Điểm yếu là những tác nhân bên trong mang tính tiêu cực hoặc gây khó khăn trong việc đạt được mục tiêu của công ty.
Thứ nhất, do công ty chưa có đủ nguồn vốn, quy mô còn nhỏ thiếu nguồn lực về tài chính, năng lực lao động trong lĩnh vực xuất khẩu nông sản còn hạn chế cả về trình độ quản lý, trình độ chuyên môn, kinh nghiệm kinh doanh trên thị trường quốc tế và kiến thức hội nhập.
Thứ hai, khi yêu cầu về chất lượng nông sản ngày càng cao đòi hỏi công nghệ trang thiết bị máy móc cần được đầu tư nhiều. Tuy nhiên, các thiết bị tuy đã được đầu tư nhưng chưa đồng bộ, máy móc thiết bị cũ, lạc hậu đồng thời sự đầu tư trong công tác bảo quản hàng nông sản còn yếu kém nên chất lượng sản phẩm chưa cao, mẫu mã chưa phù hợp, chưa đáp ứng được những đòi hỏi của các thị trường khó tính. Mặc dù đã nhận thức được tầm quan trọng của việc đầu tư công nghệ vào sản xuất để nâng cao chất lượng hàng nông sản song sự đầu tư vẫn thiếu tính hệ thống và chưa đồng bộ, điều này là một trong những điểm yếu lớn hiện tại của Công ty.
Thứ ba, mặc dù nhân viên trong công ty có trình độ đại học trở lên nhưng đối với việc hoàn thiện chứng từ, sổ sách còn hạn chế. Đặc biệt đối với bộ phận chứng từ hàng xuất khẩu còn gặp nhiều khó khăn, do đó công ty không thể tự đặt lịch trực tiếp với hãng tàu, cũng như chuẩn bị giấy tờ và làm các thủ tục thông quan. Vì vậy công ty phải làm việc với bên thứ ba là các công ty Forwarder họ sẽ hỗ trợ công ty một phần trong quy trình xuất khẩu. Bên cạnh đó, là lực lượng nhân viên lao động tại xưởng thường nghỉ việc nhiều, họ làm được vài buổi rồi nghỉ dẫn tới mất chi phí, thời gian cho đào tạo ban đầu.
Thứ tư, công ty còn yếu trong việc mở rộng được các văn phòng đại diện tại nước ngoài. Vì vậy, khi có vấn đề phát sinh xảy ra, những khiếu nại tranh chấp, công ty phải cử người sang xử lý nên khá tốn kém và thiếu tính kịp thời.