Vườn Quốc gia Ba Bể được đánh giá là một trong các VQG Việt Nam có tính ĐDSH cao nhưng đang phải đối mặt với nhiều áp lực và thách thức. Dựa vào chức năng nhiệm vụ được giao và tình hình thực tế nêu trên, các hoạt động của Vườn cần được ưu tiên trong thời gian tới gồm:
1. Tổ chức tốt việc xây dựng và triển khai kế hoạch về công tác quản lý, bảo vệ các hệ sinh thái tự nhiên, các nguồn gen động, thực vật quí hiếm và các cảnh quan thiên nhiên thuộc phạm vi Vườn quản lý.
2. Xây dựng và cũng cố Hạt kiểm lâm, hệ thống các trạm bảo vệ rừng, đội cơ động và mọi hoạt động của các đơn vị này.
3. Tiến hành qui hoạch, tổ chức lại và ổn định đời sống dân cư trong vùng phù hợp với yêu cầu bảo vệ của Vườn, nhanh chóng triển khai dự án khu tái định cư Đồn Đèn (2.130 ha) tại vùng đệm của Vườn cùng với kế hoạch di dời 180 hộ ra khỏi vùng lõi của Vườn.
4. Từng bước phục hồi rừng theo Chương trình 661, tiếp tục Chương trình 327 trước đây. Tiến hành từng bước công tác điều tra, nghiên cứu khoa học bằng các đề tài, chuyên đề.
5. Nâng chất lượng phục vụ, dịch vụ du lịch: nâng cấp cơ sở hạ tầng, xây dựng các tour, tuyến du lịch kết hợp tuyên truyền giáo dục cộng đồng hướng tới mục tiêu bảo vệ thiên nhiên và các nguồn tài nguyên ĐDSH ở VQG.
6. Đào tạo, nâng cao trình độ chuyên môn cho cán bộ, đặc biệt cán bộ kỹ thuật nghiên cứu khoa học và Kiểm lâm.
Tất cả các hoạt động trên đều nhằm phục hồi, xây dựng các sinh cảnh sống phù hợp, bảo đảm cho các loài hoang dã có khả năng tồn tại và phát triển lâu dài. Đồng thời ổn định đời sống của nhân dân thông qua các hoạt động hỗ trợ DLST, khoán quản lý bảo vệ rừng, khuyến nông khuyến lâm. Để đạt được mục đích này phải luôn đảm bảo nguyên tắc mục tiêu bảo tồn phải hài hoà với mục tiêu phát triển.
CHƯƠNG III: ĐÁNH GIÁ GIÁ TRỊ GIẢI TRÍ VÀ GIÁ TRỊ PHI SỬ DỤNG VƯỜN QUỐC GIA BA BỂ