Do chức năng hoạt ựộng của VPđKQSDđ rất phức tạp, trong khi tổ chức và con người lại thiếu, chưa ựược trang bị tốt kỹ năng xử lý công việc, chưa có
biện pháp tắch cực ựể khắc phục hiện tượng chồng chéo, trùng lặp trong công việc, thậm chắ nhiều công ựoạn còn không ựúng theo quy ựịnh. Các tồn tại ở giai ựoạn trước còn quá lớn chưa thể giải quyết trong một thời gian ngắn, nhất là ựối với các giấy chứng nhận quyền sử dụng ựất cấp trước khi có VPđKQSDđ ựến nay hồ sơ không ựầy ựủ do ựó văn phòng gặp rất nhiều khó khăn khi thụ lý các hồ sơ liên quan ựến giấy chứng nhận này, mặt khác do tồn tại những quan hệ ràng buộc, phụ thuộc vào mốt số hoạt ựộng của các ựơn vị khác có liên quan nên VPđKQSDđ không chủ ựộng giải quyết dứt ựiểm các công việc do mình ựảm trách.
Theo quy ựịnh của pháp luật ựất ựai, việc ựăng ký quyền sử dụng ựất lần ựầu ựược áp dụng thi hành từ khi có Luật ựất ựai 1993, hầu hết người sử dụng ựất ựã thực hiện nghĩa vụ ựăng ký quyền sử dụng ựất. đặc biệt ựối với ựất nông nghiệp ựược giao cơ bản ựã ổn ựịnh và ựược cấp giấy chứng nhận nhưng theo Luật ựất ựai 2003 và các văn bản hướng dẫn thi hành Luật thì nội dung hồ sơ ựịa chắnh có nhiều thay ựổi về nội dung so với trước ựây. Vì vậy việc hoàn thiện hồ sơ ựịa chắnh theo quy ựịnh mới hầu như không ựược ựịa phương thực hiện, hồ sơ ựịa chắnh gốc chưa hoàn thiện, ựó là chưa ựề cập ựến tình trạng hồ sơ ựịa chắnh ựã quá lạc hậu, bản ựồ ựịa chắnh và hồ sơ ựịa chắnh không ựược cập nhật ựầy ựủ, công tác quản lý ựất ựai lỏng lẻo, các loại thuế lệ phắ cao, không có dự báo biến ựộng ựất ựai... là nguyên nhân làm cho kế hoạch cấp giấy chứng nhận trên ựịa bàn huyện chưa hoàn thành.
Hệ thống dữ liệu về ựất ựai ựặc biệt là dữ liệu không gian chưa ựầy ựủ, có ựộ chắnh xác không cao và chưa ựược chuẩn hóa một cách trọn vẹn. Trình ựộ tin học của các cán bộ chuyên môn không ựồng ựều, năng lực phát triển phần mềm chưa mạnh. Công nghệ số mặc dù ựược nhắc ựến nhiều nhưng chưa ựược khẳng ựịnh tỏng hệ thống quản lý nhà nước ở nước ta. Do chưa ựược chuyên môn hóa, thiếu thông tin hoặc thông tin biến ựộng ựất ựai không ựược theo dõi, cập nhật thường xuyên hoặc có thông tin nhưng không ựầy ựủ nên còn nhiều hạn chế khi thực hiện chức năng cung cấp thông tin.
Hiện tại việc in giấy chứng nhận tại VPđKQSDđ huyện Giao Thủy ựang thực hiện bằng phần mềm Elis ựể in nội dung, tuy nhiên mức ựộ thành thạo trong
công việc của cán bộ khi tiếp xúc với phần mềm còn hạn chế, ngoài ra trong quá trình in giấy chứng nhận xuất hiện một số lỗi chưa thể khắc phục nên tốn nhiều thời gian và hỏng phôi giấy nhiều gây ảnh hưởng ựến việc cấp giấy chứng nhận quyền sử dụng ựất.
3.4.3.Tổ chức, cơ chế hoạt ựộng
Do ựội ngũ cán bộ chuyên môn từ cấp xã ựến huyện còn mỏng trong khi phải thực hiện cùng một lúc khối lượng công việc nhiều. Hơn nữa cán bộ của VPđKQSDđ nói chung còn trẻ chưa có kinh nghiệm thực tế, chưa ựược tập huấn về chuyên môn nghiệp vụ nhiều nên thời gian ựầu tư thực hiện nhiệm vụ còn gặp nhiều khó khăn. Số lao ựộng hợp ựồng còn nhiều nên sự ràng buộc công việc không mang tắnh ổn ựịnh. Việc nhiều người chưa ựủ kinh nghiệm thực tế dẫn ựến việc tồn ựọng hồ sơ, kéo theo sự trì trệ về tiến ựộ giải quyết là nguyên nhân cơ bản ảnh hưởng ựến tiến ựộ, hiệu quả hoạt ựộng của VPđKQSDđ.