Thực tế đang cho thấy số lượng các dự án bị thanh toán chậm đang chờ giải ngân vốn đang ngày càng tăng lên. Điều này ảnh hưởng trực tiếp đến tiến độ, chất lượng dự án và hiệu quả của đồng vốn. Do đó việc khắc phục tình trạng này là vô cùng cấp thiết. Một số giải pháp cụ thể nhằm khắc phục tình trạng thanh toán chậm tại KBNN như:
Thứ nhất, để đẩy nhanh tốc độ giải ngân vốn cần phải có những cải cách trong cơ chế chính sách liên quan đến đầu tư và xây dựng kịp thời để cả CĐT, nhà thầu và cán bộ thanh toán có những căn cứ pháp lý cần thiết để thực hiện nhiệm vụ của mình. Ví dụ như những chính sách liên quan đến công tác điều chỉnh giá. Đơn giá phải được điều chỉnh cho phù hợp với thực tế do biến động giá nguyên nhiên, vật liệu. Như vậy sẽ giảm thiểu thời gian cho CĐT trong việc phải tính toán dự toán sao cho hợp lý, vừa đúng so với giá trị thực tế lại vừa phải phù hợp với đơn giá quy định đồng thời cũng giảm thiểu thời gian kiểm soát thanh toán vốn do phát hiện những sai lệch giữa giá thực tế với đơn giá theo quy định.
Thứ hai, đơn giản hóa thủ tục đầu tư nhất là ở khâu thẩm định và phê duyệt dự án, công tác đầu thầu để hạn chế số lượng các dự án chậm tiến độ thực hiện do vướng mắc về thủ tục. Hiện nay số lượng các dự án bị chậm trễ trong 2 khâu này tương đối lớn, lượng vốn được phân bổ nhưng chưa được giải ngân tương đối cao làm giảm hiệu quả sử dụng vốn Nhà nước.
Thứ ba, có kế hoạch quy hoạch và công tác tổ chức thực hiện giải phóng mặt bằng, chính sách cho việc tái định cư rõ ràng, cụ thể và hợp lý bởi đây là một trong những nguyên nhân quan trọng dẫn đến tình trạng chậm giải ngân vốn. Công tác giải phóng mặt bằng và tái định cư gây ảnh hưởng trực tiếp đến quyền lợi của đông đảo nhân dân nên thường là nguyên nhân khiến các dự án bị chậm tiến độ đồng thời chi phí cho việc giải phòng mặt bằng thường tăng 1.5-2 lần so với kế hoạch do việc đền bù cho người dân gặp rất nhiều khó khăn.
Thứ tư, cần có quy định yêu cầu rõ ràng về năng lực của chủ đầu tư, nhà thầu, ban quản lý dự án cho từng loại dự án cụ thể bởi nhiều CĐT, nhà thầu chưa đủ năng lực thực hiện những dự án lớn gây ảnh hướng đến tiến độ, chất lượng dự án, chưa kể đến tình trạng thất thoát và lãng phí vốn đầu tư do CĐT có kế hoạch sử dụng vốn không hiệu quả.
Thứ năm, việc bố trí kế hoạch vốn phải tập trung, tránh tình trạng bố trí vốn dàn trải, không căn cứ vào khả năng thực tế thực hiện trong năm của dự án. Các cơ quan có thẩm quyền cần đưa ra những văn bản quy định lượng vốn đăng ký kế hoạch của các địa phương phải dựa trên số lượng các dự án đã đầy đủ thủ tục đầu tư. Tránh tình trạng các Bộ, các địa phương đăng ký kế hoạch cao vào đầu năm nhứng có nhiều dự án được bố trí vốn nhưng không đầy đủ hồ sơ về đầu tư XDCB nên CĐT không có khối lượng nghiệm thu để làm thủ tục giải ngân cho dự án.