a) Thời gian qua, Việt Nam đã tiến hành rà soát và sửa đổi các khoản thu phí, lệ phí có mức thu phân biệt đối xử giữa đối tƣợng nộp là ngƣời trong nƣớc với ngƣời nƣớc ngoài, theo nguyên tắc áp dụng chung mức thu, không phân biệt đối xử giữa đối tƣợng nộp là ngƣời trong nƣớc với ngƣời nƣớc ngoài. Cụ thể là đã sửa đổi quy định về phí, lệ phí trong lĩnh vực hàng không theo Quyết định số 69/2006/QĐ-BTC ngày 07/12/2006 của Bộ trƣởng Bộ Tài chính về việc quy định mức thu, chế độ thu, nộp, quản lý và sử dụng phí, lệ phí trong lĩnh vực hàng không.
b) Để đảm bảo chính sách thu phí, lệ phí liên quan đến xuất nhập khẩu phù hợp với Điều VIII của GATT năm 1994, Việt Nam đã sửa đổi chính sách thu phí, lệ phí trong lĩnh vực hải quan và phí giám định văn hoá phẩm xuất nhập khẩu:
(1) Về phí giám định văn hoá phẩm xuất nhập khẩu: Không phân biệt mức thu giữa hàng mậu dịch và hàng phi mậu dịch; mức thu không tính theo tỷ lệ % giá trị lô hàng; chỉ tính theo từng lần giám định của từng sản phẩm theo quy định của pháp luật về quản lý xuất khẩu, nhập khẩu văn hoá phẩm (không tính theo tổng số lƣợng sản phẩm của lô hàng), tiền phí thu đƣợc để lại toàn bộ cho cơ quan thu phí trang trải chi phí phục vụ công việc, dịch vụ thu phí, đảm bảo phù hợp với Điều VIII của GATT năm 1994 mà phía đối tác trong đàm phán yêu cầu. Dự kiến tác động: ngƣời có văn hoá phẩm xuất
nhập khẩu sẽ nộp phí ít hơn trƣớc. Đã đƣợc sửa đổi tại Quyết định số 68/2006/QĐ-BTC ngày 06/12/2006 của Bộ trƣởng Bộ Tài chính về việc quy định mức thu, chế độ thu, nộp, quản lý và sử dụng phí thẩm định nội dung và lệ phí cấp phép xuất khẩu, nhập khẩu văn hoá phẩm.
(2) Về phí, lệ phí trong lĩnh vực hải quan:
Phí, lệ phí hải quan trƣớc đây đƣợc thực hiện theo Quyết định số 64/2005/QĐ-BTC ngày 15/9/2005 của Bộ trƣởng Bộ Tài chính, bao gồm 5 khoản phí, lệ phí:
1. Lệ phí làm thủ tục hải quan. 2. Lệ phí áp tải hải quan.
3. Lệ phí hàng hoá, hành lý, phƣơng tiện vận tải quá cảnh Việt Nam. 4. Phí lƣu kho hải quan.
5. Phí niêm phong, kẹp chì hải quan.
Các khoản phí, lệ phí hải quan theo Quyết định số 64/2005/QĐ-BTC có mức thu phân biệt theo loại hàng hoá (hàng hoá thông thƣờng, hàng đựng trong container, hàng là ô tô xe máy), đồng thời lại phân biệt theo phƣơng tiện vận chuyển (chở bằng tầu thuỷ, ô tô, tàu hoả) và phân biệt theo quãng đƣờng vận chuyển (càng dài thì phải nộp lệ phí nhiều hơn). Không thu lệ phí làm thủ tục đối với hàng xuất khẩu. Cơ quan hải quan đƣợc sử dụng 90%, nộp ngân sách 10%.
Các bên đối tác trong đàm phán cho rằng quy định nhƣ vậy chƣa phù hợp với Điều VIII của GATT là: không vì mục đích thu ngân sách nhà nƣớc, mức thu chỉ vừa đủ bù đắp chi phí và đƣợc không phân biệt theo loại hàng hoá, theo khối lƣợng hàng hoá, theo loại phƣơng tiện hay theo quãng đƣờng vận chuyển. Đề nghị Việt Nam sửa đổi phí, lệ phí hải quan cho phù hợp.
Thực hiện cam kết gia nhập WTO theo đề nghị sửa đổi của các đối tác trong đàm phán nêu trên, Bộ Tài chính đã có Quyết định số 73/2006/QĐ-
BTC ngày 18/12/2006 về việc quy định chế độ thu, nộp, quản lý và sử dụng phí, lệ phí trong lĩnh vực hải quan (thay thế cho Quyết định số 64/2005/QĐ- BTC) với nội dung đảm bảo phù hợp với cam kết. Theo đó, giảm số mức thu phí, lệ phí, không quy định mức thu theo tỷ lệ phần trăm (%) trên trị giá hàng nhập khẩu, không phân biệt mức thu theo khối lƣợng hàng hoá, theo loại hàng hoá khác nhau, theo loại phƣơng tiện hay theo quãng đƣờng vận chuyển, tiền phí lệ phí thu đƣợc để lại toàn bộ cho cơ quan thu phí, lệ phí trang trải chi phí phục vụ công việc, dịch vụ thu phí, lệ phí, đảm bảo phù hợp với Điều VIII của GATT năm 1994 mà phía đối tác trong đàm phán yêu cầu. Đã đƣợc sửa đổi tại Quyết định số 73/2006/QĐ-BTC ngày 18/12/2006 của Bộ trƣởng Bộ Tài chính về việc quy định chế độ thu, nộp, quản lý và sử dụng phí, lệ phí trong lĩnh vực hải quan.