Theo Quyết ựịnh thành lập thì hầu hết các VPđKQSDđ hiện nay ựều có ựầy ựủ chức năng, nhiệm vụ theo hướng dẫn tại Thông tư số 05/2010/TTLT- BTNMT-BNV-BTC ngày 15/3/2010 của liên bộ Tài nguyên và Môi trường, Bộ Nội vụ, Bộ Tài chắnh, tuy nhiên trên thực tế, chức năng, nhiệm vụ của các VPđKQSDđ ở ựịa phương vẫn còn nhiều bất cập.
Phần lớn các VPđKQSDđ các cấp sau khi thành lập ựều ựã ựi vào hoạt ựộng nhưng còn lúng túng, chưa triển khai thực hiện hết các nhiệm vụ ựược giao, chủ yếu mới thực hiện việc tiếp nhận và giải quyết thủ tục cấp giấy chứng nhận
quyền sử dụng ựất cho các ựối tượng thuộc thẩm quyền và thực hiện thống kê, kiểm kê ựất ựai.
Nhiều ựịa phương VPđKQSDđ cấp tỉnh còn có sự chồng chéo hoặc chưa có phân ựịnh rõ chức năng, nhiệm vụ với các ựơn vị khác của Sở gây nên khó khăn, lúng túng, chậm trễ và những bất cập trong triển khai thực hiện như:
+ Chồng chéo chức năng với các phòng chuyên môn của Sở trong việc tiếp nhận, giải quyết thủ tục hành chắnh về ựất ựai, thậm chắ có VPđKQSDđ của Sở còn thực hiện thủ tục biến ựộng ựất ựai của hộ gia ựình và cá nhân.
+ Một số tỉnh còn giao cho VPđKQSDđ một số nhiệm vụ khác như: định giá ựất khi thi hành án, tham gia thực hiện bồi thường giải phóng mặt bằng, lập quy hoạch, kế hoạch sử dụng ựất, dịch vụ tư vấn....
Nhiều VPđKQSDđ cấp huyện ựược thành lập nhưng chưa phân ựịnh rõ hoặc còn chồng chéo chức năng, nhiệm vụ với phòng Tài nguyên và Môi trường. Nhiều ựịa phương lãnh ựạo phòng Tài nguyên và Môi trường coi VPđKQSDđ như bộ máy giúp việc của phòng ựể thực hiện tất cả các công việc quản lý Nhà nước về ựất ựai.
Một số VPđKQSDđ các cấp chưa thực hiện ựúng chức năng xác nhận, chỉnh lý biến ựộng trên Giấy chứng nhận quyền sử dụng ựất: có ựịa phương VPđKQSDđ cấp tỉnh làm thủ tục ựể Lãnh ựạo Sở ký xác nhận, có ựịa phương VPđKQSDđ cấp tỉnh hoặc cấp huyện xác nhận cả những trường hợp thuộc thẩm quyền xác nhận của Sở hoặc Phòng, nguyên nhân có sự lẫn lộn này một phần do quy ựịnh phân cấp chỉnh lý Giấy chứng nhận tại ựiều 57 của Nghị ựịnh số 181/2004/Nđ-CP hiện nay chưa hợp lý.