Với giá trị cảnh quan vô cùng độc đáo đặc biệt có Hồ Ba Bể nổi tiếng được ví như Vịnh Hạ Long trên núi, VQG Ba Bể có tiềm năng to lớn để phát triển các loại hình du lịch. Ngay từ khi thành lập Vườn đã xác định phát triển du lịch sinh thái là mục tiêu phát triển của Vườn nhằm phục vụ công tác bảo tồn và từ bảo tồn đem lại lợi ích phục vụ du lịch.
Hiện tại Vườn Quốc Gia Ba Bể đã xây dựng một chương trình du lịch sinh thái với 3 loài hình du lịch: du lịch truyền thống, du lịch văn hóa, du lịch mạo hiểm với 21 điểm và tuyến tham quan gồm các quần thể cảnh quan, hang động và các bản làng đậm đà bản sắc dân tộc của người Tày, Nùng, H’Mông, Dao và các tuyến thăm quan xuyên rừng nguyên sinh. Tất cả các loại hình du lịch trên đã và đang hình thành gắn liền với các tour tuyến du lịch vùng Đông Bắc, phục vụ cho chương trình du lịch Quốc gia.
Khách đến thăm quan nghiên cứu tại VQG Ba Bể có thể lựa chọn một trong hai hình thức: nghỉ tại nhà nghỉ của Vườn hoặc tại nhà sàn của dân. VQG có đội ngũ cán bộ phục vụ nhiệt tình, hiếu khách, đáp ứng những yêu cầu của du khách về sinh hoạt, nghiên cứu học tập. Tại đây có 30 phòng nghỉ đầy đủ tiện nghi, nhà ăn, căng tin rộng rãi, có xuồng máy, thuyền độc mộc phục vụ khách thăm quan đến với các loại hình du lịch, các điểm du lịch tốt hơn.
Số lượng khách du lịch tăng lên hàng năm: năm 1995 chỉ có 1.500 khách; năm 2000 số khách đã lên 5500 người, trong đó khách quốc tế chiếm 17% (chủ yếu là khách Châu Âu). Du khách đến Ba Bể thường tập trung vào mùa hè, những ngày cuối tuần, mùa đông thường chỉ có khách nước ngoài.
Bảng 2.3: Số lượng khách du lịch đến Ba Bể từ 2003 đến 2005
Năm 2003 Năm 2004 Năm 2005
Tháng trong nướcKhách quốc tếKhách trong nướcKhách quốc tếKhách Khách trong nước quốc tếKhách
1 132 94 187 86 100 61 2 91 72 409 88 389 68 3 345 86 427 126 532 291 4 127 110 852 158 823 248 5 430 68 547 109 1160 106 6 384 65 674 83 701 104 7 415 58 1385 184 874 177 8 507 85 790 206 927 159 9 234 108 596 226 622 252 10 546 96 851 208 845 212 11 312 147 507 255 528 248 12 145 146 385 95 234 182 Tổng 3868 1135 7601 1824 7735 2108
Nguồn: Thống kê số lượng khách đến VQG Ba Bể- TT du lịch Ba Bể
Cơ sở vật chất phục vụ du lịch đang được đầu tư để thu hút khách. Tuy nhiên, chất lượng dịch vụ còn chưa đáp ứng được yêu cầu của du khách. Vườn cũng chưa có biện pháp nào để phân bổ lượng khách rải đều quanh năm tránh sự tập trung vào một thời điểm ảnh hưởng xấu đến cảnh quan và đời sống của động vật hoang dã.