Phương pháp bố trắ thắ nghiệm

Một phần của tài liệu Luận văn thu nhận và mô tả đặc tính của enzyme chitosanasse từ vi khuẩn bacilus licheniforrmis NN1 (Trang 44)

Xác ựịnh ựiều kiện nuôi cấy vi khuẩn bằng bài toán quy hoạch thực nghiệm. Quá trình sinh tổng hợp chitosanase của vi khuẩn phụ thuộc vào nhiều yếu tố của quá trình nuôi cấy, trong ựó các yếu tố nhiệt ựộ, pH và nồng ựộ cơ chất chitosanase ảnh hưởng rõ ràng tới quá trình sinh tổng hợp chitosanase.

Xét ảnh hưởng của ựơn yếu tố ảnh hưởng tới sự sinh tổng hợp chitosanase:

Ảnh hưởng của pH

Thắ nghiệm ựược tiến hành như sau: pH thay ựổi từ 4,5 - 8,5

Nhiệt ựộ: 50oC

Nồng ựộ chitosan 0,2%

Ảnh hưởng của nhiệt ựộ

Thắ nghiệm ựược tiến hành như sau: Nhiệt ựộ thay ựổi 25 - 50oC

pH: pH ựã chọn

Nồng ựộ chitosan 0,2%

Ảnh hưởng của nồng ựộ chitosan Thắ nghiệm ựược tiến hành như sau: Nồng ựộ chitosan thay ựổi 0,1 - 0,4% Nhiệt ựộ và pH ựã chọn

Sau khi xác ựịnh ựược sự ảnh hưởng của các ựơn yếu tố, xác ựịnh các mức cơ sở và vùng khảo sát ựể giải bài toán quy hoạch thực nghiệm và tìm ựiểm tối ưu cho vi khuẩn sinh tổng hợp cao chitosananse.

Trường đại học Nông Nghiệp Hà Nội Ờ Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp ẦẦẦẦẦẦẦẦẦ. 34

Bố trắ thắ nghiệm theo ma trận kế hoạch thực nghiệm trực giao bậc hai của Doehlert.

Số ựiểm thắ nghiệm: N=k2 + k + 1= 13 (k=3) Hai thắ nghiệm lặp lại tại tâm

Bảng 3.2. Ma trận kế hoạch thực nghiệm trực giao bậc hai của Doehlert

Số thắ nghiệm X1 X2 X3 1 1,0000 0,0000 0,0000 2 -1,0000 0,0000 0,0000 3 0,5000 0,8660 0,0000 4 -0,5000 -0,8660 0,0000 5 0,5000 -0,8660 0,0000 6 -0,5000 0,8660 0,0000 7 0,5000 0,2887 0,8165 8 -0,5000 -0,2887 -0,8165 9 0,5000 -0,2887 -0,8165 10 0,0000 0,5774 -0,8165 11 -0,5000 0,2887 0,8165 12 0,0000 -0,5774 0,8165 13 0,0000 0,0000 0,0000 14 0,0000 0,0000 0,0000 15 0,0000 0,0000 0,0000

Trường đại học Nông Nghiệp Hà Nội Ờ Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp ẦẦẦẦẦẦẦẦẦ. 35

Giải bài toán quy hoạch thực nghiệm ựể tìm phương trình mô tả mối quan hệ giữa các yếu tố: Nhiệt ựộ, pH và nồng ựộ chitosan tương ứng với các biến mã hóa X1,X2, X3 có dạng lý thuyết như sau:

Y = b0 + b1*X1 + b2*X2 + b3*X3 + b11* (X1*X1) + b22* (X2*X2)+ b33* (X3*X3) + b12* (X1*X2) + b13* (X1* X3) + b23* (X2*X3) Trong ựó: b0 là hệ số tự do bi (i =1,2,3) là hệ số tuyến tắnh bij (j = 1, 2, 3) là hệ số tương tác cặp

3.4.2.Các phương pháp nuôi cấy và làm sạch enzyme 3.4.2.1. Giữ giống và bảo quản giống

Giống ựược cấy truyền vào môi trường thạch nghiêng và nuôi cấy ở tủ ấm 37oC ựể giữ giống. Sau khi các giống ựã mọc tốt, bảo quản các ống giống trong tủ lạnh ở nhiệt ựộ 3 Ờ 4oC, sau 2-3 tuần cấy truyền lại một lần.

3.4.2.2. Nuôi cấy

Nuôi cấy quy mô phòng thắ nghiệm: Môi trường nuôi cấy ựược phân chia vào các bình tam giác và hấp vô trùng. Cấy giống ựã hoạt hoá vào môi trường nuôi cấy ở chế ựộ vô trùng. Quá trình nuôi ựược tiến hành trên máy lắc ở chế ựộ 200v/ph ở 37oC.

3.4.2.3. Xác ựịnh ựường cong sinh trưởng của vi khuẩn

đường cong sinh trưởng của vi sinh vật biểu diễn sự biến ựổi của số lượng tế bào vi sinh vật theo thời gian trong môi trường nuôi cấy tĩnh. Tiến hành nuôi vi khuẩn Bacillus licheniformis NN1 trong môi trường nuôi cấy. Cứ sau 6h lại lấy dịch nuôi cấy ựem ựo ựộ hấp thụ quang học (Absorbance) ở bước sóng 620nm (A620), ựồng thời xác ựịnh hoạt tắnh enzyme chitosanase. đường cong sinh trưởng ựược xác ựịnh chắnh là sự thay ựổi của ựộ hấp thụ quang học trong quá trình nuôi cấy.

Trường đại học Nông Nghiệp Hà Nội Ờ Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp ẦẦẦẦẦẦẦẦẦ. 36

3.4.2.4. Làm sạch enzyme chitosanase

Dịch enzyme ựược tiến hành tủa phân ựoạn bằng muối amoni sunphate, kết tủa ựược hòa tan trong ựệm phosphate pH 7 và tiếp tục làm sạch bằng phương pháp sắc ký.

Sau khi khảo sát liên tiếp các phân ựoạn, 0 - 30%; 30 - 40%; 40 - 50%; ..; 80 - 90% bão hòa của muối amoni sunphate với dịch enzyme thô, chọn phân ựoạn 30 - 80% bão hòa ựể làm sạch sơ bộ enzyme.

Tiến hành kết tủa enzyme ở 4oC, muối amoni sunphate ựược thêm vào dung dịch ựến 30% bão hòa, ựể qua ựêm, ly tâm 6000 vòng/phút, bỏ cặn tủa. Sau ựó tiếp tục tủa enzyme bằng muối ở phân ựoạn 80% bão hòa. Chế phẩm enzyme thu bằng phương pháp này chứa nhiều muối vì vậy cần loại muối bằng cách phương pháp sắc kắ lọc gel, sử dụng gel sephadex- G25.

Quá trình lọc gel thực hiện với thông số như sau: Thể tắch bơm mẫu: 10ml

Tốc ựộ dòng chảy: 10ml /phút

Hệ dung môi: ựệm phosphate 0,05 M, pH = 7; rửa giải với gradient 0 ọ 0,05 M NaCl

Detector : UV, bước sóng 280 nm

Thu các pic và xác ựịnh pic có hoạt tắnh chitosanase cao và tiếp tục làm sạch bằng sắc ký trao ựổi ion.

Các thông số của quá trình sắc ký trao ựổi ion như sau: Cột: CMFF (GE Health care, Sweden)

Thể tắch bơm mẫu: 5ml Tốc ựộ dòng chảy: 2ml/phút

Hệ dung môi: ựệm phosphate 0,05 M, pH = 7; rửa giải với gradient 0 ọ 0,16 M NaCl

Trường đại học Nông Nghiệp Hà Nội Ờ Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp ẦẦẦẦẦẦẦẦẦ. 37

Tiếp tục thu nhận các pic thể hiện hoạt tắnh chitosanase cao, thực hiện ựiện di ựể kiểm tra ựộ sạch và thực hiện sắc ký trao ựổi ion lần thứ hai nếu thấy cần thiết.

3.4.2.5. Phương pháp ựiện di

Khảo sát thành phần protein - enzyme ngoại bào tổng số bằng phương pháp ựiện di SDS-PAGE 3 lớp (4, 10 và 16,5%) theo phương pháp của Schảgger và Von Jagow (1987) [16].

Kắch thước bản gel 8 x 8,5 cm. Mẫu ựược trộn với ựệm mẫu SDS, ủ tại 95ỨC trong 5 phút, ly tâm 7000 vòng/phút trong 5 phút, nhỏ 20ộl vào giếng. Gel ựược chạy bằng máy ựiện di Consort EV222 tại 100V trong 5 phút ựầu ựể tải mẫu vào gel, sau ựó chạy ở 150V trong 2h.

Gel ựược nhuộm bằng Coomassie (0.1% Coomassie Blue G250, 40% methanol, 10% acetic acid, 50% nước cất) qua ựêm và tẩy bằng dung dịch tẩy nhuộm (50% nước cất, 40% methanol, 10% acetic acid) cho ựến khi nền bản gel trắng sạch.

Bảng 3.3. Thành phần bản ựiện di theo phương pháp Schảgger và Von Jagow (1987) cho 2 bản gel

Hóa chất 16,5% 10% 4% Acrylamide (ml) 4,392 1,33 0,535 Gel buffer (ml) 2,669 1,33 0,969 Nước (ml) 1,34 2,996 Glyxerol 87% (ml) 0,944 APS (ộl) 26,64 15 31,25 TEMED (ộl) 2,669 1,5 3,125

Trường đại học Nông Nghiệp Hà Nội Ờ Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp ẦẦẦẦẦẦẦẦẦ. 38

3.4.3. Các phương pháp phân tắch

3.4.3.1. Xác ựịnh hoạt tắnh enzyme chitosanase

Hoạt tắnh enzyme chitosanase xác ựịnh qua sản phẩm tạo ra là hàm lượng ựường khử tạo ra sau phản ứng.

Nguyên tắc: Khi enzyme chitosanase thuỷ phân chitosan sẽ tạo các

oligosaccharide có chứa ựường khử D-glucosamine. Phương pháp acid dinitrosalicylic kiểm tra sự có mặt của nhóm (C = O) trong ựường khử, oxy hoá nhóm aldehyt trong ựường, ựồng thời 3,5-dinitrosalicylic bị khử tạo thành 3-amino,5-nitrosalicylic trong môi trường kiềm.

CHO- COO-

3,5 Ờ dinitrosalicylic acid 3-amino,5-nitrosalicylic acid Theo trình tự phản ứng, một phân tử ựường sẽ phản ứng với 1 phân tử DNS.

Nguyên liệu:

Tác nhân phản ứng DNS gồm:

Nước cất: 1416 ml; 3,5 Acid dinitrosalicylic C7H4N2O7: 10,6 g; NaOH: 19,8 g; Muối Seignette KNaC4H4O6.4H2O: 306 g; Phenol: 7,6 ml; Natri metabisulfit: 8,3 g.

Chuẩn bị mẫu và ựo ựộ hấp thụ quang học của các mẫu enzyme:

Chuẩn bị 2 ống nghiệm, một ống thắ nghiệm, một ống ựối chứng. Lấy 1ml dịch enzyme cho vào mỗi ống, ở ống ựối chứng cho thêm 0,6ml dung dịch NaOH 10N ựể bất hoạt enzyme. Sau ựó, thêm vào mỗi ống 3ml dung dịch chitosan 0,2%. đặt 2 ống nghiệm trong bể ổn nhiệt ở nhiệt ựộ 50oC/20phút. Sau ựó, nhỏ 0,6 ml NaOH 10N vào ống thắ nghiệm ựể dừng phản ứng. Ly tâm 2 ống, hút mỗi ống 2ml dịch trong, thêm vào mỗi ống 2ml DNS, ựặt trong bể ổn nhiệt 95oC/5-10 phút, ựể nguội ựến nhiệt ựộ phòng và ựo A540.

Lượng ựường khử tạo ra tắnh theo phương trình ựường chuẩn.

định nghĩa ựơn vị hoạt tắnh enzyme chitosanase: Một ựơn vị hoạt tắnh

Trường đại học Nông Nghiệp Hà Nội Ờ Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp ẦẦẦẦẦẦẦẦẦ. 39

giải phóng ra 1ộmol ựường khử trong thời gian 1 phút ở các ựiều kiện của phương pháp phân tắch.

3.4.3.2. Phương pháp xác ựịnh hàm lượng protein

Xác ựịnh hàm lượng protein trong dung dịch enzyme theo phương pháp Bradford [4].

3.4.4. Các phương pháp xác ựịnh tắnh chất của enzyme

3.4.4.1. Ảnh hưởng của nhiệt ựộ và pH tới hoạt tắnh của enzyme

Hoạt tắnh enzyme cũng ựược ựo trong môi trường phản ứng có pH khác nhau (pH 3,6 - 8,5) sử dụng các ựệm acetate (pH 3,6 - 5,6), ựệm phosphate (pH 5,7 - 8,0), ựệm Tris ( pH 7,2 - 9), nhiệt ựộ phản ứng 50oC. Từ ựó xác ựịnh ựược pH thắch hợp cho enzyme hoạt ựộng.

Enzyme chitosanase ựược xác ựịnh hoạt tắnh tại các nhiệt ựộ khác nhau (30 -90 oC) ở pH tối ưu ựã xác ựịnh dưới các ựiều kiện xác ựịnh hoạt tắnh enzyme. Từ ựó xác ựịnh ựược nhiệt ựộ thắch hợp cho enzyme hoạt ựộng.

3.4.4.2. Ảnh hưởng của nhiệt ựộ và pH tới tắnh ổn ựịnh của enzyme

Chitosanase trước khi tiến hành phản ứng với cơ chất sẽ ựược ủ tại các ựiều kiện về nhiệt ựộ hay pH khác nhau trong 1h (30 - 90 oC và pH 3,6 - 8,5), sau ựó tiến hành xác ựịnh hoạt tắnh enzyme theo các bước ựã xác ựịnh.

3.4.4.3. Ảnh hưởng của một số ion kim loại tới hoạt tắnh của enzyme

Trước khi tiến hành xác ựịnh hoạt tắnh của enzyme, ủ enzyme với các muối chứa ion kim loại với nồng ựộ 1mM, và 10 mM trong 1h, sau ựó tiến hành xác ựịnh hoạt tắnh của enzyme.

Các muối chứa: Cu2+,Mg2+, Al3+, Fe2+, Fe2+, Zn2+. Pb2+, K+, Ca2+

3.4.5. Phương pháp xử lý số liệu

- Sử dụng phần mềm Nemrodw giải bài toán mô hình thực nghiệm - Sử dụng phần mềm Excel, Irristat

Trường đại học Nông Nghiệp Hà Nội Ờ Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp ẦẦẦẦẦẦẦẦẦ. 40

PHẦN BỐN: KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN

4.1. Xác ựịnh ựiều kiện nuôi cấy vi khuẩn Bacillus licheniformis ựể sinh tổng hợp cao chitosanase tổng hợp cao chitosanase

4.1.1. Kết quả thực nghiệm thăm dò ựơn yếu tố

Thực hiện theo phương pháp ựã nêu phần 3.4.1. Xác ựịnh sự ảnh hưởng của các ựơn yếu tố, kết quả ựược thể hiện trên ựồ thị 4.1; 4.2; 4.3

0.00 0.01 0.02 0.03 0.04 0.05 4.5 5 6 7 8 8.5 pH h o ạ t tắ n h c h ito s a n a s e ( U /m l)

đồ thị 4.1. Ảnh hưởng của pH tới quá trình sinh tổng hợp chitosanase từ vi khuẩn Bacillus licheniformis NN1

0.00 0.01 0.02 0.03 0.04 0.05 0.06 0.07 25 30 37 45 50 nhiệt ựộ h o ạ t tắ n h c h ito s a n s e ( U /m l)

đồ thị 4.2. Ảnh hưởng của nhiệt ựộ tới quá trình sinh tổng hợp chitosanase từ vi khuẩn Bacillus licheniformis NN1

Trường đại học Nông Nghiệp Hà Nội Ờ Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp ẦẦẦẦẦẦẦẦẦ. 41 0.00 0.01 0.02 0.03 0.04 0.05 0.06 0.07 0.08 0.1 0.2 0.3 0.4 nồng ựộ chitosan (%) h o ạ t tắ n h c h ito s a n ( U /m l)

đồ thị 4.3. Ảnh hưởng của nhiệt ựộ tới quá trình sinh tổng hợp chitosanase từ vi khuẩn Bacillus licheniformis NN1

Từ các ựồ thị cho thấy các yếu tố pH môi trường nuôi cấy, nhiệt ựộ môi trường nuôi cấy và nồng ựộ chitosan trong môi trường nuôi cấy ảnh hưởng rõ ràng tới khả năng sinh tổng hợp chitosanase, trong ựó tại pH 7, nhiệt ựộ 37oC và nồng ựộ chitosan là 0,2% cho khả năng sinh tổng hợp chitosanase là cao nhất.

4.1.2. Xác ựịnh ựiều kiện nuôi cấy tối ưu bằng phương pháp quy hoạch thực nghiệm hoạch thực nghiệm

Từ kết quả thực nghiệm thăm dò ựơn yếu tố, chúng tôi lấy ựiều kiện pH 7, nhiệt ựộ 37oC và nồng ựộ chitosan là 0,2% là mức cơ sở và xác ựịnh vùng khảo sát như sau:

Nhiệt ựộ nuôi cấy: 29 ọ 45oC pH môi trường nuôi cấy: 6 ọ 8

Nồng ựộ chitosan trong môi trường nuôi cấy: 0,1 ọ 0,3%

Kết quả bố trắ thắ nghiệm theo ma trận kế hoạch thực nghiệm trực giao bậc hai của Doehlert trên bảng 4.1.

Trường đại học Nông Nghiệp Hà Nội Ờ Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp ẦẦẦẦẦẦẦẦẦ. 42

Bảng 4.1. Bố trắ thắ nghiệm theo kế hoạch trực giao bậc hai của Doehlert

Số TN Nhiệt ựộ ( 0 C) pH Nồng ựộ chitosan (%) 1 45,0 7,0 0,2 2 29,0 7,0 0,2 3 41,0 7,9 0,2 4 33,0 6,1 0,2 5 41,0 6,1 0,2 6 33,0 7,9 0,2 7 41,0 7,3 0,3 8 33,0 6,7 0,1 9 41,0 6,7 0,1 10 37,0 7,6 0,1 11 33,0 7,3 0,3 12 37,0 6,4 0,3 13 37,0 7,0 0,2 14 37,0 7,0 0,2 15 37,0 7,0 0,2

Trường đại học Nông Nghiệp Hà Nội Ờ Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp ẦẦẦẦẦẦẦẦẦ. 43

Bảng 4.2. Kết quả của các thực nghiệm trong ma trận thực nghiệm

Biến thực Biến mã Số TN Nhiệt ựộ (0C) pH Nồng ựộ chitosan (%) X1 X2 X3 Hoạt tắnh chitosanase (U/ml) Y 1 45,0 7,0 0,2 1,0000 0,0000 0,0000 0,0348 2 29,0 7,0 0,2 -1,0000 0,0000 0,0000 0,0589 3 41,0 7,9 0,2 0,5000 0,8660 0,0000 0,0391 4 33,0 6,1 0,2 -0,5000 -0,8660 0,0000 0,0300 5 41,0 6,1 0,2 0,5000 -0,8660 0,0000 0,0232 6 33,0 7,9 0,2 -0,5000 0,8660 0,0000 0,0619 7 41,0 7,3 0,3 0,5000 0,2887 0,8165 0,0518 8 33,0 6,7 0,1 -0,5000 -0,2887 -0,8165 0,0693 9 41,0 6,7 0,1 0,5000 -0,2887 -0,8165 0,0430 10 37,0 7,6 0,1 0,0000 0,5774 -0,8165 0,0328 11 33,0 7,3 0,3 -0,5000 0,2887 0,8165 0,0690 12 37,0 6,4 0,3 0,0000 -0,5774 0,8165 0,0389 13 37,0 7,0 0,2 0,0000 0,0000 0,0000 0,0698 14 37,0 7,0 0,2 0,0000 0,0000 0,0000 0,0699 15 37,0 7,0 0,2 0,0000 0,0000 0,0000 0,0701

Với hệ số tương quan bội R2 = 0,7 cho phép khẳng ựịnh phương trình thể hiện mối quan hệ giữa các yếu tố nhiệt ựộ, pH và nồng ựộ chitosan với hoạt tắnh enzyme là hồi quy với các hệ số như sau:

Trường đại học Nông Nghiệp Hà Nội Ờ Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp ẦẦẦẦẦẦẦẦẦ. 44

Bảng 4.3. Hệ số của phương trình hồi quy

Hệ số Giá trị hệ số Mức ý nghĩa. % b0 0,06923 < 0,01 *** b1 -0,01064 0,0493 *** b2 0,00301 0,649 ** b3 0,00190 1,89 * b11 -0,02238 0,0395 *** b22 -0,03345 0,0227 *** b33 -0,01541 0,0667 *** b12 -0,00924 0,337 ** b13 0,03101 0,0407 *** b23 -0,00572 1,32 *

( *** mức ý nghĩa 0,01, ** mức ý nghĩa 0,05, * mức ý nghĩa 0,1)

Với mức ý nghĩa 0,05 các hệ số b0, b1, b2, b11, b22, b33, b12, b13 là có ý nghĩa, hệ số b3, b23 là không có ý nghĩa hay chỉ có ý nghĩa với mức ý nghĩa là 0,1.

Ta có phương trình hồi quy theo biến mã có dạng như sau

Y = 0,06923 - 0,01064 *X1 + 0,00301 *X2 - 0,02238 *X1*X1 - 0,03345 *X2*X2 - 0,01541 * X3*X3 - 0,00924 *X1*X2 +0,03101 *X1*X3

đồ thị 4.4, 4.5, 4.6 biểu diễn mối quan hệ của các yếu tố và ựánh giá sự tương tác của các yếu tố và ảnh hưởng của chúng ựến hàm mục tiêu như sau:

Trường đại học Nông Nghiệp Hà Nội Ờ Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp ẦẦẦẦẦẦẦẦẦ. 45

đồ thị 4.4. Sự tác ựộng của nhiệt ựộ (X1) và pH (X2) tới hoạt tắnh chitosanase khi nồng ựộ chitosan (X3) là tâm

Từ ựồ thị chúng tôi thấy, sự tác ựộng của nhiệt ựộ và pH ảnh hưởng rõ ràng tới hoạt tắnh của chitosanase. Trong khoảng biến thiên khảo sát của nhiệt ựộ và pH ta thấy bề mặt biểu diễn có tắnh hội tụ, và ựể ựạt ựược khả năng sinh enzyme tốt (y>0,069 U/ml) trong trường hợp cố ựịnh về nồng ựộ chitosan tại

Trường đại học Nông Nghiệp Hà Nội Ờ Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp ẦẦẦẦẦẦẦẦẦ. 46

tâm kế hoạch là 0,2 % thì X1 (-0,45 ọ -0,1) và X2 (-0,1 ọ 0,22) tương ứng với nhiệt ựộ (33,1 ọ 36,2 oC) và pH (6,9 ọ 7,2).

đồ thị 4.5. Sự tác ựộng của nồng ựộ chitosan (X3) và pH (X2) tới hoạt tắnh chitosanase khi nhiệt ựộ (X1) là tâm

Từ ựồ thị chúng tôi thấy, sự tác ựộng của nồng ựộ chitosan và pH ảnh hưởng lớn tới hoạt tắnh của chitosanase. Trong khoảng biến thiên khảo sát của nồng ựộ chitosan và pH, bề mặt biểu diễn có tắnh hội tụ cao, và ựể ựạt ựược

Một phần của tài liệu Luận văn thu nhận và mô tả đặc tính của enzyme chitosanasse từ vi khuẩn bacilus licheniforrmis NN1 (Trang 44)

Tải bản đầy đủ (PDF)

(83 trang)