Thiết kế mồ
3.2.2. Kết quả truy cập Ngân hàng gen sử dụng trình tự nucleotide gen
cox1 của chủng HTAQT
Kết quả xác nhận trình tự nucleotide gen cox1 của chủng HTAQT, sử dụng chương trình BLAST có trên Ngân hàng gen được trình bày ở bảng 3.2.
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu http://www.lrc-tnu.edu.vn/
Bảng 3.2. Kết quả truy cập Ngân hàng gen sử dụng trình tự nucleotide chuỗi gen
cox1 của chủng HTAQT
Số đăng kí Chuỗi đích truy cập Hệ số Tổng điểm Mức độ so sánh Giá trị E Tỉ lệ tƣơng
đồng
KF214770.1 Haplorchis taichui mitochondrion, complete genome 2789 2789 100% 0.0 99% EF055885.1 Haplorchis taichui cytochrome c oxidase subunit 1 (coxI) gene, partial cds; mitochondrial 678 678 24% 0.0 99% JN809879.1 Haplorchis taichui isolate QT8 cytochrome c oxidase subunit 1 (cox1) gene,
partial cds; mitochondrial 658 658 24% 0.0 99%
JN809878.1 Haplorchis taichui isolate QT12 cytochrome c oxidase subunit 1 (cox1) gene,
partial cds; mitochondrial 658 658 24% 0.0 99%
JN809877.1 Haplorchis taichui isolate QT2 cytochrome c oxidase subunit 1 (cox1) gene,
partial cds; mitochondrial 658 658 24% 0.0 99%
JN809875.1 Haplorchis taichui isolate HG10 cytochrome c oxidase subunit 1 (cox1) gene,
partial cds; mitochondrial 658 658 23% 0.0 99%
JN809874.1 Haplorchis taichui isolate HG1 cytochrome c oxidase subunit 1 (cox1) gene, partial cds; mitochondrial 658 658 23% 0.0 99% JN809872.1 Haplorchis taichui isolate HG3 cytochrome c oxidase subunit 1 (cox1) gene,
partial cds; mitochondrial 658 658 23% 0.0 99%
JN809894.1 Haplorchis taichui isolate QT17 cytochrome c oxidase subunit 1 (cox1) gene,
partial cds; mitochondrial 652 652 24% 0.0 98%
JN809893.1 Haplorchis taichui isolate QT19 cytochrome c oxidase subunit 1 (cox1) gene,
partial cds; mitochondrial 652 652 24% 0.0 98%
JN809909. 1 Haplorchis taichui isolate TH` cytochrome c oxidase subunit 1 (cox1) gene,
partial cds; mitochondrial 636 636 23% 2e-178 98%
JN809906.1 Haplorchis taichui isolate TH8 cytochrome c oxidase subunit 1 (cox1) gene, partial cds; mitochondrial 636 636 23% 2e-178 98% JN809904.1 Haplorchis taichui isolate TH14 cytochrome c oxidase subunit 1 (cox1) gene,
partial cds; mitochondrial 636 636 23% 2e-178 98%
JN809870.1 Haplorchis taichui isolate HG7 cytochrome c oxidase subunit 1 (cox1) gene,
partial cds; mitochondrial 636 636 23% 2e-178 98%
KC404636.1 Haplorchis taichui cytochrom C oxidase subunit I-like (COI) gene, partial
sequence; mitochondrial 608 608 21% 5e-170 99%
Ghi chú: Chương trình sử dụng là BLAST của NCBI (http://www.ncbi.nlm.nih.gov). Dãy số và ký tự bên trái là số đăng ký; ở giữa là tên loài sán lá ruột nhỏ; năm dãy cuối cho biết mức độ chính xác của kết quả theo phân tích sinh-tin học trong chương trình BLAST.
Kết quả trong bảng 3.2 cho thấy, trình tự nucleotide gen cox1 của chủng sán lá ruột nhỏ HTAQT có tỉ lệ tương đồng cao (từ 98%đến 99%), so với gen cox1 của các chủng thuộc loài sán lá ruột nhỏ H. taichui trên thế giới, đã được giải trình tự và đăng kí trong Ngân hàng gen. Điều này chứng tỏ trình tự gen cox1 của chủng HTAQT được chúng tôi thu nhận, chính xác là gen cox1 của loài sán lá ruột nhỏ H. taichui.