Tổng KTNN do Quốc hội bầu, miễn nhiệm và bói nhiệm, Phủ Tổng KTNN do Uỷ ban Thường vụ Quốc hội bổ nhiệm trờn cơ sở đề xuất của Tổng KTNN; Tổng KTNN bổ nhiệm, bổ nhiệm lại lónh đạo cấp vụ, cấp phũng.
Thực hiện Luật KTNN và cỏc quy định liờn quan, đến nay UBTVQH đó bổ nhiệm 4 Phủ Tổng KTNN; Tổng KTNN đó bổ nhiệm, bổ nhiệm lại hàng trăm cỏn bộ lónh đạo cấp Vụ, cấp phũng và cỏc ngạch kiểm toỏn viờn đỏp ứng yờu cầu phỏt triển của ngành và tiến trớnh cải cỏch hành chỡnh của đất nước. KTNN là lĩnh vực mới ở nước ta, một nghề đũi hỏi trớnh độ chuyờn mún khắt khe và tỡnh chất hoạt động chuyờn nghiệp cao, những năm qua KTNN luún chăm lo xõy dựng đội ngũ cúng chức và kiểm toỏn viờn theo phương chõm: “cúng minh, chỡnh trực, nghệ tinh, tõm sỏng”. Sau 16 năm xõy dựng, từ 60 người khi mới thành lập, đến nay KTNN đó củ đội ngũ hơn 1.500 cỏn bộ, cúng chức, trong đủ gần 80% là kiểm toỏn viờn. Chất lượng đội ngũ
cúng chức khúng ngừng được nõng lờn, số củ trớnh độ đại học trở lờn chiếm 97,5%, trong đủ 100% kiểm toỏn viờn củ trớnh độ đại học trở lờn, nhiều người củ 2 đến 3 văn bằng đại học. Tại thời điểm hiện tại, toàn ngành củ 17% cỏn bộ, cúng chức củ trớnh độ sau và trờn đại học, trong đủ củ 5 giỏo sư, phủ giỏo sư, 14 tiến sĩ, 198 thạc sĩ, nhiều cúng chức, kiểm toỏn viờn đang được đào tạo tiến sĩ, thạc sĩ trong và ngoài nước [19]. Nhớn chung, đội ngũ cúng chức và người lao động củ phẩm chất chỡnh trị và đạo đức, năng lực đỏp ứng yờu cầu nhiệm vụ theo quy định của Luật KTNN. Do yờu cầu hoạt động kiểm toỏn củ tỡnh nghề nghiệp cao, nờn hầu hết cúng chức sau khi được tuyển chọn cúng tỏc tại KTNN đều phải tiếp tục được đào tạo, bồi dưỡng theo chương trớnh riờng của ngành. Theo quy định của Luật KTNN, KTVNN phải thường xuyờn học tập và rốn luyện để nõng cao kiến thức chuyờn mún, kỹ năng và đạo đức nghề nghiệp, thực hiện chương trớnh cập nhật kiến thứ hàng năm theo quy định của Tổng KTNN, bảo đảm củ đủ năng lực, trớnh độ chuyờn mún phữ hợp với nhiệm vụ được giao. Từ năm 2005, KTNN đó huy động nhiều nguồn lực tài chỡnh và hơn 100 chuyờn gia trong và ngoài ngành xõy dưng chương trớnh khung đào tạo cỏc ngạch KTVNN. Hàng năm KTNN đều dành kinh phỡ thỡch đỏng cho kế hoạch đào tạo, bồi dưỡng, cập nhật kiến thức về chuyờn mún, lý luận chỡnh trị, quản lý nhà nước, tin học, ngoại ngữ, hội nhập quốc tế… phữ hợp với yờu cầu năng lực và trớnh độ của từng đối tượng cỏn bộ, kể cả lónh đạo ngành và lónh đạo cấp vụ. Từ khi Luật KTNN củ hiệu lực, hớnh thức đào tạo theo chuyờn đề, đào tạo theo ngạch bậc KTV được tăng cường. Bờn cạnh cỏc khoỏ đào tạo, bồi dưỡng về chuyờn mún, như: Kiểm toỏn hoạt động, kiểm toỏn chuyờn đề, đào tạo để thi và cấp chứng chỉ KTVNN, kỹ năng thực hành kiểm toỏn…, KTNN cũn đẩy mạnh bồi dưỡng kiến thức văn hoỏ và đạo đức nghề nghiệp, lý luận chỡnh trị, kiến thức kinh tế….để từng bước nõng cao chất lượng và phẩm chất đạo đức cỏn bộ, kiểm toỏn viờn. Với sự trợ giửp của một số cơ quan và tổ chức quốc tế, hàng nghớn lượt cỏn bộ, KTV đó tham dự nhiều lớp đào tạo, bồi dưỡng nghiệp vụ, ngoại ngữ, tin học ở nước ngoài hoặc
do chuyờn gia nước ngoài giảng dạy tại Việt Nam. Nhiều cúng chức, KTVNN được đào tạo thạc sĩ, tiến sĩ và tham gia cỏc hội thảo quốc tế, hoạt động nghiờn cứu, khảo sỏt cúng nghệ, phương phỏp kiểm toỏn hiện đại của cỏc quốc gia phỏt triển, tạo tiền đề cho sự phỏt triển và hội nhập quốc tế của KTNN. KTNN cũng đó cử và được cỏc tổ chức quốc tế đào tạo một số giảng viờn củ trớnh độ quốc tế cho INTOSAI, chủ động đào tạo và chọn cử những chuyờn gia giỏi tham gia cỏc nhủm nghiờn cứu về kiểm toỏn múi trường, nhủm kiểm toỏn cúng nợ của ASOSAI. Mặc dữ chi phỡ đào tạo rất tốn kộm nhưng KTNN đó cử 30 kiểm toỏn viờn đầu tiờn tham gia cỏc khoỏ đào tạo và thi lấy Chứng chỉ KTV quốc tế của Hiệp hội Kế toỏn viờn cúng chứng Vương quốc Anh (ACCA), và 10 kiểm toỏn viờn đào tạo và thực hành kiểm toỏn dài hạn theo chương trớnh chuyờn gia kiểm toỏn CCAF tại Canada để làm nũng cốt xõy dựng đội ngũ kiểm toỏn viờn chuyờn nghiệp, củ trớnh độ tiếp cận khu vực và thế giới. KTNN cũng đó cử hàng chục lượt KTV thực tập kiểm toỏn tại Cộng hoà liờn bang Đức, tham gia kiểm toỏn với cỏc tập đoàn kiểm toỏn độc lập lớn trờn thế giới, hoạt động kiểm toỏn nội bộ của Ngõn hàng thế giới (WB), Ngõn hàng phỏt triển Chõu Á (ADB) hoặc kiểm toỏn chung với KTNN Liờn bang Nga để học tập, chia sẻ kinh nghiệp, nõng cao trớnh độ chuyờn mún, tiếp cận cúng nghệ kiểm toỏn hiện đại.