Bố trí vốn đầu tƣ tuy có tập trung hơn những năm về trƣớc (từ năm 2010 về trƣớc) nhƣng vẫn còn dàn trải và chƣa phù hợp quy định về cơ chế giao và điều hành kế hoạch nguồn vốn phân cấp về cho tỉnh, huyện theo nguyên tắc và tiêu chí. Việc đề xuất bố trí vốn của các ngành còn chƣa sát thực tế và đúng quy định: Mức vốn bố trí cho một công trình thấp nhƣ: Bệnh viện chuyên Khoa Sản Nhi Long An với tổng mức đầu tƣ đƣợc duyệt 916 tỷ đồng nhƣng bố trí vốn hàng khoảng trên dƣới 70 tỷ, bênh viện tâm thần tỉnh Long An có tổng mức đầu tƣ đƣợc duyệt 208 tỷ đồng bố trí vốn hang năm 30 tỷ đồng, Trƣờng THCS Mỹ Thạnh Đông tổng mức đầu tƣ đƣợc duyệt 10,516 tỷ đồng nhƣng bố trí vốn hang năm 1tỷ đến 2 tỷ đồng, Trƣờng Mầm Non Sao Mai tổng mức đầu 5,87 tỷ đồng bố trí vốn mỗi năm 1,0 tỷ. Nhiều dự án thi công xong vẫn không đủ vốn thanh toán cho đơn vị thi công dẫn đến nợ đọng xây dựng cơ bản, nhiều nhà thầu gặp khó khăn về tài chính.
Trong khi đó việc lập kế hoạch vốn hàng năm trong những năm qua còn mang tính chủ quan. Điều này dẫn đến việc phân bổ đôi lúc chƣa đúng đối tƣợng, chƣa có cơ chế phân bổ vốn cụ thể cho các ngành, các địa phƣơng dẫn đến cơ chế “xin - cho”. Năng lực dự báo của một số chủ đầu tƣ, chủ yếu là các sở, ngành tỉnh và Ủy ban nhân dân các huyện, thành phố trong công tác lập kế hoạch còn yếu dẫn đến tình trạng phải điều chuyển nguồn vốn nhiều lần trong năm. Hiện nay, Bộ Tài chính đã triển khai chƣơng trình quản lý vốn đầu tƣ Tabmis, việc điều chuyển vốn rất khó khăn, đòi hỏi công tác dự báo từ đầu năm phải chính xác.Hơn nữa vốn kế hoạch đƣợc ghi đƣợc năm nhƣng có vốn gần giữa năm hoạch
qua quý III/của nămcác dự án vốn trái phiếu Chính phủ, các dự án vốn tạm ứng nhàn rỗi kho Bạc, chƣơng trình mục tiêu quốc gia