Với u điểm của phơng pháp chọn lọc hàng loạt là đơn giản dễ làm, ít tốn kém, có thể áp dụng rộng rãi. Phần lớn các giống tốt ở các địa phơng là do nhân dân sáng tạo trong thực tiễn sản xuất nông nghiệp bằng phơng pháp đó. Nh vậy, đã từ lâu nông dân đã biết chọn lọc hàng loạt đối với các loài vật nuôi, cây trồng.
- Đối với lúa: chọn lọc theo tiêu chuẩn khóm tốt, bông tốt, hạt tốt để làm giống cho vụ sau.
- Giống củ cải số 9 đợc viện cây lơng thực thực phẩm chọn lọc hàng loạt từ giống củ cải Hồng Kông nhập vào nớc ta năm 1980 có thời gian sinh trởng 40 - 45 ngày, khối lợng củ trung bình 230g năng suất 35 - 40 tạ/ha.
Tuy nhiên, phơng pháp này chỉ căn cứ vào kiểu hình mà không kiểm tra đợc kiểu gen của cá thể nên việc củng cố tích luỹ các biến dị tốt chậm đa đến kết quả.
Mỗi tính trạng đều phụ thuộc vào 2 yếu tố: gen và môi trờng. Tỉ trọng của 2 yếu tố này khác nhau tuỳ từng tính trạng biểu thị ở hệ số di truyền.
Ví dụ:Sản lợng sữa bò một kỳ vắt sữa là 25-38%,hàm lợng mỡ trong sữa bò là 33-57%.Hệ số di truyền sản lợng trứng ở gà Lơgo là 9-22%,khối lợng trứng gà là 36-93%
Phơng pháp chọn lọc cá thể khó áp dụng rộng rãi nhng có thể kết hợp đợc việc đánh giá dựa trên kiểu hình với việc kiểm tra kiểu gen, do đó nhanh chóng, hiệu quả. Với phơng pháp chọn lọc cá thể khó áp dụng phổ biến trong sản xuất, chỉ đợc áp dụng trong khâu tạo giống, đợc làm thực nghiệm.
- Các tính trạng đợc chọn lọc chỉ có lợi cho con ngời, ít có lợi cho sinh vật. Ví dụ: hàm lợng dầu trong hạt hớng dơng, tỉ lệ bơ trong sữa bò.
Ví dụ: Giống đậu tơng 138 đợc chọn lọc từ tổ hợp lai Cọc chùm x V73
bằng phơng pháp chọn lọc cá thể tại viện cây lơng thực thực phẩm, đa vào khảo nghiệm năm 1981 có thân cao, phân nhánh ít, quả to ít đổ, chống sâu bệnh khá, thời gian sinh trởng 95-100 ngày, năng suất 12 - 16 tạ/ha.