Nguyên liệu trồng nấm Linh Chi bao gồm các loại cây lá rộng thân mềm, cĩ thể sử dụng cây rừng hoặc cây vườn. Linh Chi sử dụng nguyên liệu chủ yếu là mạt cưa cao su tươi, khơ, khơng cĩ tinh dầu và độc tố. Ngồi ra cịn cĩ thể trồng Linh Chi từ nguyên liệu là thân gỗ. Tốt nhất nên sử dụng cây gỗ Cao Su, Bồ Đề, So Đũa, Sung, …
Mạt cưa cao su là nguồn cơ chất mà Linh chi phát triển rất tốt với giá thu mua rẽ tăng thêm lợi nhuận cho việc trồng nấm. Mạt cưa là nguồn phế thải gây ơ nhiễm mơi trường nặng nhưng nĩ lại đem lại hiệu quả kinh tế trong việc trồng nấm đặc biệt là nấm Linh chi. Dùng nguồn cơ chất này cĩ thể làm nguồn cơ chất trồng nấm và cũng gĩp một phần giải quyết vấn đề ơ nhiễm mơi trường từ nguồn phế thải mạt cưa. Và sau khi nuơi trồng nấm cĩ thể tận dụng làm phân bĩn hữu cơ sạch rất tốt cho trồng trọt.
Chúng tơi lựa chọn mạt cưa cao su làm nguồn cơ chất chủ yếu để trồng nấm Linh Chi. Vì ở miền Nam loại mạt cưa cao su rất nhiều và rẻ. Nên đốn cây (chặt cây) vào thời điểm cây chứa chất dự trữ nhiều nhất (vừa rụng lá hoặc chuẩn bị mọc lá non), tức là vào mùa thu, khoảng tháng 10 hàng năm. Chọn cây cĩ đường kính khơng nhỏ hơn 20 cm. Cắt khúc khoảng 0.8 – 1,2 m, loại bỏ những khúc cĩ nấm mốc đã mọc. Cây khi cưa khúc phải xử lý đầu gốc bị cưa, nếu khơng sẽ bị nhiễm mốc. Cĩ nhiều cách xử lý như:
Chất đống hoặc xếp gỗ sao cho đầu khúc gỗ hướng mật ra ngồi nơi luồng giĩ qua lại, nếu vết cắt mau khơ sẽ ít bị nhiễm.
Quét vơi lên vết cắt. Vơi cĩ tác dụng làm vết cắt mau khơ và diệt khuẩn, ngăn các loại nấm mốc lạ phát triển.
Đốt qua các đầu cắt bằng cách hơ lửa hoặc nhúng cồn thoa đều mặt cắt rồi đốt. Mạt cưa được lấy từ tế bào thực vật như các loại gỗ mềm, thành phần chủ yếu là xenlulozơ, hemixenlulo, licnin. Trong tế bào thực vật xenlulozơ liên kết chặt chẽ với nguồn hydro cacbon khác như hemi xenlulozơ, pectin, licnin để tạo liên kết bền vững. Hàm lượng xenlulozơ cĩ trong nguyên liệu mạt cưa rất cao, cấu trúc rất bền và đa dạng, để phân giải phải dùng các loại axit hoặc kiềm mạnh, như vậy sẽ gây ơ nhiễm mơi trường. Vì vậy cần cĩ vi sinh vật (VSV) phân huỷ để nấm cĩ thể hấp thụ dễ dàng. Trong thiên nhiên cĩ rất nhiều nhĩm vi sinh vật cĩ khả năng phân giải xenlulozơ.
Nấm sợi:
Trong các nhĩm VSV tham gia phân giải xenlulozơ thì nấm sợi cĩ khả năng phân giải mạnh nhất vì.
− Nấm sợi cĩ số lượng lớn và đa dạng về chủng loại ở trong tự nhiên.
− Nấm sợi cĩ hệ sợi phát triển, hệ sợi cĩ khả năng và xuyên qua nhiều nguồn xenlulozơ cĩ cấu trúc bền vững.
− Nấm sợi cĩ thể sinh trưởng được trên nhiều nguồn xenlulozơ tự nhiên khác nhau ngay cả trên nguồn xenlulozơ khĩ phân giải và nghèo chất dinh dưỡng mà các VSV khác như vi khuẩn, xạ khuẩn, nấm men khơng thể sinh trưởng được.
− Trong quá trình lên men nấm sợi khơng sinh độc tố.
− Đặc biệt nấm sợi cĩ một hệ enzyme phân giải xenlulozơ mạnh và phong phú. − Như vậy với những đặc điểm ưu việt của nấm sợi được xem là đối tượng quan trọng để phân giải từng nguồn xenlulozơ tự nhiên.
Vi khuẩn:
Nĩi chung, vi khuẩn cĩ khả năng phân giải xenlulozơ nhưng khơng mạnh bằng nấm sợi, do xenlulozơ tự nhiên khơng phải là mơi trường tốt cho sinh trưởng của vi khuẩn. Nhưng trong tự nhiên một số vi khuẩn cĩ ưu điểm là sinh trưởng được trong điều kiện mơi trường pH và nhiệt độ khác nhau, nên cĩ thể giúp phân giải xenlulozơ trong điều kiện mơi trường axít, kiềm hoặc ở nhiệt độ cao.
Tham gia quá trình phân giải xenlulozơ tự nhiên cĩ vi khuẩn hiếu khí lẫn yếm khí.
− Vi khuẩn hiếu khí: Cellulomonas, Vibrio, Archomobacter, Cytophaga, Soragium, Bacillus,…
− Vi khuẩn yếm khí: Clostridium, và một số lồi Bacillus
Xạ khuẩn:
Ngồi nấm sợi và vi khuẩn, xạ khuẩn cũng tham gia quá trình phân giải xenlulozơ đáng chú ý là các xạ khuẩn: Streptosporangium, Streptomyces. Actinomyces, Nocardia, Micromonospora,…