Kanagaraj et al. (2010) đã khảo sát 1206 primer để tìm ra các primer có liên kết với gen chịu hạn, kết quả cho thấy có 134 primer liên quan đến gen chịu hạn trong đó 3 primer là RM212, RM302, RM3825 có liên kết chặt với gen chịu hạn và đã được sử dụng trong chương trình chọn giống lúa hạn bằng dấu phân tử. Zhu et
al. (2013) nếu các giống lúa được nhận diện bằng cặp mồi RM212 và xuất hiện
băng ở vị trí 136 bp thì có khả năng mang gen chịu hạn, còn xuất hiện băng ở vị trí 154 bp không mang gen chịu hạn.
Kết quả quan sát trên phổ điện di Hình 3.4 cho thấy chỉ có giống OM 7347 là không có mang gen chịu hạn có xuất hiện băng ở vị trí 154 bp, các giống Phkarum Doul, Phkarum Check, Phkarum Chang, Senpidao, Daw Dam, Nàng Thơm Chợ Đào 3, Nàng Thơm Đục, Hoa Lài, Mẽ Hương 2, OM 4218, Jasmine 85, OM 4900, OM 9915, OM 6377 đều mang gen chịu hạn đều xuất hiện băng ở vị trí 136 bp cùng vị trí với giống đối chứng VND 9520. Kết quả này phù hợp với nghiên cứu của McCouch et al., (2002), ông cũng cho rằng các giống lúa chịu hạn có thể được nhận diện bằng cặp mồi RM212 với sự xuất hiện của băng ADN ở vị trí 136 bp.
Nitika Sandhu et al., (2011) đã sử dụng 3 primer RM212, RM302, RM3825 để khảo sát khả năng liên kết của các primer này với gen chịu hạn của một số giống lúa ở Ấn Độ kết quả cho thấy primer RM302 và RM212 có liên kết chặt với gen
M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 500 bp 1000 bp 697 bp 846 bp - 0 - + - - - - 0 + - + + + + - 0 - + - - - - 0 + - + + + +
27
chịu hạn. Primer RM212 ngày càng tỏ ra hiệu quả trong việc khảo sát các giống lúa chịu hạn trên thế giới.
Nguyễn Thanh Thảo (2013) cũng đã sử dụng primer RM212 và RM302 kết hợp với việc thử hạn nhân tạo trong dung dịch muối KClO3 để khảo sát tính chịu hạn của 12 giống lúa ở Việt Nam. Kết quả cho thấy cả hai primer đều có hiệu quả trong việc nhận diện các giống lúa có khả năng chịu hạn.
Hình 3.4 Phổ điện di sản phẩm PCR của 15 giống lúa và 1 đối chứng bằng cặp mồi RM212
(M: ladder 1kb, 1: Phkarum Doul, 2: Phkarum Check, 3: Phkarum Chang, 4: Senpidao, 5: Daw Dam, 6: Nàng Thơm Chợ Đào 3, 7: Nàng Thơm Đục, 8: Hoa Lài, 9: Mẽ Hương 2, 10: OM 4218, 11: Jasmine 85, 12: OM 4900, 13: OM 9915, 14: OM 7347, 15: OM 6377, 16: VND 9520).