Công tác xây dựng kế hoạch kiểm soát hàng năm được tập trung thống nhất theo chỉ đạo cấp trung ương căn cứ vào mục tiêu, nhiệm vụ hướng dẫn việc xây dựng kế hoạch kiểm soát tập trung vào đối tượng, ngành, nghề nhất
định, phê duyệt điều chỉnh tỷ lệ đối tượng kiểm soát giữa ngành nghề. Theo kinh nghiệm của cơ quan thuế Anh thông thường kế hoạch kiểm soát thuế được xây dựng theo cơ cấu:
+ 40% do cơ quan thuếtrung ương xây dựng
+ 10% lựa chọn ngẫu nhiên
+ 50% do Cục thuế và Chi cục thuế xây dựng * Về kiểm soát chất lượng kiểm soát
Các nước đều xây dựng hệ thống chuẩn mực kiểm soát để kiểm soát
chất lượng kiểm soát. Hệ thống chuẩn mực từng nước có sự khác biệt nhất
định nhưng đều bao gồm các nhóm chuẩn mực sau:
- Chuẩn mực 1: Kế hoạch kiểm soát
- Chuẩn mực 2: Bằng chứng kiểm soát và thu thập bằng chứng kiểm soát
- Chuẩn mực 3: Kết luận, kiến nghị kiểm soát
- Chuẩn mực 4: Tài liệu làm việc và Báo cáo kiểm soátTheo qui mô và tích chất của từng vụ kiểm soát, cơ quan thuế có thể thành lập các bộ phận riêng chịu trách nhiệm rà soát kết quả kiểm soát theo các chuẩn mực trên
trước khi ban hành quyết định cuối cùng hoặc có thể đưa vào quy trình kiểm soát nội bộ. Ví dụ, tại úc, Malaysia và Trung Quốc, các kiểm soát cao cấp
hoặc trưởng phòng kiểm soát có nhiệm vụ rà soát lại toàn bộ các kết quả kiểm
soát tại cơ sở có liên quan đến giao dịch quốc tế hoặc các vụ việc lớn trước khi gửi kết quả chính thức cho ĐTNT.