRSV01-CN, Fuzhou- CN, CH1a-CN, 07NP4-TL, LMY-KR, MLV-USA, MLVvac-USA, PrimePac(a)-USA, VR2332-ATCC; và nhĩm độc lực cao (nhĩm mới), gồm các chủng: TX196-VN, TXMT1-VN, 07QN-VN, 07NM-CN, GD-CN, HUB1-CN, HUB2-CN, HEN13-CN, HUN4-CN, Jsyx-CN, JXA1-CN, NX06- CN, BQ-CN, YN02-CN. Hai chủng trong nghiên cứu của chúng tơi phân lập tại Hải Dương và một tỉnh miền Trung năm 2007, nằm trong nhĩm mới cĩ
độc lực cao.
- Trình tự gen GP5 của chủng TX196 cĩ 4 sai khác về thành phần nucleotide so với TXMT1 ở các vị trí: 255 (C ↔ T), 327 (T↔C), 436 (T↔C), 447 (A ↔ G).
- Gen GP5 của hai chủng chúng tơi nghiên cứu cĩ sự sai khác rất ít so với một số chủng Trung Quốc và một chủng Việt Nam phân lập gần đây.
+ So với chủng 07QN-VN (Việt Nam) thì TXMT1 cĩ 6 sự sai khác
ở các vị trí 87 (T ↔ C), 183 (C ↔ T), 367 (T ↔ C), 471 (G ↔ A), 528 (C ↔
T), 579 (A ↔ G); TX196 cĩ 8 vị trí sai khác, ngồi 6 vị trí trên cịn thêm 2 vị
trí: 436 (T ↔ C) và 447 (A ↔ G).
+ So với 11 chủng cĩ độc lực cao khác thì gen GP5 của TX196 cĩ 10 vị trí sai khác: 8 (G ↔ A) (YN02-CN), 12 (G ↔ A) (YN02-CN), 87 (T ↔
C) (BQ-CN, YN02-CN), 103 (A ↔ C) (YN02-CN), 147 (G ↔ A) (GD-CN), 204 (C ↔ T) (YN02-CN), 436 (T ↔ C) và 447 (A ↔ G) (ở hầu hết các chủng), 471 (G ↔ A) (BQ-CN, YN02-CN), 587 (A ↔ T) (JXA1-CN); TXMT1 cĩ 8 vị trí sai khác: 8 (G ↔ A) (YN02-CN), 12 (G ↔ A) (YN02-
Trường ðại học Nơng nghiệp Hà Nội – Luận văn thạc sỹ khoa học Nơng nghiệp ………63
CN), 87 (T ↔ C) (BQ-CN, YN02-CN), 103 (A ↔ C) (YN02-CN), 147 (G ↔
A) (GD-CN), 204 (C ↔ T) (YN02-CN), 471 (G ↔ A) (BQ-CN, YN02-CN), 587 (A ↔ T) (JXA1-CN).
+ ðặc biệt, chủng TX196 khơng cĩ sự sai khác nào về nucleotide so với hai chủng của Trung Quốc là: HUB1-CN và HUB2-CN (Hình 3.7).
Ngồi ra, trong các chủng so sánh cĩ hai chủng của châu Á khác đĩ là: 07NP4-TL (Thái Lan) và LMY-KR (Hàn Quốc), hai chủng này tuy cùng ở
các nước châu Á nhưng cĩ sự sai khác khá nhiều so với các chủng chúng tơi nghiên cứu.
Qua đĩ cho thấy, sự sai khác nucleotide của gen GP5 ở hai chủng nghiên cứu: TX196, TXMT1 và một chủng của Việt Nam đã đăng ký trên Ngân hàng gen là: 07QN-VN so với các chủng Trung Quốc là rất thấp, điều này chứng tỏ
các chủng trên của Việt Nam rất cĩ thể cĩ nguồn gốc từ Trung Quốc.
- ðối với chủng VR2332 thuộc dịng Bắc Mỹ, cĩ đến 66 sự sai khác so với chủng TX196 và 64 sự sai khác so với TXMT1. Như vậy, cùng với các chủng của Trung Quốc và chủng 07QN-VN (Việt Nam), chủng TX196 và TXMT1 của Việt Nam cĩ mức độ thay đổi rất cao so với chủng VR2332 - đại diện đặc trưng PRRSV của dịng Bắc Mỹ. ðiều này phù hợp với nhận xét của các tác giả Trung Quốc khi phân tích gen và độc lực gây bệnh của PRRS xuất hiện năm 2006-2007 tại Trung Quốc [62]; [64]; [29].
Trong nhĩm lựa chọn so sánh, cĩ một chủng vaccine của Mỹ
(MLVvac-USA), chủng này cĩ sự sai khác lớn so với hai chủng TX196 và TXMT1 (của Việt Nam) cũng như các chủng cĩ độc lực cao khác, nhưng so với chủng VR2332 (thuộc nhĩm độc lực thấp), lại cĩ sự sai khác rất ít, chỉ với 1 vị trí 38 (G ↔ A). (Hình 3.7).
Như vậy, về thành phần nucleotide, gen GP5 (ORF5) của hai chủng TX196 và TXMT1 phân lập tại Việt Nam cĩ sự sai khác rất ít với gen tương
Trường ðại học Nơng nghiệp Hà Nội – Luận văn thạc sỹ khoa học Nơng nghiệp ………64
gen tương ứng của chủng VR2332 (Bắc Mỹ) sự sai khác khơng lớn, trong khoảng cho phép của các chủng cùng genotype [29].
3.6.2 Kết quả so sánh thành phần amino acid
Từ kết quả so sánh thành phần nucleotide, chúng tơi đã tiến hành so sánh thành phần amino acid tương ứng do gen GP5 này quy định mã hố (sử dụng bộ mã của vi khuẩn bậc thấp-bacterial code, cĩ trong Ngân hàng gen). Kết quả so sánh thành phần amino acid được trình bày ở Hình 3.8.
B. GP5-AMINO ACID * 20 * 40 * 60 * 80 * 100 TX196-VN : MLGKCLTACCCSRLLFLWCIVPFYLAVLVNASNNNSSHIQLIYNLTLCELNGTDWLAQKFDWAVETFVIFPVLTHIVSYGALTTSHFLDTVGLATVSTAGYYHGRYVLS : 109 TXMT1-VN : ... : 109 07QN-VN : ...A... : 109 07NM-CN : ... : 109 GD-CN : ... : 109 HUB1-CN : ... : 109 HUB2-CN : ...`... : 109 HEN13-CN : ... : 109 HUN4-CN : ... : 109 JSyx-CN : ... : 109 JXA1-CN : ... : 109 NX06-CN : ... : 109 BQ-CN : ...A... : 109 YN02-CN : ..E...A...H... : 109 S1-CN : ..E...D...Q..S...CF...A...S...N...A.V...V... : 109 PRRSV01-CN : ..E...D...Q..S...CF...A...S...N...A.V...V... : 109 Fuzhou-CN : ..E...G...Q..S...CF.A.A...S...N...A.V...V... : 109 CH1a-CN : ...TG...S...CF...NS.S...F...N...V... : 109 07NP4-TL : ...G...S....A...F...N.TS...F...N...VI...C... : 109 LMY-KR : ...G...Q...SCFVA..S.N.SS..N...N...C...V...V... : 109 MLV-USA : ..E...G...Q..S...CF...A...S...N...A.V...V... : 109 MLVvac-USA : ..E...G...Q..S...CF...A...S...N...A.V...V... : 109 PrimePac-U : ...G...SF...CF...YSS...N...V... : 109 VR2332-ATC : ..E...G...S...CF...A...S...N...A.V...V... : 109 * 120 * 140 * 160 * 180 * 200 TX196-VN : SIYAVCALAALICFVIRLAKNCMSWRYSCTRYTNFLLDTKGRLYRWRSPVIVEKGGKVEVEGHLIDLKRVVLDGSAATPLTRVSAEQWGRL- : 200 TXMT1-VN : ...- : 200 07QN-VN : ...L...- : 200 07NM-CN : ...- : 200 GD-CN : ...- : 200 HUB1-CN : ...- : 200 HUB2-CN : ...- : 200 HEN13-CN : ...- : 200 HUN4-CN : ...- : 200 JSyx-CN : ...- : 200 JXA1-CN : ...L....- : 200 NX06-CN : ...- : 200 BQ-CN : ...- : 200 YN02-CN : ...- : 200 S1-CN : ...T...F...A...G...R...V...P- : 200 PRRSV01-CN : ...T...F...A...G...R...V...P- : 200 Fuzhou-CN : ...T...F...A...G...R...V...P- : 200 CH1a-CN : ...V...- : 200 07NP4-TL : ...S...GD...P- : 200 LMY-KR : ...R...Q...P...P...HP- : 200 MLV-USA : ...T...F...A...G...R...V...P- : 200 MLVvac-USA : ...T...F...A...G...R...V...P- : 200 PrimePac-U : ...S...P- : 200 VR2332-ATC : ...T...F...A...R...V...P- : 200
Hình 3.8. So sánh thành phần amino acid chuỗi gen GP5 của virus gây Hội chứng sinh sản và hơ hấp (PRRSV) ở lợn phân lập tại Việt Nam với
một số chủng của thế giới
Ghi chú: Sai khác trình tự của các chủng PRRSV so với chủng TX196-VN (Việt Nam) biểu thị bằng chính ký hiệu amino acid; dấu (.) biểu thị giống với amino acid của chủng TX196-VN; ký hiệu các chủng được liệt kê ở Bảng 2.4.
Trường ðại học Nơng nghiệp Hà Nội – Luận văn thạc sỹ khoa học Nơng nghiệp ………65
Những sai khác về nucleotide của bộ ba mã hố cĩ thể dẫn đến những sai khác về thành phần amino acid (vị trí nucleotide thứ nhất trong bộ ba mã hố), nhưng cũng cĩ thay đổi về nucleotide mà ít dẫn đến thay đổi về amino acid, do một số amino acid cĩ thể do nhiều bộ ba mã hố. Kết quảở Hình 3.7 và 3.8 cho thấy, cĩ tất cả 145 vị trí sai khác về nucleotide nhưng chỉ làm thay
đổi 41 amino acid.
Kết quảở Hình 3.8 cho thấy:
- Chuỗi polypeptide do gen GP5 chủng TX196 và TXMT1 quy định mã hố cho 200 amino acid bằng số amino acid của các chủng PRRSV phân lập từ Trung Quốc và các chủng thuộc dịng Bắc Mỹ.
- Hai chủng nghiên cứu cĩ sự giống nhau 100% về amino acid.
- Trong 24 chủng so sánh cĩ tất cả 41 vị trí sai khác vế amino acid, trong đĩ 14 chủng cĩ độc lực cao chỉ cĩ 4 vị trí sai khác so trong nhĩm, cịn lại trong nhĩm độc lực thấp cĩ đến 32 vị trí sai khác. Qua đĩ cho thấy, các chủng cĩ độc lực cao mới phân lập gần đây cĩ sự biến đổi đáng kể so với các chủng trước cĩ độc lực thấp.
- Cĩ sự sai khác rất ít về amino acid của chuỗi polypeptid GP5 chủng TX196 và TXMT1 với các chủng phân lập từ Trung Quốc và chủng của Việt Nam:
+ So với chủng 07QN-VN (Việt Nam) [29] cĩ 2 vị trí sai khác là: 29