Vinamilk có 02 xí nghiệp kho vận tại Hồ Chí Minh và Hà Nội, phụ trách kho bãi và vận chuyển nguyên vật liệu, thành phẩm và 03 văn phòng bán hàng tại Hà Nội, Đà Nẵng và Cần Thơ để phân phối hàng cho 3 miền Bắc, Trung, Nam. Sản phẩm của Vinamilk có mặt trên 650 siêu thị lớn nhỏ trên toàn quốc, đặc biệt là sữa chua, sữa tƣơi và nƣớc trái cây đã có mặt trên các hãng hàng không Việt Nam và quốc tế.
Vinamilk sử dụng cả hai kênh phân phối hiện đại và truyền thống. Kênh phân phối hiện đại thông qua các siêu thị, cửa hàng giới thiệu sản phẩm. Kênh phân phối truyền thống bao gồm các nhà phân phối độc lập và các nhà bán lẻ, đƣa sản phẩm đến ngƣời tiêu dùng. Tuy nhiên, kênh phân phối truyền thống vẫn giữ vai trò quan trọng do chiếm đến 80% tổng doanh thu của Vinamilk. Tính đến tháng 12/2014, Công ty đã có 268 nhà phân phối độc quyền và các nhà phân phối này bán hàng đến hơn 215.000 điểm bán lẻ trên toàn quốc. Về siêu thị, sản phẩm của Vianmilk có mặt ở 650 siêu thị lớn nhỏ trên toàn quốc. Tuy nhiên, hệ thống siêu thị
tại Việt Nam chủ yếu tập trung tại các tỉnh, thành phố lớn và chƣa phát triển mạnh nên siêu thị chỉ đóng góp khoảng 9% doanh số nội địa. Về chuỗi cửa hàng giới thiệu sản phẩm. Đến cuối năm 2014, công ty có 74 cửa hàng trên toàn quốc. Kế hoạch sẽ đạt 110 cửa hàng trong năm 2015 và đến năm 2017 sẽ đạt 500 cửa hàng.
Vinamilk tiếp tục mở rộng và tăng cƣờng mạng lƣới này để có thể phân phối trực tiếp cho khách hàng đặc biệt là ở khu vực nông thôn, nơi tập trung hơn 70% dân số. Khu vực nông thôn đóng vai trò quan trọng cho sự tăng trƣởng doanh thu vƣợt bậc những năm gần đây.