Cơ chế hợp tác LMI được hình thành từ năm 2009 theo sáng kiến của Mỹ, đến nay đã tổ chức được 4 Hội nghị Bộ trưởng và 2 cuộc họp Nhóm công tác, đã hoàn chỉnh và thông qua Tài liệu khái niệm và Chương trình hành ðộng LMI
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu http://www.lrc-tnu.edu.vn/
2011 - 2015, mở ra giai ðoạn mới với các chýõng trình hoạt động và dự án cụ thể cho từng lĩnh vực ưu tiên.
Bên cạnh LMI, các nước cũng đã thành lập cơ chế hợp tác giữa các nước LMI và những người bạn (FLM), với Hội nghị Bộ trưởng FLM lần thứ nhất được tổ chức tháng 7/2011, bao gồm các nước LMI và Úc, Nhật Bản, Hàn Quốc, EU, New Zealand, ADB và WB.
Đến nay, LMI đã và đang triển khai một số sáng kiến và hoạt động hợp tác sau: Hội nghị “Sáng kiến các nước hạ nguồn Mê Công, hợp tác khu vực đáp ứng với hiểm hoạ của bệnh truyền nhiễm” (17-18/6/2010, Hà Nội, Việt Nam).
Kết nghĩa giữa Ủy hội Mê Công và Ủy hội sông Mississippi nhằm tăng cường trao đổi kinh nghiệm và hợp tác giữa hai bên.
Chương trình “Dự báo Mê Công” (Mekong Forecast phát triển từ chương trình DRAGON - Delta Research and Global Observation Network) và các hợp tác môi trường: nhằm xây dựng các trạm quan trắc tự động để theo dõi về biến đổi khí hậu tại khu vực Tiểu vùng.
Chương trình Đào tạo tiếng Anh chuyên ngành cho các cán bộ làm việc trong 4 lĩnh vực hợp tác LMI đã tổ chức 3 khóa tại 3 nước Campuchia, Lào và Việt Nam.
Tham gia Liên minh toàn cầu về Bếp sạch nhằm mục tiêu phát triển sử dụng bếp nấu và nhiên liệu không thải khí độc, nâng cao chất lượng cuộc sống của người dân, đặc biệt là phụ nữ, thúc đẩy thị trường thế giới về các giải pháp nấu năng lượng sạch và hiệu quả, cắt giảm khí thải, góp phần vào nỗ lực ứng phó với biến đổi khí hậu.