Thực hiện tốt quy trình quản lý thuế hiện đại mà các nước đang thực hiện, là xóa bỏ quy trình quản lý theo chế độ "chuyên quản", không còn phù hợp với tình hình nhiệm vụ mới. Đối tượng nộp thuế phải đề cao tinh thần tự giác thực hiện nghĩa vụ thuế theo luật pháp quy định, thực hiện tự tính thuế, tự kê khai thuế dựa vào kết quả hoạt động sản xuất,
kinh doanh, dịch vụ của mình và tự nộp thuế vào Kho bạc Nhà nước. Cơ quan thuế thực hiện hành thu theo đúng chức năng nhà nước quy định, hạn chế việc cán bộ thuế tiếp xúc riêng với đối tượng nộp thuế, áp dụng hình thức phạt nặng đối với các trường hợp khai man, trốn thuế, bảo đảm thu đúng, thu đủ, thu kịp thời cho NSNN, giảm hiện tượng tiêu cực cả đối với người nộp thuế và cán bộ thu thuế.
Các doanh nghiệp phải thực hiện nghiêm chỉnh chế độ hóa đơn, kế toán, đặc biệt theo chế độ mã số thuế, cả đối với người bán và người mua hàng. Qua đó, có căn cứ chính xác để thực hiện đúng đắn việc tự tính thuế, kê khai thuế đối với doanh nghiệp, có cơ sở việc khấu trừ tiền thuế GTGT đầu vào và có tài liệu để cán bộ thuế kiểm tra xác định tính thuế đúng hay sai.
Thông qua chế độ tự tính thuế, tự kê khai, tự nộp thuế vào kho bạc Nhà nước, doanh nghiệp nâng cao được ý thức trách nhiệm về thực hiện nghĩa vụ nộp thuế, kết hợp với việc xử lý nghiêm minh các trường hợp trốn lậu thuế [5].
3.2.4. Hoàn thiện chế độ sổ sách kế toán, chứng từ hóa đơn trong quản lý thu thuế thuế
Hóa đơn và sổ sách kế toán là phương tiện để ngành thuế tiến hành quản lý các đối tượng kinh doanh và thực hiện thu thuế theo đúng luật.
Hóa đơn bán hàng, cung ứng dịch vụ là chứng từ ban đầu cho việc hạch toán hoạt động kinh doanh vào các sổ kế toán của cơ sở. Hóa đơn phản ánh đầy đủ quan hệ tín nhiệm giữa cơ sở kinh doanh và khách hàng. Đây cũng là căn cứ hợp pháp cho việc thanh toán tiền mua hàng, tiền dịch vụ trong các cơ quan, doanh nghiệp,... Hóa đơn là chỗ dựa để xác định doanh thu tính thuế, các chi phí hợp lý được trừ khi xác định TNCT. Việc lập và lưu hành bắt buộc hóa đơn là một biện pháp quan trọng làm lành mạnh hóa các quan hệ kinh tế - xã hội, góp phần thúc đẩy quá trình lưu thông hàng hóa theo nề nếp, kỷ cương, hạn chế buôn bán trốn thuế, hạn chế làm hàng giả.
Kế toán là công việc ghi chép, tính toán bằng con số những hiện vật, thời gian lao động chủ yếu dưới hình thái giá trị để phản ánh, kiểm tra tình hình vận động của các loại tài sản, quá trình và kết quả hoạt động sản xuất kinh doanh, sử dụng vốn ở cơ sở.
Đối với các cơ sở sản xuất kinh doanh, kế toán là công cụ để tính toán, điều hành các hoạt động kinh tế, kiểm tra việc bảo vệ sử dụng tài sản, vật tư, tiền vốn nhằm đảm bảo